RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497483.1

HDAC10-219, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 2

Gene HDAC10, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-219	ENST00000497483	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	42.81	■■■■■ 4.44
HDAC10-219	ENST00000497483	JPH4	Q96JJ6	628 aa		42.81	■■■■■ 4.44
HDAC10-219	ENST00000497483	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		42.81	■■■■■ 4.44
HDAC10-219	ENST00000497483	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		42.76	■■■■■ 4.44
HDAC10-219	ENST00000497483	IQGAP2	Q13576	1575 aa		42.51	■■■■■ 4.4
HDAC10-219	ENST00000497483	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		42.49	■■■■■ 4.39
HDAC10-219	ENST00000497483	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.41	■■■■■ 4.38
HDAC10-219	ENST00000497483	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		42.33	■■■■■ 4.37
HDAC10-219	ENST00000497483	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		42.33	■■■■■ 4.37
HDAC10-219	ENST00000497483	MAPKBP1	O60336	1514 aa		42.3	■■■■■ 4.36
HDAC10-219	ENST00000497483	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		42.26	■■■■■ 4.36
HDAC10-219	ENST00000497483	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		42.25	■■■■■ 4.35
HDAC10-219	ENST00000497483	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		42.24	■■■■■ 4.35
HDAC10-219	ENST00000497483	DISP1	Q96F81	1524 aa		42.23	■■■■■ 4.35
HDAC10-219	ENST00000497483	PTPRG	P23470	1445 aa		42.22	■■■■■ 4.35
HDAC10-219	ENST00000497483	PRX	Q9BXM0	1461 aa		42.2	■■■■■ 4.35
HDAC10-219	ENST00000497483	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	42.16	■■■■■ 4.34
HDAC10-219	ENST00000497483	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.13	■■■■■ 4.34
HDAC10-219	ENST00000497483	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		42.13	■■■■■ 4.34
HDAC10-219	ENST00000497483	DIP2B	Q9P265	1576 aa		42.1	■■■■■ 4.33
HDAC10-219	ENST00000497483	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		42.05	■■■■■ 4.32
HDAC10-219	ENST00000497483	ABCC2	Q92887	1545 aa		42.04	■■■■■ 4.32
HDAC10-219	ENST00000497483	UACA	Q9BZF9	1416 aa		41.97	■■■■■ 4.31
HDAC10-219	ENST00000497483	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	41.94	■■■■■ 4.3
HDAC10-219	ENST00000497483	EEA1	Q15075	1411 aa		41.93	■■■■■ 4.3
HDAC10-219	ENST00000497483	GOLGA3	Q08378	1498 aa		41.92	■■■■■ 4.3
HDAC10-219	ENST00000497483	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		41.91	■■■■■ 4.3
HDAC10-219	ENST00000497483	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		41.85	■■■■■ 4.29
HDAC10-219	ENST00000497483	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		41.84	■■■■■ 4.29
HDAC10-219	ENST00000497483	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		41.8	■■■■■ 4.28
HDAC10-219	ENST00000497483	ASXL2	Q76L83	1435 aa		41.79	■■■■■ 4.28
HDAC10-219	ENST00000497483	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	41.78	■■■■■ 4.28
HDAC10-219	ENST00000497483	GLI2	P10070	1586 aa		41.74	■■■■■ 4.27
HDAC10-219	ENST00000497483	TSPOAP1	O95153	1857 aa		41.72	■■■■■ 4.27
HDAC10-219	ENST00000497483	ABCA8	O94911	1581 aa		41.7	■■■■■ 4.27
HDAC10-219	ENST00000497483	SAMD9	Q5K651	1589 aa		41.65	■■■■■ 4.26
HDAC10-219	ENST00000497483	KIF21B	O75037	1637 aa		41.61	■■■■■ 4.25
HDAC10-219	ENST00000497483	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	41.59	■■■■■ 4.25
HDAC10-219	ENST00000497483	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	41.58	■■■■■ 4.25
HDAC10-219	ENST00000497483	KDM6B	O15054	1643 aa		41.58	■■■■■ 4.25
HDAC10-219	ENST00000497483	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		41.55	■■■■■ 4.24
HDAC10-219	ENST00000497483	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		41.51	■■■■■ 4.24
HDAC10-219	ENST00000497483	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		41.46	■■■■■ 4.23
HDAC10-219	ENST00000497483	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	41.42	■■■■■ 4.22
HDAC10-219	ENST00000497483	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		41.36	■■■■■ 4.21
HDAC10-219	ENST00000497483	P3H3	Q8IVL6	736 aa		41.35	■■■■■ 4.21
HDAC10-219	ENST00000497483	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		41.33	■■■■■ 4.21
HDAC10-219	ENST00000497483	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		41.33	■■■■■ 4.21
HDAC10-219	ENST00000497483	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		41.32	■■■■■ 4.2
HDAC10-219	ENST00000497483	ATP10B	O94823	1461 aa		41.27	■■■■■ 4.2
HDAC10-219	ENST00000497483	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		41.22	■■■■■ 4.19
HDAC10-219	ENST00000497483	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		41.18	■■■■■ 4.18
HDAC10-219	ENST00000497483	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	41.16	■■■■■ 4.18
HDAC10-219	ENST00000497483	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	41.15	■■■■■ 4.18
HDAC10-219	ENST00000497483	CD109	Q6YHK3	1445 aa		41.14	■■■■■ 4.18
HDAC10-219	ENST00000497483	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	41.12	■■■■■ 4.17
HDAC10-219	ENST00000497483	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	41.1	■■■■■ 4.17
HDAC10-219	ENST00000497483	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		41.08	■■■■■ 4.17
HDAC10-219	ENST00000497483	KCNH8	Q96L42	1107 aa		41.08	■■■■■ 4.17
HDAC10-219	ENST00000497483	ARID3C	A6NKF2	412 aa		41.06	■■■■■ 4.16
HDAC10-219	ENST00000497483	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	40.99	■■■■■ 4.15
HDAC10-219	ENST00000497483	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		40.92	■■■■■ 4.14
HDAC10-219	ENST00000497483	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		40.88	■■■■■ 4.13
HDAC10-219	ENST00000497483	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	40.87	■■■■■ 4.13
HDAC10-219	ENST00000497483	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	40.87	■■■■■ 4.13
HDAC10-219	ENST00000497483	FMN1	Q68DA7	1419 aa		40.86	■■■■■ 4.13
HDAC10-219	ENST00000497483	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		40.85	■■■■■ 4.13
HDAC10-219	ENST00000497483	HECW1	Q76N89	1606 aa		40.82	■■■■■ 4.13
HDAC10-219	ENST00000497483	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		40.8	■■■■■ 4.12
HDAC10-219	ENST00000497483	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		40.79	■■■■■ 4.12
HDAC10-219	ENST00000497483	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	40.77	■■■■■ 4.12
HDAC10-219	ENST00000497483	NEO1	Q92859	1461 aa		40.77	■■■■■ 4.12
HDAC10-219	ENST00000497483	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		40.75	■■■■■ 4.11
HDAC10-219	ENST00000497483	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	40.7	■■■■■ 4.11	1e-6	■□□□□ 10.3
HDAC10-219	ENST00000497483	ADGRL1	O94910	1474 aa		40.7	■■■■■ 4.11
HDAC10-219	ENST00000497483	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		40.67	■■■■■ 4.1
HDAC10-219	ENST00000497483	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		40.65	■■■■■ 4.1
HDAC10-219	ENST00000497483	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		40.61	■■■■■ 4.09
HDAC10-219	ENST00000497483	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		40.58	■■■■■ 4.09
HDAC10-219	ENST00000497483	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	40.52	■■■■■ 4.08
HDAC10-219	ENST00000497483	FANCA	O15360	1455 aa		40.52	■■■■■ 4.08
HDAC10-219	ENST00000497483	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.5	■■■■■ 4.07
HDAC10-219	ENST00000497483	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	40.47	■■■■■ 4.07
HDAC10-219	ENST00000497483	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		40.47	■■■■■ 4.07
HDAC10-219	ENST00000497483	KIF14	Q15058	1648 aa		40.46	■■■■■ 4.07
HDAC10-219	ENST00000497483	AKNA	Q7Z591	1439 aa		40.46	■■■■■ 4.07
HDAC10-219	ENST00000497483	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		40.46	■■■■■ 4.07
HDAC10-219	ENST00000497483	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	40.45	■■■■■ 4.07
HDAC10-219	ENST00000497483	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	40.43	■■■■■ 4.06
HDAC10-219	ENST00000497483	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		40.43	■■■■■ 4.06
HDAC10-219	ENST00000497483	RAPGEF3	O95398	923 aa		40.42	■■■■■ 4.06
HDAC10-219	ENST00000497483	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	40.42	■■■■■ 4.06
HDAC10-219	ENST00000497483	CLIP1	P30622	1438 aa		40.42	■■■■■ 4.06
HDAC10-219	ENST00000497483	PLCH2	O75038	1416 aa		40.41	■■■■■ 4.06
HDAC10-219	ENST00000497483	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		40.39	■■■■■ 4.06
HDAC10-219	ENST00000497483	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		40.37	■■■■■ 4.05
HDAC10-219	ENST00000497483	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		40.36	■■■■■ 4.05
HDAC10-219	ENST00000497483	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		40.23	■■■■■ 4.03
HDAC10-219	ENST00000497483	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		40.22	■■■■■ 4.03
HDAC10-219	ENST00000497483	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		40.2	■■■■■ 4.03

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