RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493601.5

PTPRU-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, human

TSL 5

Gene PTPRU, Length 695 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRU-208	ENST00000493601	JPH4	Q96JJ6	628 aa		29	■■■□□ 2.23
PTPRU-208	ENST00000493601	IGF1R	P08069	1367 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PTPRU-208	ENST00000493601	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PTPRU-208	ENST00000493601	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PTPRU-208	ENST00000493601	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PTPRU-208	ENST00000493601	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PTPRU-208	ENST00000493601	MAPKBP1	O60336	1514 aa		28.73	■■■□□ 2.19
PTPRU-208	ENST00000493601	IQGAP2	Q13576	1575 aa		28.71	■■■□□ 2.19
PTPRU-208	ENST00000493601	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	28.7	■■■□□ 2.18
PTPRU-208	ENST00000493601	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		28.66	■■■□□ 2.18
PTPRU-208	ENST00000493601	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		28.65	■■■□□ 2.18
PTPRU-208	ENST00000493601	DIP2B	Q9P265	1576 aa		28.62	■■■□□ 2.17
PTPRU-208	ENST00000493601	PTPRG	P23470	1445 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PTPRU-208	ENST00000493601	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PTPRU-208	ENST00000493601	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		28.58	■■■□□ 2.17
PTPRU-208	ENST00000493601	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		28.56	■■■□□ 2.16
PTPRU-208	ENST00000493601	DISP1	Q96F81	1524 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PTPRU-208	ENST00000493601	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		28.5	■■■□□ 2.15
PTPRU-208	ENST00000493601	ABCC2	Q92887	1545 aa		28.49	■■■□□ 2.15
PTPRU-208	ENST00000493601	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	28.48	■■■□□ 2.15
PTPRU-208	ENST00000493601	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		28.46	■■■□□ 2.15
PTPRU-208	ENST00000493601	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		28.45	■■■□□ 2.14
PTPRU-208	ENST00000493601	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28.44	■■■□□ 2.14
PTPRU-208	ENST00000493601	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.43	■■■□□ 2.14
PTPRU-208	ENST00000493601	UACA	Q9BZF9	1416 aa		28.41	■■■□□ 2.14
PTPRU-208	ENST00000493601	TSPOAP1	O95153	1857 aa		28.4	■■■□□ 2.14
PTPRU-208	ENST00000493601	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		28.37	■■■□□ 2.13
PTPRU-208	ENST00000493601	ASXL2	Q76L83	1435 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PTPRU-208	ENST00000493601	KDM6B	O15054	1643 aa		28.36	■■■□□ 2.13
PTPRU-208	ENST00000493601	PRX	Q9BXM0	1461 aa		28.32	■■■□□ 2.12
PTPRU-208	ENST00000493601	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PTPRU-208	ENST00000493601	GLI2	P10070	1586 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PTPRU-208	ENST00000493601	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	28.29	■■■□□ 2.12
PTPRU-208	ENST00000493601	GOLGA3	Q08378	1498 aa		28.29	■■■□□ 2.12
PTPRU-208	ENST00000493601	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	28.23	■■■□□ 2.11
PTPRU-208	ENST00000493601	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.2	■■■□□ 2.1
PTPRU-208	ENST00000493601	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		28.18	■■■□□ 2.1
PTPRU-208	ENST00000493601	ABCA8	O94911	1581 aa		28.15	■■■□□ 2.1
PTPRU-208	ENST00000493601	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		28.13	■■■□□ 2.09
PTPRU-208	ENST00000493601	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		28.09	■■■□□ 2.09
PTPRU-208	ENST00000493601	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PTPRU-208	ENST00000493601	EEA1	Q15075	1411 aa		28.06	■■■□□ 2.08
PTPRU-208	ENST00000493601	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.01	■■■□□ 2.07
PTPRU-208	ENST00000493601	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28	■■■□□ 2.07
PTPRU-208	ENST00000493601	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
PTPRU-208	ENST00000493601	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
PTPRU-208	ENST00000493601	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PTPRU-208	ENST00000493601	P3H3	Q8IVL6	736 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PTPRU-208	ENST00000493601	CD109	Q6YHK3	1445 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PTPRU-208	ENST00000493601	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PTPRU-208	ENST00000493601	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PTPRU-208	ENST00000493601	KCNH8	Q96L42	1107 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PTPRU-208	ENST00000493601	KIF21B	O75037	1637 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRU-208	ENST00000493601	ATP10B	O94823	1461 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PTPRU-208	ENST00000493601	ARID3C	A6NKF2	412 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PTPRU-208	ENST00000493601	ADGRL1	O94910	1474 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PTPRU-208	ENST00000493601	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PTPRU-208	ENST00000493601	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PTPRU-208	ENST00000493601	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		27.76	■■■□□ 2.04
PTPRU-208	ENST00000493601	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PTPRU-208	ENST00000493601	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PTPRU-208	ENST00000493601	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PTPRU-208	ENST00000493601	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PTPRU-208	ENST00000493601	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PTPRU-208	ENST00000493601	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PTPRU-208	ENST00000493601	NEO1	Q92859	1461 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PTPRU-208	ENST00000493601	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PTPRU-208	ENST00000493601	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		27.54	■■■□□ 2
PTPRU-208	ENST00000493601	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
PTPRU-208	ENST00000493601	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		27.52	■■■□□ 2
PTPRU-208	ENST00000493601	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		27.5	■■□□□ 1.99
PTPRU-208	ENST00000493601	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	27.48	■■□□□ 1.99
PTPRU-208	ENST00000493601	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	27.48	■■□□□ 1.99
PTPRU-208	ENST00000493601	FMN1	Q68DA7	1419 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PTPRU-208	ENST00000493601	HECW1	Q76N89	1606 aa		27.48	■■□□□ 1.99
PTPRU-208	ENST00000493601	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PTPRU-208	ENST00000493601	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PTPRU-208	ENST00000493601	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		27.45	■■□□□ 1.99
PTPRU-208	ENST00000493601	RAPGEF3	O95398	923 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PTPRU-208	ENST00000493601	FANCA	O15360	1455 aa		27.44	■■□□□ 1.98
PTPRU-208	ENST00000493601	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		27.42	■■□□□ 1.98
PTPRU-208	ENST00000493601	RICTOR	Q6R327	1708 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PTPRU-208	ENST00000493601	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	27.39	■■□□□ 1.98
PTPRU-208	ENST00000493601	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		27.39	■■□□□ 1.98
PTPRU-208	ENST00000493601	AKNA	Q7Z591	1439 aa		27.39	■■□□□ 1.97
PTPRU-208	ENST00000493601	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		27.36	■■□□□ 1.97
PTPRU-208	ENST00000493601	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	27.33	■■□□□ 1.97
PTPRU-208	ENST00000493601	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		27.33	■■□□□ 1.96
PTPRU-208	ENST00000493601	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		27.32	■■□□□ 1.96
PTPRU-208	ENST00000493601	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		27.32	■■□□□ 1.96
PTPRU-208	ENST00000493601	KIF14	Q15058	1648 aa		27.3	■■□□□ 1.96
PTPRU-208	ENST00000493601	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	27.29	■■□□□ 1.96
PTPRU-208	ENST00000493601	PLCH2	O75038	1416 aa		27.29	■■□□□ 1.96
PTPRU-208	ENST00000493601	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		27.27	■■□□□ 1.96
PTPRU-208	ENST00000493601	PTPRM	P28827	1452 aa		27.25	■■□□□ 1.95
PTPRU-208	ENST00000493601	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		27.25	■■□□□ 1.95
PTPRU-208	ENST00000493601	MADD	Q8WXG6	1647 aa		27.24	■■□□□ 1.95
PTPRU-208	ENST00000493601	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	27.24	■■□□□ 1.95
PTPRU-208	ENST00000493601	CLIP1	P30622	1438 aa		27.24	■■□□□ 1.95
PTPRU-208	ENST00000493601	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	27.24	■■□□□ 1.95

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