RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496465.1

TM2D1-211, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TM2D1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-211ENST00000496465 JPH4Q96JJ6 628 aa31.54■■■□□ 2.64
TM2D1-211ENST00000496465 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
TM2D1-211ENST00000496465 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.45■■■□□ 2.63
TM2D1-211ENST00000496465 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.43■■■□□ 2.62
TM2D1-211ENST00000496465 IQGAP2Q13576 1575 aa31.2■■■□□ 2.58
TM2D1-211ENST00000496465 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.19■■■□□ 2.58
TM2D1-211ENST00000496465 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.18■■■□□ 2.58
TM2D1-211ENST00000496465 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.16■■■□□ 2.58
TM2D1-211ENST00000496465 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.11■■■□□ 2.57
TM2D1-211ENST00000496465 MAPKBP1O60336 1514 aa31.09■■■□□ 2.57
TM2D1-211ENST00000496465 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.09■■■□□ 2.57
TM2D1-211ENST00000496465 PTPRGP23470 1445 aa31.07■■■□□ 2.57
TM2D1-211ENST00000496465 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.05■■■□□ 2.56
TM2D1-211ENST00000496465 DISP1Q96F81 1524 aa31.03■■■□□ 2.56
TM2D1-211ENST00000496465 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.03■■■□□ 2.56
TM2D1-211ENST00000496465 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.01■■■□□ 2.55
TM2D1-211ENST00000496465 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.99■■■□□ 2.55
TM2D1-211ENST00000496465 PRXQ9BXM0 1461 aa30.95■■■□□ 2.55
TM2D1-211ENST00000496465 DIP2BQ9P265 1576 aa30.95■■■□□ 2.54
TM2D1-211ENST00000496465 KIAA0556O60303 1618 aa30.91■■■□□ 2.54
TM2D1-211ENST00000496465 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.91■■■□□ 2.54
TM2D1-211ENST00000496465 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
TM2D1-211ENST00000496465 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.9■■■□□ 2.54
TM2D1-211ENST00000496465 ABCC2Q92887 1545 aa30.9■■■□□ 2.54
TM2D1-211ENST00000496465 UACAQ9BZF9 1416 aa30.86■■■□□ 2.53
TM2D1-211ENST00000496465 GOLGA3Q08378 1498 aa30.78■■■□□ 2.52
TM2D1-211ENST00000496465 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.75■■■□□ 2.51
TM2D1-211ENST00000496465 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.75■■■□□ 2.51
TM2D1-211ENST00000496465 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.75■■■□□ 2.51
TM2D1-211ENST00000496465 ASXL2Q76L83 1435 aa30.74■■■□□ 2.51
TM2D1-211ENST00000496465 TSPOAP1O95153 1857 aa30.74■■■□□ 2.51
TM2D1-211ENST00000496465 EEA1Q15075 1411 aa30.72■■■□□ 2.51
TM2D1-211ENST00000496465 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.69■■■□□ 2.5
TM2D1-211ENST00000496465 GLI2P10070 1586 aa30.69■■■□□ 2.5
TM2D1-211ENST00000496465 ABCA8O94911 1581 aa30.62■■■□□ 2.49
TM2D1-211ENST00000496465 KDM6BO15054 1643 aa30.59■■■□□ 2.49
TM2D1-211ENST00000496465 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
TM2D1-211ENST00000496465 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.49
TM2D1-211ENST00000496465 SAMD9Q5K651 1589 aa30.54■■■□□ 2.48
TM2D1-211ENST00000496465 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.54■■■□□ 2.48
TM2D1-211ENST00000496465 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.5■■■□□ 2.47
TM2D1-211ENST00000496465 KIF21BO75037 1637 aa30.47■■■□□ 2.47
TM2D1-211ENST00000496465 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
TM2D1-211ENST00000496465 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
TM2D1-211ENST00000496465 P3H3Q8IVL6 736 aa30.45■■■□□ 2.47
TM2D1-211ENST00000496465 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.43■■■□□ 2.46
TM2D1-211ENST00000496465 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.38■■■□□ 2.45
TM2D1-211ENST00000496465 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.36■■■□□ 2.45
TM2D1-211ENST00000496465 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.35■■■□□ 2.45
TM2D1-211ENST00000496465 ATP10BO94823 1461 aa30.34■■■□□ 2.45
TM2D1-211ENST00000496465 KCNH8Q96L42 1107 aa30.3■■■□□ 2.44
TM2D1-211ENST00000496465 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
TM2D1-211ENST00000496465 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.28■■■□□ 2.44
TM2D1-211ENST00000496465 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.27■■■□□ 2.44
TM2D1-211ENST00000496465 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
TM2D1-211ENST00000496465 CD109Q6YHK3 1445 aa30.27■■■□□ 2.44
TM2D1-211ENST00000496465 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.26■■■□□ 2.43
TM2D1-211ENST00000496465 ARID3CA6NKF2 412 aa30.24■■■□□ 2.43
TM2D1-211ENST00000496465 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
TM2D1-211ENST00000496465 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.18■■■□□ 2.42
TM2D1-211ENST00000496465 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
TM2D1-211ENST00000496465 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.12■■■□□ 2.41
TM2D1-211ENST00000496465 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
TM2D1-211ENST00000496465 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
TM2D1-211ENST00000496465 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.08■■■□□ 2.41
TM2D1-211ENST00000496465 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.05■■■□□ 2.4
TM2D1-211ENST00000496465 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.02■■■□□ 2.4
TM2D1-211ENST00000496465 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.01■■■□□ 2.39
TM2D1-211ENST00000496465 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30■■■□□ 2.39
TM2D1-211ENST00000496465 FMN1Q68DA7 1419 aa29.98■■■□□ 2.39
TM2D1-211ENST00000496465 ADGRL1O94910 1474 aa29.97■■■□□ 2.39
TM2D1-211ENST00000496465 NEO1Q92859 1461 aa29.96■■■□□ 2.39
TM2D1-211ENST00000496465 HECW1Q76N89 1606 aa29.93■■■□□ 2.38
TM2D1-211ENST00000496465 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
TM2D1-211ENST00000496465 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.9■■■□□ 2.38
TM2D1-211ENST00000496465 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.86■■■□□ 2.37
TM2D1-211ENST00000496465 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.82■■■□□ 2.36
TM2D1-211ENST00000496465 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.81■■■□□ 2.36
TM2D1-211ENST00000496465 RAPGEF3O95398 923 aa29.8■■■□□ 2.36
TM2D1-211ENST00000496465 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.79■■■□□ 2.36
TM2D1-211ENST00000496465 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
TM2D1-211ENST00000496465 FANCAO15360 1455 aa29.79■■■□□ 2.36
TM2D1-211ENST00000496465 AKNAQ7Z591 1439 aa29.77■■■□□ 2.36
TM2D1-211ENST00000496465 RICTORQ6R327 1708 aa29.76■■■□□ 2.35
TM2D1-211ENST00000496465 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
TM2D1-211ENST00000496465 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
TM2D1-211ENST00000496465 PLCH2O75038 1416 aa29.71■■■□□ 2.35
TM2D1-211ENST00000496465 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.7■■■□□ 2.34
TM2D1-211ENST00000496465 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.69■■■□□ 2.34
TM2D1-211ENST00000496465 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
TM2D1-211ENST00000496465 KIF14Q15058 1648 aa29.68■■■□□ 2.34
TM2D1-211ENST00000496465 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
TM2D1-211ENST00000496465 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.64■■■□□ 2.34
TM2D1-211ENST00000496465 CLIP1P30622 1438 aa29.63■■■□□ 2.33
TM2D1-211ENST00000496465 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.63■■■□□ 2.33
TM2D1-211ENST00000496465 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.62■■■□□ 2.33
TM2D1-211ENST00000496465 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.6■■■□□ 2.33
TM2D1-211ENST00000496465 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.6■■■□□ 2.33
TM2D1-211ENST00000496465 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.57■■■□□ 2.32
TM2D1-211ENST00000496465 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms