RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.19■■■■■ 4.18
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.79■■■■□ 3.48
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCC9O60706 1549 aa36.34■■■■□ 3.41
SH3BP4-211ENST00000493436 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.79■■■■□ 3.16
SH3BP4-211ENST00000493436 NACADO15069 1562 aa34.66■■■■□ 3.14
SH3BP4-211ENST00000493436 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.62■■■■□ 3.13
SH3BP4-211ENST00000493436 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.31■■■■□ 3.08
SH3BP4-211ENST00000493436 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
SH3BP4-211ENST00000493436 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.05■■■■□ 3.04
SH3BP4-211ENST00000493436 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.04■■■■□ 3.04
SH3BP4-211ENST00000493436 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.9■■■■□ 3.02
SH3BP4-211ENST00000493436 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.75■■■□□ 2.99
SH3BP4-211ENST00000493436 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.66■■■□□ 2.98
SH3BP4-211ENST00000493436 SCRIBQ14160 1630 aa33.56■■■□□ 2.96
SH3BP4-211ENST00000493436 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.32■■■□□ 2.92
SH3BP4-211ENST00000493436 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.88■■■□□ 2.85
SH3BP4-211ENST00000493436 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.85■■■□□ 2.85
SH3BP4-211ENST00000493436 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.67■■■□□ 2.82
SH3BP4-211ENST00000493436 SMARCA4P51532 1647 aa32.05■■■□□ 2.72
SH3BP4-211ENST00000493436 NCAPD3P42695 1498 aa31.97■■■□□ 2.71
SH3BP4-211ENST00000493436 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.71
SH3BP4-211ENST00000493436 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.95■■■□□ 2.7
SH3BP4-211ENST00000493436 SMARCA2P51531 1590 aa31.9■■■□□ 2.7
SH3BP4-211ENST00000493436 HMGXB3Q12766 1538 aa31.79■■■□□ 2.68
SH3BP4-211ENST00000493436 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.75■■■□□ 2.67
SH3BP4-211ENST00000493436 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.72■■■□□ 2.67
SH3BP4-211ENST00000493436 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
SH3BP4-211ENST00000493436 WIZO95785 1651 aa31.42■■■□□ 2.62
SH3BP4-211ENST00000493436 ERCC6Q03468 1493 aa31.35■■■□□ 2.61
SH3BP4-211ENST00000493436 NESP48681 1621 aa31.35■■■□□ 2.61
SH3BP4-211ENST00000493436 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
SH3BP4-211ENST00000493436 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.2■■■□□ 2.58
SH3BP4-211ENST00000493436 CUX2O14529 1486 aa31.12■■■□□ 2.57
SH3BP4-211ENST00000493436 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.04■■■□□ 2.56
SH3BP4-211ENST00000493436 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
SH3BP4-211ENST00000493436 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.99■■■□□ 2.55
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.99■■■□□ 2.55
SH3BP4-211ENST00000493436 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
SH3BP4-211ENST00000493436 CFTRP13569 1480 aa30.77■■■□□ 2.52
SH3BP4-211ENST00000493436 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.7■■■□□ 2.51
SH3BP4-211ENST00000493436 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.69■■■□□ 2.5
SH3BP4-211ENST00000493436 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.68■■■□□ 2.5
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.67■■■□□ 2.5
SH3BP4-211ENST00000493436 WDR62O43379 1518 aa30.61■■■□□ 2.49
SH3BP4-211ENST00000493436 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.58■■■□□ 2.49
SH3BP4-211ENST00000493436 PRDM2Q13029 1718 aa30.58■■■□□ 2.49
SH3BP4-211ENST00000493436 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
SH3BP4-211ENST00000493436 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
SH3BP4-211ENST00000493436 TOPBP1Q92547 1522 aa30.17■■■□□ 2.42
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCC8Q09428 1581 aa30.12■■■□□ 2.41
SH3BP4-211ENST00000493436 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.1■■■□□ 2.41
SH3BP4-211ENST00000493436 IFT140Q96RY7 1462 aa30.05■■■□□ 2.4
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
SH3BP4-211ENST00000493436 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
SH3BP4-211ENST00000493436 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
SH3BP4-211ENST00000493436 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
SH3BP4-211ENST00000493436 CUX1P39880 1505 aa29.81■■■□□ 2.36
SH3BP4-211ENST00000493436 OSCARQ8IYS5 282 aa29.79■■■□□ 2.36
SH3BP4-211ENST00000493436 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.76■■■□□ 2.35
SH3BP4-211ENST00000493436 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.76■■■□□ 2.35
SH3BP4-211ENST00000493436 SOGA1O94964 1423 aa29.76■■■□□ 2.35
SH3BP4-211ENST00000493436 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.74■■■□□ 2.353e-7■■■□□ 16
SH3BP4-211ENST00000493436 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.33
SH3BP4-211ENST00000493436 WDR97A6NE52 1622 aa29.58■■■□□ 2.33
SH3BP4-211ENST00000493436 CHD1O14646 1710 aa29.55■■■□□ 2.32
SH3BP4-211ENST00000493436 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.48■■■□□ 2.31
SH3BP4-211ENST00000493436 FBLN2P98095 1184 aa29.48■■■□□ 2.31
SH3BP4-211ENST00000493436 TOP2BQ02880 1626 aa29.46■■■□□ 2.31
SH3BP4-211ENST00000493436 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.46■■■□□ 2.31
SH3BP4-211ENST00000493436 TRIM41Q8WV44 630 aa29.46■■■□□ 2.31
SH3BP4-211ENST00000493436 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.46■■■□□ 2.31
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.45■■■□□ 2.3
SH3BP4-211ENST00000493436 SYNJ1O43426 1573 aa29.44■■■□□ 2.3
SH3BP4-211ENST00000493436 GRIN2BQ13224 1484 aa29.44■■■□□ 2.3
SH3BP4-211ENST00000493436 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.41■■■□□ 2.3
SH3BP4-211ENST00000493436 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
SH3BP4-211ENST00000493436 PBRM1Q86U86 1689 aa29.4■■■□□ 2.3
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.37■■■□□ 2.29
SH3BP4-211ENST00000493436 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.36■■■□□ 2.29
SH3BP4-211ENST00000493436 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.36■■■□□ 2.29
SH3BP4-211ENST00000493436 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.36■■■□□ 2.29
SH3BP4-211ENST00000493436 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGEF11O15085 1522 aa29.3■■■□□ 2.28
SH3BP4-211ENST00000493436 SYNJ2O15056 1496 aa29.29■■■□□ 2.28
SH3BP4-211ENST00000493436 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.17■■■□□ 2.26
SH3BP4-211ENST00000493436 ADAMTS12P58397 1594 aa29.11■■■□□ 2.25
SH3BP4-211ENST00000493436 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.09■■■□□ 2.25
SH3BP4-211ENST00000493436 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.07■■■□□ 2.24
SH3BP4-211ENST00000493436 GRIN2AQ12879 1464 aa29.06■■■□□ 2.24
SH3BP4-211ENST00000493436 ARAP1Q96P48 1450 aa29.04■■■□□ 2.24
SH3BP4-211ENST00000493436 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.04■■■□□ 2.24
SH3BP4-211ENST00000493436 CEP170Q5SW79 1584 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP4-211ENST00000493436 NUP160Q12769 1436 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF27Q86VH2 1401 aa28.89■■■□□ 2.22
SH3BP4-211ENST00000493436 IGF1RP08069 1367 aa28.82■■■□□ 2.2
SH3BP4-211ENST00000493436 CUL7Q14999 1698 aa28.77■■■□□ 2.2
SH3BP4-211ENST00000493436 SHROOM2Q13796 1616 aa28.77■■■□□ 2.2
SH3BP4-211ENST00000493436 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.76■■■□□ 2.19
SH3BP4-211ENST00000493436 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.69■■■□□ 2.18
SH3BP4-211ENST00000493436 JPH4Q96JJ6 628 aa28.66■■■□□ 2.18
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