RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.65■■□□□ 1.7
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SH3BP2-225ENST00000513069 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BP2-225ENST00000513069 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
SH3BP2-225ENST00000513069 PRXQ9BXM0 1461 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BP2-225ENST00000513069 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.55■■□□□ 1.68
SH3BP2-225ENST00000513069 EEA1Q15075 1411 aa25.48■■□□□ 1.67
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SH3BP2-225ENST00000513069 DISP1Q96F81 1524 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP2-225ENST00000513069 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP2-225ENST00000513069 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP2-225ENST00000513069 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP2-225ENST00000513069 PTPRGP23470 1445 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP2-225ENST00000513069 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP2-225ENST00000513069 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-225ENST00000513069 KIF21BO75037 1637 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-225ENST00000513069 KIAA0556O60303 1618 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-225ENST00000513069 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.16■■□□□ 1.62
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SH3BP2-225ENST00000513069 UACAQ9BZF9 1416 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP2-225ENST00000513069 P3H3Q8IVL6 736 aa25.08■■□□□ 1.61
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SH3BP2-225ENST00000513069 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.07■■□□□ 1.6
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SH3BP2-225ENST00000513069 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.02■■□□□ 1.6
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SH3BP2-225ENST00000513069 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.92■■□□□ 1.58
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SH3BP2-225ENST00000513069 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.89■■□□□ 1.58
SH3BP2-225ENST00000513069 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP2-225ENST00000513069 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP2-225ENST00000513069 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-225ENST00000513069 DIP2BQ9P265 1576 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP2-225ENST00000513069 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP2-225ENST00000513069 ATP10BO94823 1461 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP2-225ENST00000513069 ARID3CA6NKF2 412 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP2-225ENST00000513069 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-225ENST00000513069 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SH3BP2-225ENST00000513069 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
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SH3BP2-225ENST00000513069 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BP2-225ENST00000513069 FMN1Q68DA7 1419 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BP2-225ENST00000513069 KCNH8Q96L42 1107 aa24.66■■□□□ 1.54
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SH3BP2-225ENST00000513069 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.57■■□□□ 1.52
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SH3BP2-225ENST00000513069 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SH3BP2-225ENST00000513069 CEP162Q5TB80 1403 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-225ENST00000513069 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP2-225ENST00000513069 CD109Q6YHK3 1445 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-225ENST00000513069 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BP2-225ENST00000513069 HECW1Q76N89 1606 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BP2-225ENST00000513069 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.47■■□□□ 1.51
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SH3BP2-225ENST00000513069 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP2-225ENST00000513069 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
SH3BP2-225ENST00000513069 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.45■■□□□ 1.5
SH3BP2-225ENST00000513069 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-225ENST00000513069 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.44■■□□□ 1.5
SH3BP2-225ENST00000513069 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.42■■□□□ 1.5
SH3BP2-225ENST00000513069 KDM6BO15054 1643 aa24.4■■□□□ 1.5
SH3BP2-225ENST00000513069 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
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SH3BP2-225ENST00000513069 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.36■■□□□ 1.49
SH3BP2-225ENST00000513069 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
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SH3BP2-225ENST00000513069 KIF14Q15058 1648 aa24.28■■□□□ 1.48
SH3BP2-225ENST00000513069 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.27■■□□□ 1.48
SH3BP2-225ENST00000513069 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.27■■□□□ 1.48
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SH3BP2-225ENST00000513069 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP2-225ENST00000513069 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP2-225ENST00000513069 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.11■■□□□ 1.45
SH3BP2-225ENST00000513069 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-225ENST00000513069 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-225ENST00000513069 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.1■■□□□ 1.45
SH3BP2-225ENST00000513069 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-225ENST00000513069 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-225ENST00000513069 ADGRL1O94910 1474 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-225ENST00000513069 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.07■■□□□ 1.44
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