RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492582.5

CHKB-212, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 2,069 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-212ENST00000492582 TIAM1Q13009 1591 aa43.45■■■■■ 4.55
CHKB-212ENST00000492582 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.44■■■■■ 4.54
CHKB-212ENST00000492582 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP43.43■■■■■ 4.54
CHKB-212ENST00000492582 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.39■■■■■ 4.54
CHKB-212ENST00000492582 ERCC6Q03468 1493 aa43.37■■■■■ 4.53
CHKB-212ENST00000492582 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.34■■■■■ 4.53
CHKB-212ENST00000492582 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.31■■■■■ 4.52
CHKB-212ENST00000492582 P3H3Q8IVL6 736 aa43.29■■■■■ 4.52
CHKB-212ENST00000492582 CFAP43Q8NDM7 1665 aa43.27■■■■■ 4.52
CHKB-212ENST00000492582 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa43.24■■■■■ 4.51
CHKB-212ENST00000492582 CCNB3Q8WWL7 1395 aa43.21■■■■■ 4.51
CHKB-212ENST00000492582 PBRM1Q86U86 1689 aa43.21■■■■■ 4.51
CHKB-212ENST00000492582 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.2■■■■■ 4.513e-8■■■■■ 28.1
CHKB-212ENST00000492582 FYCO1Q9BQS8 1478 aa43.2■■■■■ 4.51
CHKB-212ENST00000492582 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
CHKB-212ENST00000492582 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa43.15■■■■■ 4.5
CHKB-212ENST00000492582 WDR62O43379 1518 aa43.15■■■■■ 4.5
CHKB-212ENST00000492582 SAMD9Q5K651 1589 aa43.15■■■■■ 4.5
CHKB-212ENST00000492582 FMN1Q68DA7 1419 aa43.08■■■■■ 4.49
CHKB-212ENST00000492582 ADAMTS12P58397 1594 aa43.03■■■■■ 4.48
CHKB-212ENST00000492582 IFT140Q96RY7 1462 aa43.02■■■■■ 4.48
CHKB-212ENST00000492582 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43■■■■■ 4.47
CHKB-212ENST00000492582 GRIN2BQ13224 1484 aa42.99■■■■■ 4.47
CHKB-212ENST00000492582 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.97■■■■■ 4.47
CHKB-212ENST00000492582 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.97■■■■■ 4.47
CHKB-212ENST00000492582 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP42.92■■■■■ 4.46
CHKB-212ENST00000492582 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.89■■■■■ 4.46
CHKB-212ENST00000492582 CLSPNQ9HAW4 1339 aa42.87■■■■■ 4.45
CHKB-212ENST00000492582 IQGAP2Q13576 1575 aa42.81■■■■■ 4.44
CHKB-212ENST00000492582 ITGAEP38570 1179 aa42.77■■■■■ 4.44
CHKB-212ENST00000492582 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.77■■■■■ 4.44
CHKB-212ENST00000492582 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.7■■■■■ 4.43
CHKB-212ENST00000492582 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP42.66■■■■■ 4.42
CHKB-212ENST00000492582 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.63■■■■■ 4.42
CHKB-212ENST00000492582 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.63■■■■■ 4.41
CHKB-212ENST00000492582 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
CHKB-212ENST00000492582 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.62■■■■■ 4.41
CHKB-212ENST00000492582 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa42.61■■■■■ 4.41
CHKB-212ENST00000492582 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.6■■■■■ 4.41
CHKB-212ENST00000492582 SETD5Q9C0A6 1442 aa42.56■■■■■ 4.4
CHKB-212ENST00000492582 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.54■■■■■ 4.4
CHKB-212ENST00000492582 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.53■■■■■ 4.4
CHKB-212ENST00000492582 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.53■■■■■ 4.4
CHKB-212ENST00000492582 HECW1Q76N89 1606 aa42.52■■■■■ 4.4
CHKB-212ENST00000492582 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.52■■■■■ 4.4
CHKB-212ENST00000492582 GRIN2AQ12879 1464 aa42.51■■■■■ 4.4
CHKB-212ENST00000492582 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
CHKB-212ENST00000492582 NCOA2Q15596 1464 aa42.46■■■■■ 4.39
CHKB-212ENST00000492582 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.45■■■■■ 4.39
CHKB-212ENST00000492582 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.41■■■■■ 4.38
CHKB-212ENST00000492582 KIAA0556O60303 1618 aa42.38■■■■■ 4.38
CHKB-212ENST00000492582 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.38■■■■■ 4.37
CHKB-212ENST00000492582 ARHGEF11O15085 1522 aa42.37■■■■■ 4.37
CHKB-212ENST00000492582 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP42.37■■■■■ 4.37
CHKB-212ENST00000492582 DISP1Q96F81 1524 aa42.36■■■■■ 4.37
CHKB-212ENST00000492582 MAPKBP1O60336 1514 aa42.36■■■■■ 4.37
CHKB-212ENST00000492582 SYNJ2O15056 1496 aa42.32■■■■■ 4.37
CHKB-212ENST00000492582 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
CHKB-212ENST00000492582 CEP170Q5SW79 1584 aa42.25■■■■■ 4.35
CHKB-212ENST00000492582 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
CHKB-212ENST00000492582 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.2■■■■■ 4.35
CHKB-212ENST00000492582 PTPRKQ15262 1439 aa42.18■■■■■ 4.34
CHKB-212ENST00000492582 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
CHKB-212ENST00000492582 NUP160Q12769 1436 aa42.11■■■■■ 4.33
CHKB-212ENST00000492582 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.11■■■■■ 4.33
CHKB-212ENST00000492582 HFM1A2PYH4 1435 aa42.11■■■■■ 4.33
CHKB-212ENST00000492582 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
CHKB-212ENST00000492582 FBLN2P98095 1184 aa42.02■■■■■ 4.32
CHKB-212ENST00000492582 ARID3CA6NKF2 412 aa42.01■■■■■ 4.32
CHKB-212ENST00000492582 MIA2Q96PC5 1412 aa42■■■■■ 4.31
CHKB-212ENST00000492582 NAIPQ13075 1403 aa41.98■■■■■ 4.31
CHKB-212ENST00000492582 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.91■■■■■ 4.3
CHKB-212ENST00000492582 JPH4Q96JJ6 628 aa41.89■■■■■ 4.3
CHKB-212ENST00000492582 UACAQ9BZF9 1416 aa41.89■■■■■ 4.3
CHKB-212ENST00000492582 SIN3AQ96ST3 1273 aa41.87■■■■■ 4.29
CHKB-212ENST00000492582 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.84■■■■■ 4.29
CHKB-212ENST00000492582 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.82■■■■■ 4.29
CHKB-212ENST00000492582 AKNAQ7Z591 1439 aa41.81■■■■■ 4.28
CHKB-212ENST00000492582 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.81■■■■■ 4.28
CHKB-212ENST00000492582 MIER1Q8N108 512 aa41.8■■■■■ 4.28
CHKB-212ENST00000492582 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa41.8■■■■■ 4.28
CHKB-212ENST00000492582 NEUROD1Q13562 356 aa41.78■■■■■ 4.28
CHKB-212ENST00000492582 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
CHKB-212ENST00000492582 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
CHKB-212ENST00000492582 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.69■■■■■ 4.26
CHKB-212ENST00000492582 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.68■■■■■ 4.26
CHKB-212ENST00000492582 ABCA8O94911 1581 aa41.67■■■■■ 4.26
CHKB-212ENST00000492582 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.66■■■■■ 4.26
CHKB-212ENST00000492582 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP41.66■■■■■ 4.26
CHKB-212ENST00000492582 CHD1O14646 1710 aa41.64■■■■■ 4.26
CHKB-212ENST00000492582 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
CHKB-212ENST00000492582 DAPK1P53355 1430 aa41.63■■■■■ 4.25
CHKB-212ENST00000492582 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
CHKB-212ENST00000492582 KDM6BO15054 1643 aa41.59■■■■■ 4.25
CHKB-212ENST00000492582 ITSN2Q9NZM3 1697 aa41.58■■■■■ 4.25
CHKB-212ENST00000492582 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
CHKB-212ENST00000492582 KIF14Q15058 1648 aa41.56■■■■■ 4.24
CHKB-212ENST00000492582 ABCC5O15440 1437 aa41.56■■■■■ 4.24
CHKB-212ENST00000492582 ROCK1Q13464 1354 aa41.55■■■■■ 4.24
CHKB-212ENST00000492582 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
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