RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496269.1

PCOLCE-210, Transcript of procollagen C-endopeptidase enhancer, humanhuman

TSL 2

Gene PCOLCE, Length 995 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE-210ENST00000496269 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.7■■■■□ 3.63
PCOLCE-210ENST00000496269 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
PCOLCE-210ENST00000496269 JPH4Q96JJ6 628 aa37.62■■■■□ 3.61
PCOLCE-210ENST00000496269 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.58■■■■□ 3.61
PCOLCE-210ENST00000496269 IQGAP2Q13576 1575 aa37.48■■■■□ 3.59
PCOLCE-210ENST00000496269 PRXQ9BXM0 1461 aa37.47■■■■□ 3.59
PCOLCE-210ENST00000496269 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.37■■■■□ 3.57
PCOLCE-210ENST00000496269 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.31■■■■□ 3.56
PCOLCE-210ENST00000496269 EEA1Q15075 1411 aa37.28■■■■□ 3.56
PCOLCE-210ENST00000496269 DISP1Q96F81 1524 aa37.28■■■■□ 3.56
PCOLCE-210ENST00000496269 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.28■■■■□ 3.56
PCOLCE-210ENST00000496269 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.23■■■■□ 3.55
PCOLCE-210ENST00000496269 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.21■■■■□ 3.55
PCOLCE-210ENST00000496269 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.19■■■■□ 3.54
PCOLCE-210ENST00000496269 KIAA0556O60303 1618 aa37.17■■■■□ 3.54
PCOLCE-210ENST00000496269 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.15■■■■□ 3.54
PCOLCE-210ENST00000496269 PTPRGP23470 1445 aa37.1■■■■□ 3.53
PCOLCE-210ENST00000496269 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.08■■■■□ 3.53
PCOLCE-210ENST00000496269 KIF21BO75037 1637 aa37.04■■■■□ 3.52
PCOLCE-210ENST00000496269 MAPKBP1O60336 1514 aa37■■■■□ 3.51
PCOLCE-210ENST00000496269 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.98■■■■□ 3.51
PCOLCE-210ENST00000496269 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.96■■■■□ 3.51
PCOLCE-210ENST00000496269 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
PCOLCE-210ENST00000496269 GOLGA3Q08378 1498 aa36.95■■■■□ 3.51
PCOLCE-210ENST00000496269 ABCC2Q92887 1545 aa36.91■■■■□ 3.5
PCOLCE-210ENST00000496269 UACAQ9BZF9 1416 aa36.91■■■■□ 3.5
PCOLCE-210ENST00000496269 SAMD9Q5K651 1589 aa36.89■■■■□ 3.5
PCOLCE-210ENST00000496269 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
PCOLCE-210ENST00000496269 DIP2BQ9P265 1576 aa36.83■■■■□ 3.49
PCOLCE-210ENST00000496269 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.82■■■■□ 3.48
PCOLCE-210ENST00000496269 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.81■■■■□ 3.48
PCOLCE-210ENST00000496269 ABCA8O94911 1581 aa36.8■■■■□ 3.48
PCOLCE-210ENST00000496269 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.8■■■■□ 3.48
PCOLCE-210ENST00000496269 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.76■■■■□ 3.48
PCOLCE-210ENST00000496269 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
PCOLCE-210ENST00000496269 ASXL2Q76L83 1435 aa36.66■■■■□ 3.46
PCOLCE-210ENST00000496269 P3H3Q8IVL6 736 aa36.6■■■■□ 3.45
PCOLCE-210ENST00000496269 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.59■■■■□ 3.45
PCOLCE-210ENST00000496269 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.59■■■■□ 3.45
PCOLCE-210ENST00000496269 GLI2P10070 1586 aa36.57■■■■□ 3.44
PCOLCE-210ENST00000496269 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.53■■■■□ 3.44
PCOLCE-210ENST00000496269 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.52■■■■□ 3.44
PCOLCE-210ENST00000496269 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
PCOLCE-210ENST00000496269 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
PCOLCE-210ENST00000496269 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.46■■■■□ 3.43
PCOLCE-210ENST00000496269 TSPOAP1O95153 1857 aa36.45■■■■□ 3.43
PCOLCE-210ENST00000496269 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.45■■■■□ 3.43
PCOLCE-210ENST00000496269 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
PCOLCE-210ENST00000496269 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
PCOLCE-210ENST00000496269 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.42■■■■□ 3.42
PCOLCE-210ENST00000496269 ATP10BO94823 1461 aa36.42■■■■□ 3.42
PCOLCE-210ENST00000496269 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.39■■■■□ 3.42
PCOLCE-210ENST00000496269 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
PCOLCE-210ENST00000496269 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.25■■■■□ 3.39
PCOLCE-210ENST00000496269 ARID3CA6NKF2 412 aa36.24■■■■□ 3.39
PCOLCE-210ENST00000496269 KDM6BO15054 1643 aa36.22■■■■□ 3.39
PCOLCE-210ENST00000496269 FMN1Q68DA7 1419 aa36.17■■■■□ 3.38
PCOLCE-210ENST00000496269 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.14■■■■□ 3.38
PCOLCE-210ENST00000496269 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.12■■■■□ 3.37
PCOLCE-210ENST00000496269 HECW1Q76N89 1606 aa36.11■■■■□ 3.37
PCOLCE-210ENST00000496269 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.11■■■■□ 3.37
PCOLCE-210ENST00000496269 KCNH8Q96L42 1107 aa36.1■■■■□ 3.37
PCOLCE-210ENST00000496269 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
PCOLCE-210ENST00000496269 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.08■■■■□ 3.37
PCOLCE-210ENST00000496269 CD109Q6YHK3 1445 aa36.08■■■■□ 3.37
PCOLCE-210ENST00000496269 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
PCOLCE-210ENST00000496269 CLIP1P30622 1438 aa36■■■■□ 3.35
PCOLCE-210ENST00000496269 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
PCOLCE-210ENST00000496269 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
PCOLCE-210ENST00000496269 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
PCOLCE-210ENST00000496269 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.92■■■■□ 3.34
PCOLCE-210ENST00000496269 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.9■■■■□ 3.34
PCOLCE-210ENST00000496269 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.89■■■■□ 3.34
PCOLCE-210ENST00000496269 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.89■■■■□ 3.34
PCOLCE-210ENST00000496269 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.84■■■■□ 3.33
PCOLCE-210ENST00000496269 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.82■■■■□ 3.32
PCOLCE-210ENST00000496269 CEP162Q5TB80 1403 aa35.82■■■■□ 3.32
PCOLCE-210ENST00000496269 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.79■■■■□ 3.32
PCOLCE-210ENST00000496269 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.78■■■■□ 3.32
PCOLCE-210ENST00000496269 KIF14Q15058 1648 aa35.78■■■■□ 3.32
PCOLCE-210ENST00000496269 NEO1Q92859 1461 aa35.78■■■■□ 3.32
PCOLCE-210ENST00000496269 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
PCOLCE-210ENST00000496269 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.72■■■■□ 3.31
PCOLCE-210ENST00000496269 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.71■■■■□ 3.31
PCOLCE-210ENST00000496269 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.68■■■■□ 3.3
PCOLCE-210ENST00000496269 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.68■■■■□ 3.3
PCOLCE-210ENST00000496269 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.66■■■■□ 3.3
PCOLCE-210ENST00000496269 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
PCOLCE-210ENST00000496269 FANCAO15360 1455 aa35.63■■■■□ 3.29
PCOLCE-210ENST00000496269 PLCH2O75038 1416 aa35.62■■■■□ 3.29
PCOLCE-210ENST00000496269 RICTORQ6R327 1708 aa35.6■■■■□ 3.29
PCOLCE-210ENST00000496269 AKNAQ7Z591 1439 aa35.58■■■■□ 3.29
PCOLCE-210ENST00000496269 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.52■■■■□ 3.28
PCOLCE-210ENST00000496269 PREX2Q70Z35 1606 aa35.5■■■■□ 3.27
PCOLCE-210ENST00000496269 RAPGEF3O95398 923 aa35.49■■■■□ 3.27
PCOLCE-210ENST00000496269 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
PCOLCE-210ENST00000496269 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.48■■■■□ 3.27
PCOLCE-210ENST00000496269 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.46■■■■□ 3.27
PCOLCE-210ENST00000496269 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.44■■■■□ 3.26
PCOLCE-210ENST00000496269 ADGRL1O94910 1474 aa35.43■■■■□ 3.26
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