RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493715.1

CHTF18-212, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 691 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-212ENST00000493715 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.32■■■■□ 3.08
CHTF18-212ENST00000493715 ABCC9O60706 1549 aa31.46■■■□□ 2.63
CHTF18-212ENST00000493715 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.06■■■□□ 2.56
CHTF18-212ENST00000493715 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.83■■■□□ 2.37
CHTF18-212ENST00000493715 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.79■■■□□ 2.36
CHTF18-212ENST00000493715 NACADO15069 1562 aa29.46■■■□□ 2.31
CHTF18-212ENST00000493715 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.18■■■□□ 2.266e-7■■■■□ 26.7
CHTF18-212ENST00000493715 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.17■■■□□ 2.26
CHTF18-212ENST00000493715 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.07■■■□□ 2.24
CHTF18-212ENST00000493715 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.88■■■□□ 2.21
CHTF18-212ENST00000493715 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.87■■■□□ 2.21
CHTF18-212ENST00000493715 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.52■■■□□ 2.16
CHTF18-212ENST00000493715 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.41■■■□□ 2.14
CHTF18-212ENST00000493715 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.4■■■□□ 2.14
CHTF18-212ENST00000493715 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
CHTF18-212ENST00000493715 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.33■■■□□ 2.13
CHTF18-212ENST00000493715 SCRIBQ14160 1630 aa28.25■■■□□ 2.11
CHTF18-212ENST00000493715 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
CHTF18-212ENST00000493715 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.79■■■□□ 2.04
CHTF18-212ENST00000493715 CUX2O14529 1486 aa27.35■■□□□ 1.97
CHTF18-212ENST00000493715 ERCC6Q03468 1493 aa27.25■■□□□ 1.95
CHTF18-212ENST00000493715 NCAPD3P42695 1498 aa27.16■■□□□ 1.94
CHTF18-212ENST00000493715 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.01■■□□□ 1.91
CHTF18-212ENST00000493715 SMARCA2P51531 1590 aa26.97■■□□□ 1.91
CHTF18-212ENST00000493715 HMGXB3Q12766 1538 aa26.96■■□□□ 1.91
CHTF18-212ENST00000493715 SMARCA4P51532 1647 aa26.9■■□□□ 1.9
CHTF18-212ENST00000493715 NESP48681 1621 aa26.87■■□□□ 1.89
CHTF18-212ENST00000493715 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CHTF18-212ENST00000493715 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CHTF18-212ENST00000493715 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CHTF18-212ENST00000493715 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.67■■□□□ 1.86
CHTF18-212ENST00000493715 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.63■■□□□ 1.85
CHTF18-212ENST00000493715 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.55■■□□□ 1.84
CHTF18-212ENST00000493715 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.53■■□□□ 1.84
CHTF18-212ENST00000493715 TRIM41Q8WV44 630 aa26.42■■□□□ 1.82
CHTF18-212ENST00000493715 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.41■■□□□ 1.82
CHTF18-212ENST00000493715 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.32■■□□□ 1.8
CHTF18-212ENST00000493715 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.32■■□□□ 1.8
CHTF18-212ENST00000493715 WDR62O43379 1518 aa26.27■■□□□ 1.8
CHTF18-212ENST00000493715 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.14■■□□□ 1.78
CHTF18-212ENST00000493715 WIZO95785 1651 aa26.1■■□□□ 1.77
CHTF18-212ENST00000493715 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.04■■□□□ 1.76
CHTF18-212ENST00000493715 OSCARQ8IYS5 282 aa25.98■■□□□ 1.75
CHTF18-212ENST00000493715 CFTRP13569 1480 aa25.92■■□□□ 1.74
CHTF18-212ENST00000493715 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CHTF18-212ENST00000493715 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CHTF18-212ENST00000493715 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.72■■□□□ 1.71
CHTF18-212ENST00000493715 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.72■■□□□ 1.71
CHTF18-212ENST00000493715 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.72■■□□□ 1.71
CHTF18-212ENST00000493715 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
CHTF18-212ENST00000493715 PRDM2Q13029 1718 aa25.68■■□□□ 1.7
CHTF18-212ENST00000493715 IFT140Q96RY7 1462 aa25.61■■□□□ 1.69
CHTF18-212ENST00000493715 ARHGEF11O15085 1522 aa25.59■■□□□ 1.69
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
CHTF18-212ENST00000493715 TOPBP1Q92547 1522 aa25.49■■□□□ 1.67
CHTF18-212ENST00000493715 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
CHTF18-212ENST00000493715 ABCC8Q09428 1581 aa25.44■■□□□ 1.66
CHTF18-212ENST00000493715 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.43■■□□□ 1.66
CHTF18-212ENST00000493715 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.4■■□□□ 1.66
CHTF18-212ENST00000493715 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.38■■□□□ 1.65
CHTF18-212ENST00000493715 CHD1O14646 1710 aa25.37■■□□□ 1.65
CHTF18-212ENST00000493715 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CHTF18-212ENST00000493715 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.641e-8■■□□□ 11.7
CHTF18-212ENST00000493715 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
CHTF18-212ENST00000493715 ARAP1Q96P48 1450 aa25.28■■□□□ 1.64
CHTF18-212ENST00000493715 FBLN2P98095 1184 aa25.25■■□□□ 1.63
CHTF18-212ENST00000493715 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CHTF18-212ENST00000493715 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.09■■□□□ 1.61
CHTF18-212ENST00000493715 SOGA1O94964 1423 aa25.07■■□□□ 1.6
CHTF18-212ENST00000493715 WDR97A6NE52 1622 aa25.06■■□□□ 1.6
CHTF18-212ENST00000493715 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.06■■□□□ 1.6
CHTF18-212ENST00000493715 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CHTF18-212ENST00000493715 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.04■■□□□ 1.6
CHTF18-212ENST00000493715 SYNJ1O43426 1573 aa25.03■■□□□ 1.6
CHTF18-212ENST00000493715 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CHTF18-212ENST00000493715 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CHTF18-212ENST00000493715 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.98■■□□□ 1.59
CHTF18-212ENST00000493715 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
CHTF18-212ENST00000493715 GRIN2BQ13224 1484 aa24.93■■□□□ 1.58
CHTF18-212ENST00000493715 SYNJ2O15056 1496 aa24.9■■□□□ 1.58
CHTF18-212ENST00000493715 CUX1P39880 1505 aa24.86■■□□□ 1.57
CHTF18-212ENST00000493715 PBRM1Q86U86 1689 aa24.82■■□□□ 1.56
CHTF18-212ENST00000493715 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.82■■□□□ 1.56
CHTF18-212ENST00000493715 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CHTF18-212ENST00000493715 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.68■■□□□ 1.54
CHTF18-212ENST00000493715 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.66■■□□□ 1.54
CHTF18-212ENST00000493715 GRIN2AQ12879 1464 aa24.61■■□□□ 1.53
CHTF18-212ENST00000493715 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.59■■□□□ 1.53
CHTF18-212ENST00000493715 CEP170Q5SW79 1584 aa24.55■■□□□ 1.52
CHTF18-212ENST00000493715 ADAMTS12P58397 1594 aa24.54■■□□□ 1.52
CHTF18-212ENST00000493715 NUP160Q12769 1436 aa24.52■■□□□ 1.52
CHTF18-212ENST00000493715 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
CHTF18-212ENST00000493715 SHROOM2Q13796 1616 aa24.48■■□□□ 1.51
CHTF18-212ENST00000493715 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.44■■□□□ 1.5
CHTF18-212ENST00000493715 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.4■■□□□ 1.5
CHTF18-212ENST00000493715 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.37■■□□□ 1.49
CHTF18-212ENST00000493715 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.37■■□□□ 1.49
CHTF18-212ENST00000493715 TOP2BQ02880 1626 aa24.36■■□□□ 1.49
CHTF18-212ENST00000493715 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
CHTF18-212ENST00000493715 JPH4Q96JJ6 628 aa24.25■■□□□ 1.47
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