RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493112.5

SUCLG2-204, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUCLG2, Length 1,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-204ENST00000493112 IGF1RP08069 1367 aa21.55■■□□□ 1.04
SUCLG2-204ENST00000493112 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SUCLG2-204ENST00000493112 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.42■■□□□ 1.02
SUCLG2-204ENST00000493112 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.42■■□□□ 1.02
SUCLG2-204ENST00000493112 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SUCLG2-204ENST00000493112 JPH4Q96JJ6 628 aa21.4■■□□□ 1.02
SUCLG2-204ENST00000493112 IQGAP2Q13576 1575 aa21.33■■□□□ 1
SUCLG2-204ENST00000493112 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.3■■□□□ 1
SUCLG2-204ENST00000493112 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.27■■□□□ 1
SUCLG2-204ENST00000493112 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.25■□□□□ 0.99
SUCLG2-204ENST00000493112 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.23■□□□□ 0.99
SUCLG2-204ENST00000493112 DISP1Q96F81 1524 aa21.17■□□□□ 0.98
SUCLG2-204ENST00000493112 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.17■□□□□ 0.98
SUCLG2-204ENST00000493112 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.17■□□□□ 0.98
SUCLG2-204ENST00000493112 PRXQ9BXM0 1461 aa21.15■□□□□ 0.98
SUCLG2-204ENST00000493112 MAPKBP1O60336 1514 aa21.15■□□□□ 0.98
SUCLG2-204ENST00000493112 KIAA0556O60303 1618 aa21.14■□□□□ 0.98
SUCLG2-204ENST00000493112 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.13■□□□□ 0.97
SUCLG2-204ENST00000493112 PTPRGP23470 1445 aa21.13■□□□□ 0.97
SUCLG2-204ENST00000493112 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
SUCLG2-204ENST00000493112 DIP2BQ9P265 1576 aa21.09■□□□□ 0.97
SUCLG2-204ENST00000493112 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.96
SUCLG2-204ENST00000493112 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.06■□□□□ 0.96
SUCLG2-204ENST00000493112 ABCC2Q92887 1545 aa21.04■□□□□ 0.96
SUCLG2-204ENST00000493112 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.02■□□□□ 0.96
SUCLG2-204ENST00000493112 UACAQ9BZF9 1416 aa21.01■□□□□ 0.95
SUCLG2-204ENST00000493112 EEA1Q15075 1411 aa21■□□□□ 0.95
SUCLG2-204ENST00000493112 GOLGA3Q08378 1498 aa20.99■□□□□ 0.95
SUCLG2-204ENST00000493112 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.98■□□□□ 0.95
SUCLG2-204ENST00000493112 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
SUCLG2-204ENST00000493112 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
SUCLG2-204ENST00000493112 TSPOAP1O95153 1857 aa20.96■□□□□ 0.95
SUCLG2-204ENST00000493112 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.96■□□□□ 0.95
SUCLG2-204ENST00000493112 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.94■□□□□ 0.94
SUCLG2-204ENST00000493112 ASXL2Q76L83 1435 aa20.92■□□□□ 0.94
SUCLG2-204ENST00000493112 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.92■□□□□ 0.94
SUCLG2-204ENST00000493112 KIF21BO75037 1637 aa20.91■□□□□ 0.94
SUCLG2-204ENST00000493112 ABCA8O94911 1581 aa20.91■□□□□ 0.94
SUCLG2-204ENST00000493112 SAMD9Q5K651 1589 aa20.91■□□□□ 0.94
SUCLG2-204ENST00000493112 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
SUCLG2-204ENST00000493112 GLI2P10070 1586 aa20.87■□□□□ 0.93
SUCLG2-204ENST00000493112 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SUCLG2-204ENST00000493112 KDM6BO15054 1643 aa20.82■□□□□ 0.92
SUCLG2-204ENST00000493112 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
SUCLG2-204ENST00000493112 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.81■□□□□ 0.92
SUCLG2-204ENST00000493112 P3H3Q8IVL6 736 aa20.79■□□□□ 0.92
SUCLG2-204ENST00000493112 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.78■□□□□ 0.92
SUCLG2-204ENST00000493112 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.76■□□□□ 0.91
SUCLG2-204ENST00000493112 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.73■□□□□ 0.91
SUCLG2-204ENST00000493112 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
SUCLG2-204ENST00000493112 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.72■□□□□ 0.91
SUCLG2-204ENST00000493112 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.71■□□□□ 0.91
SUCLG2-204ENST00000493112 ATP10BO94823 1461 aa20.68■□□□□ 0.9
SUCLG2-204ENST00000493112 ARID3CA6NKF2 412 aa20.68■□□□□ 0.9
SUCLG2-204ENST00000493112 EHMT2Q96KQ7 1210 aa20.68■□□□□ 0.9
SUCLG2-204ENST00000493112 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.65■□□□□ 0.9
SUCLG2-204ENST00000493112 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
SUCLG2-204ENST00000493112 KCNH8Q96L42 1107 aa20.6■□□□□ 0.89
SUCLG2-204ENST00000493112 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SUCLG2-204ENST00000493112 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SUCLG2-204ENST00000493112 CD109Q6YHK3 1445 aa20.59■□□□□ 0.89
SUCLG2-204ENST00000493112 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.59■□□□□ 0.89
SUCLG2-204ENST00000493112 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.59■□□□□ 0.89
SUCLG2-204ENST00000493112 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SUCLG2-204ENST00000493112 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.55■□□□□ 0.88
SUCLG2-204ENST00000493112 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SUCLG2-204ENST00000493112 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SUCLG2-204ENST00000493112 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SUCLG2-204ENST00000493112 HECW1Q76N89 1606 aa20.5■□□□□ 0.87
SUCLG2-204ENST00000493112 FMN1Q68DA7 1419 aa20.47■□□□□ 0.87
SUCLG2-204ENST00000493112 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.47■□□□□ 0.87
SUCLG2-204ENST00000493112 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.44■□□□□ 0.86
SUCLG2-204ENST00000493112 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
SUCLG2-204ENST00000493112 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.42■□□□□ 0.86
SUCLG2-204ENST00000493112 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
SUCLG2-204ENST00000493112 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.38■□□□□ 0.85
SUCLG2-204ENST00000493112 NEO1Q92859 1461 aa20.38■□□□□ 0.85
SUCLG2-204ENST00000493112 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.37■□□□□ 0.85
SUCLG2-204ENST00000493112 ADGRL1O94910 1474 aa20.37■□□□□ 0.85
SUCLG2-204ENST00000493112 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.37■□□□□ 0.85
SUCLG2-204ENST00000493112 CFAP74Q9C0B2 1584 aa20.36■□□□□ 0.85
SUCLG2-204ENST00000493112 KIF14Q15058 1648 aa20.34■□□□□ 0.85
SUCLG2-204ENST00000493112 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SUCLG2-204ENST00000493112 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.33■□□□□ 0.84
SUCLG2-204ENST00000493112 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.32■□□□□ 0.84
SUCLG2-204ENST00000493112 RICTORQ6R327 1708 aa20.31■□□□□ 0.84
SUCLG2-204ENST00000493112 CLIP1P30622 1438 aa20.31■□□□□ 0.84
SUCLG2-204ENST00000493112 FANCAO15360 1455 aa20.3■□□□□ 0.84
SUCLG2-204ENST00000493112 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.29■□□□□ 0.84
SUCLG2-204ENST00000493112 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.27■□□□□ 0.84
SUCLG2-204ENST00000493112 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SUCLG2-204ENST00000493112 AKNAQ7Z591 1439 aa20.26■□□□□ 0.83
SUCLG2-204ENST00000493112 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.26■□□□□ 0.83
SUCLG2-204ENST00000493112 RAPGEF3O95398 923 aa20.26■□□□□ 0.83
SUCLG2-204ENST00000493112 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.24■□□□□ 0.83
SUCLG2-204ENST00000493112 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SUCLG2-204ENST00000493112 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SUCLG2-204ENST00000493112 PLCH2O75038 1416 aa20.22■□□□□ 0.83
SUCLG2-204ENST00000493112 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.2■□□□□ 0.82
SUCLG2-204ENST00000493112 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.2 ms