RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.65■■■□□ 2.18
SH3BP4-211ENST00000493436 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
SH3BP4-211ENST00000493436 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP4-211ENST00000493436 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.44■■■□□ 2.14
SH3BP4-211ENST00000493436 IQGAP2Q13576 1575 aa28.38■■■□□ 2.13
SH3BP4-211ENST00000493436 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.3■■■□□ 2.12
SH3BP4-211ENST00000493436 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.25■■■□□ 2.11
SH3BP4-211ENST00000493436 PTPRGP23470 1445 aa28.25■■■□□ 2.11
SH3BP4-211ENST00000493436 PRXQ9BXM0 1461 aa28.24■■■□□ 2.11
SH3BP4-211ENST00000493436 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.24■■■□□ 2.11
SH3BP4-211ENST00000493436 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
SH3BP4-211ENST00000493436 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.23■■■□□ 2.11
SH3BP4-211ENST00000493436 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.23■■■□□ 2.11
SH3BP4-211ENST00000493436 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.21■■■□□ 2.11
SH3BP4-211ENST00000493436 DISP1Q96F81 1524 aa28.2■■■□□ 2.1
SH3BP4-211ENST00000493436 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.15■■■□□ 2.1
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.15■■■□□ 2.1
SH3BP4-211ENST00000493436 MAPKBP1O60336 1514 aa28.13■■■□□ 2.09
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA0556O60303 1618 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP4-211ENST00000493436 EEA1Q15075 1411 aa28.09■■■□□ 2.09
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.05■■■□□ 2.08
SH3BP4-211ENST00000493436 UACAQ9BZF9 1416 aa28.04■■■□□ 2.08
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCC2Q92887 1545 aa28.03■■■□□ 2.08
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.03■■■□□ 2.08
SH3BP4-211ENST00000493436 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.02■■■□□ 2.08
SH3BP4-211ENST00000493436 GOLGA3Q08378 1498 aa28.02■■■□□ 2.08
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
SH3BP4-211ENST00000493436 DIP2BQ9P265 1576 aa28■■■□□ 2.07
SH3BP4-211ENST00000493436 CHIC1Q5VXU3 224 aa28■■■□□ 2.07
SH3BP4-211ENST00000493436 ASXL2Q76L83 1435 aa27.91■■■□□ 2.06
SH3BP4-211ENST00000493436 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.9■■■□□ 2.06
SH3BP4-211ENST00000493436 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.89■■■□□ 2.05
SH3BP4-211ENST00000493436 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
SH3BP4-211ENST00000493436 TSPOAP1O95153 1857 aa27.87■■■□□ 2.05
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF21BO75037 1637 aa27.85■■■□□ 2.05
SH3BP4-211ENST00000493436 P3H3Q8IVL6 736 aa27.84■■■□□ 2.05
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCA8O94911 1581 aa27.83■■■□□ 2.05
SH3BP4-211ENST00000493436 SAMD9Q5K651 1589 aa27.81■■■□□ 2.04
SH3BP4-211ENST00000493436 GLI2P10070 1586 aa27.77■■■□□ 2.04
SH3BP4-211ENST00000493436 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
SH3BP4-211ENST00000493436 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
SH3BP4-211ENST00000493436 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.7■■■□□ 2.02
SH3BP4-211ENST00000493436 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.7■■■□□ 2.02
SH3BP4-211ENST00000493436 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
SH3BP4-211ENST00000493436 KDM6BO15054 1643 aa27.67■■■□□ 2.02
SH3BP4-211ENST00000493436 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
SH3BP4-211ENST00000493436 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.65■■■□□ 2.02
SH3BP4-211ENST00000493436 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.64■■■□□ 2.02
SH3BP4-211ENST00000493436 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.63■■■□□ 2.01
SH3BP4-211ENST00000493436 ARID3CA6NKF2 412 aa27.63■■■□□ 2.01
SH3BP4-211ENST00000493436 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.61■■■□□ 2.01
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP10BO94823 1461 aa27.6■■■□□ 2.01
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNH8Q96L42 1107 aa27.59■■■□□ 2.01
SH3BP4-211ENST00000493436 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.53■■■□□ 2
SH3BP4-211ENST00000493436 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.52■■■□□ 2
SH3BP4-211ENST00000493436 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
SH3BP4-211ENST00000493436 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
SH3BP4-211ENST00000493436 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SH3BP4-211ENST00000493436 CD109Q6YHK3 1445 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP4-211ENST00000493436 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
SH3BP4-211ENST00000493436 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.44■■□□□ 1.98
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.43■■□□□ 1.98
SH3BP4-211ENST00000493436 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP4-211ENST00000493436 FMN1Q68DA7 1419 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP4-211ENST00000493436 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
SH3BP4-211ENST00000493436 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
SH3BP4-211ENST00000493436 HECW1Q76N89 1606 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP4-211ENST00000493436 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP4-211ENST00000493436 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP4-211ENST00000493436 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.19■■□□□ 1.94
SH3BP4-211ENST00000493436 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.18■■□□□ 1.94
SH3BP4-211ENST00000493436 NEO1Q92859 1461 aa27.18■■□□□ 1.94
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.16■■□□□ 1.94
SH3BP4-211ENST00000493436 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.15■■□□□ 1.94
SH3BP4-211ENST00000493436 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
SH3BP4-211ENST00000493436 CLIP1P30622 1438 aa27.15■■□□□ 1.94
SH3BP4-211ENST00000493436 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
SH3BP4-211ENST00000493436 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP4-211ENST00000493436 RAPGEF3O95398 923 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP4-211ENST00000493436 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP4-211ENST00000493436 FANCAO15360 1455 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP4-211ENST00000493436 ADGRL1O94910 1474 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP4-211ENST00000493436 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
SH3BP4-211ENST00000493436 AKNAQ7Z591 1439 aa27.05■■□□□ 1.92
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.04■■□□□ 1.92
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF14Q15058 1648 aa27.04■■□□□ 1.92
SH3BP4-211ENST00000493436 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.02■■□□□ 1.92
SH3BP4-211ENST00000493436 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.02■■□□□ 1.92
SH3BP4-211ENST00000493436 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.02■■□□□ 1.92
SH3BP4-211ENST00000493436 PLCH2O75038 1416 aa27.01■■□□□ 1.91
SH3BP4-211ENST00000493436 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
SH3BP4-211ENST00000493436 RICTORQ6R327 1708 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BP4-211ENST00000493436 CEP162Q5TB80 1403 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP4-211ENST00000493436 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP4-211ENST00000493436 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.89■■□□□ 1.89
SH3BP4-211ENST00000493436 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms