RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000501011.6

RAB30-AS1-201, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAB30-AS1, Length 607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.58■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SHROOM2Q13796 1616 aa20.56■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-201ENST00000501011 JPH4Q96JJ6 628 aa20.53■□□□□ 0.88
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa20.47■□□□□ 0.87
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.43■□□□□ 0.86
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
RAB30-AS1-201ENST00000501011 IQGAP2Q13576 1575 aa20.36■□□□□ 0.85
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PRXQ9BXM0 1461 aa20.3■□□□□ 0.84
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.28■□□□□ 0.84
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa20.27■□□□□ 0.84
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.27■□□□□ 0.83
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PTPRGP23470 1445 aa20.23■□□□□ 0.83
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EEA1Q15075 1411 aa20.22■□□□□ 0.83
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DISP1Q96F81 1524 aa20.22■□□□□ 0.83
RAB30-AS1-201ENST00000501011 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.22■□□□□ 0.83
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.21■□□□□ 0.83
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.21■□□□□ 0.83
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.18■□□□□ 0.82
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KIAA0556O60303 1618 aa20.16■□□□□ 0.82
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.12■□□□□ 0.81
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GOLGA3Q08378 1498 aa20.09■□□□□ 0.81
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
RAB30-AS1-201ENST00000501011 UACAQ9BZF9 1416 aa20.08■□□□□ 0.8
RAB30-AS1-201ENST00000501011 P3H3Q8IVL6 736 aa20.07■□□□□ 0.8
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.06■□□□□ 0.8
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KIF21BO75037 1637 aa20.06■□□□□ 0.8
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAPKBP1O60336 1514 aa20.06■□□□□ 0.8
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ABCC2Q92887 1545 aa20.05■□□□□ 0.8
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.03■□□□□ 0.8
RAB30-AS1-201ENST00000501011 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.03■□□□□ 0.8
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.01■□□□□ 0.79
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20■□□□□ 0.79
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DIP2BQ9P265 1576 aa19.99■□□□□ 0.79
RAB30-AS1-201ENST00000501011 SAMD9Q5K651 1589 aa19.97■□□□□ 0.79
RAB30-AS1-201ENST00000501011 UBTFP17480 764 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ASXL2Q76L83 1435 aa19.96■□□□□ 0.79
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ABCA8O94911 1581 aa19.95■□□□□ 0.78
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KDM5BQ9UGL1 1544 aa19.95■□□□□ 0.78
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARID3CA6NKF2 412 aa19.92■□□□□ 0.78
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TSPOAP1O95153 1857 aa19.92■□□□□ 0.78
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FHOD3Q2V2M9 1422 aa19.9■□□□□ 0.78
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa19.84■□□□□ 0.77
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EFCAB5A4FU69 1503 aa19.83■□□□□ 0.77
RAB30-AS1-201ENST00000501011 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
RAB30-AS1-201ENST00000501011 WDR7Q9Y4E6 1490 aa19.82■□□□□ 0.76
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GLI2P10070 1586 aa19.82■□□□□ 0.76
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KCNH8Q96L42 1107 aa19.8■□□□□ 0.76
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ATP10BO94823 1461 aa19.79■□□□□ 0.76
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.76■□□□□ 0.75
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa19.75■□□□□ 0.75
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KDM6BO15054 1643 aa19.73■□□□□ 0.75
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CFAP43Q8NDM7 1665 aa19.67■□□□□ 0.74
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FMN1Q68DA7 1419 aa19.67■□□□□ 0.74
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CD109Q6YHK3 1445 aa19.67■□□□□ 0.74
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TEX14Q8IWB6 1497 aa19.65■□□□□ 0.74
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.62■□□□□ 0.73
RAB30-AS1-201ENST00000501011 HECW1Q76N89 1606 aa19.62■□□□□ 0.73
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.6■□□□□ 0.73
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CLIP1P30622 1438 aa19.59■□□□□ 0.73
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ABCA9Q8IUA7 1624 aa19.59■□□□□ 0.73
RAB30-AS1-201ENST00000501011 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa19.55■□□□□ 0.72
RAB30-AS1-201ENST00000501011 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa19.54■□□□□ 0.72
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa19.51■□□□□ 0.71
RAB30-AS1-201ENST00000501011 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.5■□□□□ 0.71
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.49■□□□□ 0.71
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CEP162Q5TB80 1403 aa19.48■□□□□ 0.71
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FYCO1Q9BQS8 1478 aa19.45■□□□□ 0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KIF14Q15058 1648 aa19.44■□□□□ 0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.43■□□□□ 0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARAP3Q8WWN8 1544 aa19.43■□□□□ 0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 NEO1Q92859 1461 aa19.42■□□□□ 0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RAPGEF3O95398 923 aa19.41■□□□□ 0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FANCAO15360 1455 aa19.41■□□□□ 0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PHLDB1Q86UU1 1377 aa19.4■□□□□ 0.7
RAB30-AS1-201ENST00000501011 AKNAQ7Z591 1439 aa19.38■□□□□ 0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 CFAP74Q9C0B2 1584 aa19.38■□□□□ 0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19.38■□□□□ 0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 PLCH2O75038 1416 aa19.36■□□□□ 0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa19.35■□□□□ 0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa19.35■□□□□ 0.69
RAB30-AS1-201ENST00000501011 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ARHGAP5Q13017 1502 aa19.31■□□□□ 0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 RICTORQ6R327 1708 aa19.31■□□□□ 0.68
RAB30-AS1-201ENST00000501011 ADGRL1O94910 1474 aa19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms