RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496269.1

PCOLCE-210, Transcript of procollagen C-endopeptidase enhancer, humanhuman

TSL 2

Gene PCOLCE, Length 995 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE-210ENST00000496269 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.49■■■■■ 6.31
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PCOLCE-210ENST00000496269 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.39■■■■■ 4.86
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PCOLCE-210ENST00000496269 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.52■■■■■ 4.72
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PCOLCE-210ENST00000496269 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.81■■■■■ 4.44
PCOLCE-210ENST00000496269 SMARCA4P51532 1647 aa42.36■■■■■ 4.37
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PCOLCE-210ENST00000496269 NCAPD3P42695 1498 aa42.14■■■■■ 4.34
PCOLCE-210ENST00000496269 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.14■■■■■ 4.34
PCOLCE-210ENST00000496269 SMARCA2P51531 1590 aa42.05■■■■■ 4.32
PCOLCE-210ENST00000496269 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.01■■■■■ 4.32
PCOLCE-210ENST00000496269 PEG3Q9GZU2 1588 aa42■■■■■ 4.31
PCOLCE-210ENST00000496269 HMGXB3Q12766 1538 aa41.96■■■■■ 4.31
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PCOLCE-210ENST00000496269 ERCC6Q03468 1493 aa40.97■■■■■ 4.15
PCOLCE-210ENST00000496269 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.84■■■■■ 4.13
PCOLCE-210ENST00000496269 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.78■■■■■ 4.12
PCOLCE-210ENST00000496269 CUX2O14529 1486 aa40.74■■■■■ 4.11
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PCOLCE-210ENST00000496269 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.57■■■■■ 4.08
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PCOLCE-210ENST00000496269 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.39■■■■■ 4.06
PCOLCE-210ENST00000496269 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.37■■■■■ 4.05
PCOLCE-210ENST00000496269 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.35■■■■■ 4.05
PCOLCE-210ENST00000496269 WDR62O43379 1518 aa40.32■■■■■ 4.04
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PCOLCE-210ENST00000496269 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.65■■■■□ 3.94
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PCOLCE-210ENST00000496269 TOP2BQ02880 1626 aa39.03■■■■□ 3.84
PCOLCE-210ENST00000496269 SYNJ1O43426 1573 aa39.03■■■■□ 3.84
PCOLCE-210ENST00000496269 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.99■■■■□ 3.83
PCOLCE-210ENST00000496269 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.96■■■■□ 3.83
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PCOLCE-210ENST00000496269 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.85■■■■□ 3.81
PCOLCE-210ENST00000496269 OSCARQ8IYS5 282 aa38.85■■■■□ 3.81
PCOLCE-210ENST00000496269 PBRM1Q86U86 1689 aa38.8■■■■□ 3.8
PCOLCE-210ENST00000496269 GRIN2BQ13224 1484 aa38.77■■■■□ 3.8
PCOLCE-210ENST00000496269 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.77■■■■□ 3.8
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PCOLCE-210ENST00000496269 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.71■■■■□ 3.79
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PCOLCE-210ENST00000496269 FBLN2P98095 1184 aa38.48■■■■□ 3.75
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PCOLCE-210ENST00000496269 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.46■■■■□ 3.75
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PCOLCE-210ENST00000496269 ADAMTS12P58397 1594 aa38.46■■■■□ 3.75
PCOLCE-210ENST00000496269 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.44■■■■□ 3.74
PCOLCE-210ENST00000496269 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.43■■■■□ 3.74
PCOLCE-210ENST00000496269 ARHGEF11O15085 1522 aa38.4■■■■□ 3.74
PCOLCE-210ENST00000496269 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.38■■■■□ 3.73
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PCOLCE-210ENST00000496269 CEP170Q5SW79 1584 aa38.19■■■■□ 3.7
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PCOLCE-210ENST00000496269 CUL7Q14999 1698 aa38.06■■■■□ 3.68
PCOLCE-210ENST00000496269 SHROOM2Q13796 1616 aa37.99■■■■□ 3.67
PCOLCE-210ENST00000496269 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.92■■■■□ 3.66
PCOLCE-210ENST00000496269 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.89■■■■□ 3.66
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PCOLCE-210ENST00000496269 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.8■■■■□ 3.64
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