RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517294.5

CCDC160-202, Transcript of coiled-coil domain containing 160, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CCDC160, Length 1,790 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC160-202ENST00000517294 CLIP1P30622 1438 aa41.47■■■■■ 4.23
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CCDC160-202ENST00000517294 ABCA8O94911 1581 aa40.42■■■■■ 4.06
CCDC160-202ENST00000517294 TIAM1Q13009 1591 aa40.41■■■■■ 4.06
CCDC160-202ENST00000517294 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
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CCDC160-202ENST00000517294 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.21■■■■■ 4.03
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CCDC160-202ENST00000517294 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP39.55■■■■□ 3.92
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CCDC160-202ENST00000517294 ITGAEP38570 1179 aa39.41■■■■□ 3.9
CCDC160-202ENST00000517294 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP39.39■■■■□ 3.9
CCDC160-202ENST00000517294 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP39.39■■■■□ 3.9
CCDC160-202ENST00000517294 MIA2Q96PC5 1412 aa39.39■■■■□ 3.9
CCDC160-202ENST00000517294 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.38■■■■□ 3.9
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CCDC160-202ENST00000517294 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.36■■■■□ 3.89
CCDC160-202ENST00000517294 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP39.36■■■■□ 3.89
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