RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493715.1

CHTF18-212, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 691 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-212ENST00000493715 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
CHTF18-212ENST00000493715 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.23■■□□□ 1.47
CHTF18-212ENST00000493715 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.22■■□□□ 1.47
CHTF18-212ENST00000493715 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.21■■□□□ 1.47
CHTF18-212ENST00000493715 MAPKBP1O60336 1514 aa24.2■■□□□ 1.47
CHTF18-212ENST00000493715 DIP2BQ9P265 1576 aa24.17■■□□□ 1.46
CHTF18-212ENST00000493715 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.13■■□□□ 1.45
CHTF18-212ENST00000493715 KDM6BO15054 1643 aa24.12■■□□□ 1.45
CHTF18-212ENST00000493715 TSPOAP1O95153 1857 aa24.02■■□□□ 1.44
CHTF18-212ENST00000493715 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.01■■□□□ 1.43
CHTF18-212ENST00000493715 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24■■□□□ 1.43
CHTF18-212ENST00000493715 CUL7Q14999 1698 aa23.95■■□□□ 1.43
CHTF18-212ENST00000493715 PTPRGP23470 1445 aa23.89■■□□□ 1.41
CHTF18-212ENST00000493715 KIF27Q86VH2 1401 aa23.89■■□□□ 1.41
CHTF18-212ENST00000493715 IGF1RP08069 1367 aa23.88■■□□□ 1.41
CHTF18-212ENST00000493715 ABCC2Q92887 1545 aa23.84■■□□□ 1.41
CHTF18-212ENST00000493715 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
CHTF18-212ENST00000493715 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.83■■□□□ 1.4
CHTF18-212ENST00000493715 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.81■■□□□ 1.4
CHTF18-212ENST00000493715 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.81■■□□□ 1.4
CHTF18-212ENST00000493715 GLI2P10070 1586 aa23.8■■□□□ 1.4
CHTF18-212ENST00000493715 ASXL2Q76L83 1435 aa23.79■■□□□ 1.4
CHTF18-212ENST00000493715 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
CHTF18-212ENST00000493715 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CHTF18-212ENST00000493715 ADGRL1O94910 1474 aa23.76■■□□□ 1.39
CHTF18-212ENST00000493715 IQGAP2Q13576 1575 aa23.74■■□□□ 1.39
CHTF18-212ENST00000493715 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.74■■□□□ 1.39
CHTF18-212ENST00000493715 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.73■■□□□ 1.39
CHTF18-212ENST00000493715 UACAQ9BZF9 1416 aa23.69■■□□□ 1.38
CHTF18-212ENST00000493715 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.67■■□□□ 1.38
CHTF18-212ENST00000493715 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.66■■□□□ 1.38
CHTF18-212ENST00000493715 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CHTF18-212ENST00000493715 DISP1Q96F81 1524 aa23.62■■□□□ 1.37
CHTF18-212ENST00000493715 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.62■■□□□ 1.37
CHTF18-212ENST00000493715 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
CHTF18-212ENST00000493715 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.61■■□□□ 1.37
CHTF18-212ENST00000493715 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CHTF18-212ENST00000493715 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.55■■□□□ 1.36
CHTF18-212ENST00000493715 KIAA0556O60303 1618 aa23.53■■□□□ 1.36
CHTF18-212ENST00000493715 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.5■■□□□ 1.35
CHTF18-212ENST00000493715 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.49■■□□□ 1.35
CHTF18-212ENST00000493715 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.43■■□□□ 1.34
CHTF18-212ENST00000493715 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.4■■□□□ 1.34
CHTF18-212ENST00000493715 CD109Q6YHK3 1445 aa23.4■■□□□ 1.34
CHTF18-212ENST00000493715 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.36■■□□□ 1.33
CHTF18-212ENST00000493715 GOLGA3Q08378 1498 aa23.36■■□□□ 1.33
CHTF18-212ENST00000493715 KCNH8Q96L42 1107 aa23.33■■□□□ 1.33
CHTF18-212ENST00000493715 KIF21BO75037 1637 aa23.33■■□□□ 1.32
CHTF18-212ENST00000493715 ABCA8O94911 1581 aa23.32■■□□□ 1.32
CHTF18-212ENST00000493715 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.23■■□□□ 1.31
CHTF18-212ENST00000493715 FBXO41Q8TF61 875 aa23.22■■□□□ 1.31
CHTF18-212ENST00000493715 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CHTF18-212ENST00000493715 PRXQ9BXM0 1461 aa23.16■■□□□ 1.3
CHTF18-212ENST00000493715 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.15■■□□□ 1.3
CHTF18-212ENST00000493715 PTPRMP28827 1452 aa23.15■■□□□ 1.3
CHTF18-212ENST00000493715 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.14■■□□□ 1.29
CHTF18-212ENST00000493715 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.13■■□□□ 1.29
CHTF18-212ENST00000493715 ARID3CA6NKF2 412 aa23.12■■□□□ 1.29
CHTF18-212ENST00000493715 ATP10BO94823 1461 aa23.11■■□□□ 1.29
CHTF18-212ENST00000493715 NEO1Q92859 1461 aa23.07■■□□□ 1.28
CHTF18-212ENST00000493715 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.05■■□□□ 1.28
CHTF18-212ENST00000493715 RAPGEF3O95398 923 aa23.05■■□□□ 1.28
CHTF18-212ENST00000493715 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CHTF18-212ENST00000493715 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CHTF18-212ENST00000493715 MADDQ8WXG6 1647 aa23.04■■□□□ 1.28
CHTF18-212ENST00000493715 P3H3Q8IVL6 736 aa23.03■■□□□ 1.28
CHTF18-212ENST00000493715 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.02■■□□□ 1.28
CHTF18-212ENST00000493715 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.01■■□□□ 1.27
CHTF18-212ENST00000493715 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23■■□□□ 1.27
CHTF18-212ENST00000493715 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.98■■□□□ 1.27
CHTF18-212ENST00000493715 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CHTF18-212ENST00000493715 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CHTF18-212ENST00000493715 EEA1Q15075 1411 aa22.98■■□□□ 1.27
CHTF18-212ENST00000493715 SAMD9Q5K651 1589 aa22.97■■□□□ 1.27
CHTF18-212ENST00000493715 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.96■■□□□ 1.27
CHTF18-212ENST00000493715 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CHTF18-212ENST00000493715 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.9■■□□□ 1.26
CHTF18-212ENST00000493715 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CHTF18-212ENST00000493715 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.89■■□□□ 1.26
CHTF18-212ENST00000493715 RICTORQ6R327 1708 aa22.89■■□□□ 1.26
CHTF18-212ENST00000493715 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CHTF18-212ENST00000493715 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.88■■□□□ 1.25
CHTF18-212ENST00000493715 FANCAO15360 1455 aa22.86■■□□□ 1.25
CHTF18-212ENST00000493715 AKNAQ7Z591 1439 aa22.84■■□□□ 1.25
CHTF18-212ENST00000493715 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.83■■□□□ 1.25
CHTF18-212ENST00000493715 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.82■■□□□ 1.24
CHTF18-212ENST00000493715 HSPA2P54652 639 aa22.82■■□□□ 1.24
CHTF18-212ENST00000493715 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.82■■□□□ 1.24
CHTF18-212ENST00000493715 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.82■■□□□ 1.24
CHTF18-212ENST00000493715 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.82■■□□□ 1.24
CHTF18-212ENST00000493715 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.81■■□□□ 1.24
CHTF18-212ENST00000493715 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.242e-6■■□□□ 11.5
CHTF18-212ENST00000493715 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CHTF18-212ENST00000493715 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.76■■□□□ 1.23
CHTF18-212ENST00000493715 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.76■■□□□ 1.23
CHTF18-212ENST00000493715 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.76■■□□□ 1.23
CHTF18-212ENST00000493715 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.74■■□□□ 1.23
CHTF18-212ENST00000493715 CERKQ8TCT0 537 aa22.74■■□□□ 1.23
CHTF18-212ENST00000493715 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.74■■□□□ 1.23
CHTF18-212ENST00000493715 MLECQ14165 292 aa22.71■■□□□ 1.23
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