RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494546.1

CBX4-203, Transcript of chromobox 4, humanhuman

TSL 3

Gene CBX4, Length 432 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX4-203ENST00000494546 JPH4Q96JJ6 628 aa56.78■■■■■ 6.68
CBX4-203ENST00000494546 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP56.73■■■■■ 6.67
CBX4-203ENST00000494546 TRHP20396 242 aaPredicted RBP56.64■■■■■ 6.66
CBX4-203ENST00000494546 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa56.62■■■■■ 6.65
CBX4-203ENST00000494546 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa56.36■■■■■ 6.61
CBX4-203ENST00000494546 IQGAP2Q13576 1575 aa56.21■■■■■ 6.59
CBX4-203ENST00000494546 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa56.06■■■■■ 6.57
CBX4-203ENST00000494546 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP55.98■■■■■ 6.55
CBX4-203ENST00000494546 PRXQ9BXM0 1461 aa55.97■■■■■ 6.55
CBX4-203ENST00000494546 PTPRGP23470 1445 aa55.97■■■■■ 6.55
CBX4-203ENST00000494546 TNIKQ9UKE5 1360 aa55.92■■■■■ 6.54
CBX4-203ENST00000494546 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP55.92■■■■■ 6.54
CBX4-203ENST00000494546 ADCY10Q96PN6 1610 aa55.9■■■■■ 6.54
CBX4-203ENST00000494546 UGGT2Q9NYU1 1516 aa55.87■■■■■ 6.53
CBX4-203ENST00000494546 DISP1Q96F81 1524 aa55.86■■■■■ 6.53
CBX4-203ENST00000494546 CSRNP3Q8WYN3 585 aa55.83■■■■■ 6.53
CBX4-203ENST00000494546 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa55.8■■■■■ 6.52
CBX4-203ENST00000494546 EEA1Q15075 1411 aa55.7■■■■■ 6.51
CBX4-203ENST00000494546 KIAA0556O60303 1618 aa55.68■■■■■ 6.5
CBX4-203ENST00000494546 MAPKBP1O60336 1514 aa55.66■■■■■ 6.5
CBX4-203ENST00000494546 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP55.61■■■■■ 6.49
CBX4-203ENST00000494546 CHIC1Q5VXU3 224 aa55.59■■■■■ 6.49
CBX4-203ENST00000494546 KIF13AQ9H1H9 1805 aa55.56■■■■■ 6.49
CBX4-203ENST00000494546 UACAQ9BZF9 1416 aa55.55■■■■■ 6.48
CBX4-203ENST00000494546 GOLGA3Q08378 1498 aa55.52■■■■■ 6.48
CBX4-203ENST00000494546 ABCC10Q5T3U5 1492 aa55.52■■■■■ 6.48
CBX4-203ENST00000494546 ABCC2Q92887 1545 aa55.51■■■■■ 6.48
CBX4-203ENST00000494546 FAM69CQ0P6D2 419 aa55.51■■■■■ 6.48
CBX4-203ENST00000494546 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa55.49■■■■■ 6.47
CBX4-203ENST00000494546 DIP2BQ9P265 1576 aa55.4■■■■■ 6.46
CBX4-203ENST00000494546 ASXL2Q76L83 1435 aa55.26■■■■■ 6.44
CBX4-203ENST00000494546 PLB1Q6P1J6 1458 aa55.24■■■■■ 6.43
CBX4-203ENST00000494546 KDM5BQ9UGL1 1544 aa55.24■■■■■ 6.43
CBX4-203ENST00000494546 P3H3Q8IVL6 736 aa55.22■■■■■ 6.43
CBX4-203ENST00000494546 KIF21BO75037 1637 aa55.17■■■■■ 6.42
CBX4-203ENST00000494546 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP55.13■■■■■ 6.42
CBX4-203ENST00000494546 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP55.1■■■■■ 6.41
CBX4-203ENST00000494546 ABCA8O94911 1581 aa55.1■■■■■ 6.41
CBX4-203ENST00000494546 SAMD9Q5K651 1589 aa55.06■■■■■ 6.41
CBX4-203ENST00000494546 EHMT2Q96KQ7 1210 aa55■■■■■ 6.4
CBX4-203ENST00000494546 TSPOAP1O95153 1857 aa54.98■■■■■ 6.39
CBX4-203ENST00000494546 GLI2P10070 1586 aa54.94■■■■■ 6.39
CBX4-203ENST00000494546 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP54.91■■■■■ 6.38
CBX4-203ENST00000494546 UBTFP17480 764 aaKnown RBP54.86■■■■■ 6.37
CBX4-203ENST00000494546 WDR7Q9Y4E6 1490 aa54.86■■■■■ 6.37
CBX4-203ENST00000494546 ARID3CA6NKF2 412 aa54.81■■■■■ 6.36
CBX4-203ENST00000494546 FHOD3Q2V2M9 1422 aa54.8■■■■■ 6.36
CBX4-203ENST00000494546 KDM6BO15054 1643 aa54.71■■■■■ 6.35
CBX4-203ENST00000494546 EFCAB5A4FU69 1503 aa54.7■■■■■ 6.35
CBX4-203ENST00000494546 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa54.7■■■■■ 6.35
CBX4-203ENST00000494546 ATP10BO94823 1461 aa54.68■■■■■ 6.34
CBX4-203ENST00000494546 KCNH8Q96L42 1107 aa54.68■■■■■ 6.34
CBX4-203ENST00000494546 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP54.68■■■■■ 6.34
CBX4-203ENST00000494546 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa54.67■■■■■ 6.34
CBX4-203ENST00000494546 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP54.53■■■■■ 6.32
CBX4-203ENST00000494546 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP54.53■■■■■ 6.32
CBX4-203ENST00000494546 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP54.52■■■■■ 6.32
CBX4-203ENST00000494546 TEX14Q8IWB6 1497 aa54.5■■■■■ 6.32
CBX4-203ENST00000494546 CD109Q6YHK3 1445 aa54.44■■■■■ 6.31
CBX4-203ENST00000494546 CFAP43Q8NDM7 1665 aa54.4■■■■■ 6.3
CBX4-203ENST00000494546 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa54.38■■■■■ 6.3
CBX4-203ENST00000494546 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa54.32■■■■■ 6.29
CBX4-203ENST00000494546 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP54.29■■■■■ 6.28
CBX4-203ENST00000494546 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP54.27■■■■■ 6.28
CBX4-203ENST00000494546 FMN1Q68DA7 1419 aa54.24■■■■■ 6.27
CBX4-203ENST00000494546 PLEKHD1A6NEE1 506 aa54.2■■■■■ 6.27
CBX4-203ENST00000494546 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP54.17■■■■■ 6.26
CBX4-203ENST00000494546 ABCA9Q8IUA7 1624 aa54.17■■■■■ 6.26
CBX4-203ENST00000494546 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP54.09■■■■■ 6.25
CBX4-203ENST00000494546 HECW1Q76N89 1606 aa54.04■■■■■ 6.24
CBX4-203ENST00000494546 ARAP3Q8WWN8 1544 aa53.87■■■■■ 6.21
CBX4-203ENST00000494546 CLIP1P30622 1438 aa53.86■■■■■ 6.21
CBX4-203ENST00000494546 PHLDB1Q86UU1 1377 aa53.86■■■■■ 6.21
CBX4-203ENST00000494546 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP53.84■■■■■ 6.212e-9■■■■□ 20.4
CBX4-203ENST00000494546 NEO1Q92859 1461 aa53.82■■■■■ 6.21
CBX4-203ENST00000494546 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP53.81■■■■■ 6.2
CBX4-203ENST00000494546 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa53.8■■■■■ 6.2
CBX4-203ENST00000494546 TTC37Q6PGP7 1564 aa53.76■■■■■ 6.2
CBX4-203ENST00000494546 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa53.75■■■■■ 6.19
CBX4-203ENST00000494546 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP53.74■■■■■ 6.19
CBX4-203ENST00000494546 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa53.69■■■■■ 6.19
CBX4-203ENST00000494546 RAPGEF3O95398 923 aa53.66■■■■■ 6.18
CBX4-203ENST00000494546 FANCAO15360 1455 aa53.64■■■■■ 6.18
CBX4-203ENST00000494546 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP53.62■■■■■ 6.17
CBX4-203ENST00000494546 CCDC18Q5T9S5 1454 aa53.59■■■■■ 6.17
CBX4-203ENST00000494546 AKNAQ7Z591 1439 aa53.59■■■■■ 6.17
CBX4-203ENST00000494546 ADGRL1O94910 1474 aa53.58■■■■■ 6.17
CBX4-203ENST00000494546 FYCO1Q9BQS8 1478 aa53.57■■■■■ 6.17
CBX4-203ENST00000494546 CFAP74Q9C0B2 1584 aa53.56■■■■■ 6.16
CBX4-203ENST00000494546 KIF14Q15058 1648 aa53.54■■■■■ 6.16
CBX4-203ENST00000494546 PLCH2O75038 1416 aa53.52■■■■■ 6.16
CBX4-203ENST00000494546 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa53.48■■■■■ 6.15
CBX4-203ENST00000494546 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP53.47■■■■■ 6.15
CBX4-203ENST00000494546 CEP162Q5TB80 1403 aa53.46■■■■■ 6.15
CBX4-203ENST00000494546 MYO5CQ9NQX4 1742 aa53.41■■■■■ 6.14
CBX4-203ENST00000494546 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa53.38■■■■■ 6.14
CBX4-203ENST00000494546 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa53.36■■■■■ 6.13
CBX4-203ENST00000494546 RICTORQ6R327 1708 aa53.34■■■■■ 6.13
CBX4-203ENST00000494546 SCAPERQ9BY12 1400 aa53.29■■■■■ 6.12
CBX4-203ENST00000494546 ARHGAP5Q13017 1502 aa53.27■■■■■ 6.12
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