RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492270.1

UPF3A-209, Transcript of UPF3A, regulator of nonsense mediated mRNA decay, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene UPF3A, Length 494 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3A-209ENST00000492270 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.09■■■■■ 4.33
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UPF3A-209ENST00000492270 JPH4Q96JJ6 628 aa42.06■■■■■ 4.32
UPF3A-209ENST00000492270 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.92■■■■■ 4.3
UPF3A-209ENST00000492270 IQGAP2Q13576 1575 aa41.86■■■■■ 4.29
UPF3A-209ENST00000492270 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
UPF3A-209ENST00000492270 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.74■■■■■ 4.27
UPF3A-209ENST00000492270 PRXQ9BXM0 1461 aa41.71■■■■■ 4.27
UPF3A-209ENST00000492270 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.61■■■■■ 4.25
UPF3A-209ENST00000492270 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.58■■■■■ 4.25
UPF3A-209ENST00000492270 DISP1Q96F81 1524 aa41.58■■■■■ 4.25
UPF3A-209ENST00000492270 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.58■■■■■ 4.25
UPF3A-209ENST00000492270 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.51■■■■■ 4.24
UPF3A-209ENST00000492270 KIAA0556O60303 1618 aa41.5■■■■■ 4.23
UPF3A-209ENST00000492270 EEA1Q15075 1411 aa41.5■■■■■ 4.23
UPF3A-209ENST00000492270 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.49■■■■■ 4.23
UPF3A-209ENST00000492270 PTPRGP23470 1445 aa41.49■■■■■ 4.23
UPF3A-209ENST00000492270 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.49■■■■■ 4.23
UPF3A-209ENST00000492270 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
UPF3A-209ENST00000492270 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.4■■■■■ 4.22
UPF3A-209ENST00000492270 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
UPF3A-209ENST00000492270 MAPKBP1O60336 1514 aa41.33■■■■■ 4.21
UPF3A-209ENST00000492270 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.3■■■■■ 4.2
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UPF3A-209ENST00000492270 KIF21BO75037 1637 aa41.24■■■■■ 4.19
UPF3A-209ENST00000492270 UACAQ9BZF9 1416 aa41.22■■■■■ 4.19
UPF3A-209ENST00000492270 ABCC2Q92887 1545 aa41.22■■■■■ 4.19
UPF3A-209ENST00000492270 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.21■■■■■ 4.19
UPF3A-209ENST00000492270 DIP2BQ9P265 1576 aa41.18■■■■■ 4.18
UPF3A-209ENST00000492270 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.16■■■■■ 4.18
UPF3A-209ENST00000492270 SAMD9Q5K651 1589 aa41.1■■■■■ 4.17
UPF3A-209ENST00000492270 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.08■■■■■ 4.17
UPF3A-209ENST00000492270 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.17
UPF3A-209ENST00000492270 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.04■■■■■ 4.16
UPF3A-209ENST00000492270 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.04■■■■■ 4.16
UPF3A-209ENST00000492270 ABCA8O94911 1581 aa41.03■■■■■ 4.16
UPF3A-209ENST00000492270 P3H3Q8IVL6 736 aa41■■■■■ 4.15
UPF3A-209ENST00000492270 ASXL2Q76L83 1435 aa41■■■■■ 4.15
UPF3A-209ENST00000492270 TSPOAP1O95153 1857 aa40.95■■■■■ 4.15
UPF3A-209ENST00000492270 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.93■■■■■ 4.14
UPF3A-209ENST00000492270 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.92■■■■■ 4.14
UPF3A-209ENST00000492270 GLI2P10070 1586 aa40.82■■■■■ 4.12
UPF3A-209ENST00000492270 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.8■■■■■ 4.12
UPF3A-209ENST00000492270 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.78■■■■■ 4.12
UPF3A-209ENST00000492270 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.77■■■■■ 4.12
UPF3A-209ENST00000492270 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
UPF3A-209ENST00000492270 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
UPF3A-209ENST00000492270 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
UPF3A-209ENST00000492270 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.73■■■■■ 4.11
UPF3A-209ENST00000492270 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.7■■■■■ 4.11
UPF3A-209ENST00000492270 ARID3CA6NKF2 412 aa40.67■■■■■ 4.1
UPF3A-209ENST00000492270 ATP10BO94823 1461 aa40.64■■■■■ 4.1
UPF3A-209ENST00000492270 KDM6BO15054 1643 aa40.6■■■■■ 4.09
UPF3A-209ENST00000492270 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
UPF3A-209ENST00000492270 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.55■■■■■ 4.08
UPF3A-209ENST00000492270 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.52■■■■■ 4.08
UPF3A-209ENST00000492270 KCNH8Q96L42 1107 aa40.49■■■■■ 4.07
UPF3A-209ENST00000492270 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.39■■■■■ 4.06
UPF3A-209ENST00000492270 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
UPF3A-209ENST00000492270 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
UPF3A-209ENST00000492270 CD109Q6YHK3 1445 aa40.36■■■■■ 4.05
UPF3A-209ENST00000492270 FMN1Q68DA7 1419 aa40.34■■■■■ 4.05
UPF3A-209ENST00000492270 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.34■■■■■ 4.05
UPF3A-209ENST00000492270 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.04
UPF3A-209ENST00000492270 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.32■■■■■ 4.04
UPF3A-209ENST00000492270 HECW1Q76N89 1606 aa40.31■■■■■ 4.04
UPF3A-209ENST00000492270 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.28■■■■■ 4.04
UPF3A-209ENST00000492270 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.25■■■■■ 4.03
UPF3A-209ENST00000492270 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
UPF3A-209ENST00000492270 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
UPF3A-209ENST00000492270 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.16■■■■■ 4.02
UPF3A-209ENST00000492270 CLIP1P30622 1438 aa40.15■■■■■ 4.02
UPF3A-209ENST00000492270 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.09■■■■■ 4.01
UPF3A-209ENST00000492270 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.09■■■■■ 4.01
UPF3A-209ENST00000492270 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.02■■■■■ 4
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UPF3A-209ENST00000492270 KIF14Q15058 1648 aa39.95■■■■□ 3.99
UPF3A-209ENST00000492270 FYCO1Q9BQS8 1478 aa39.94■■■■□ 3.98
UPF3A-209ENST00000492270 CCDC18Q5T9S5 1454 aa39.9■■■■□ 3.98
UPF3A-209ENST00000492270 CEP162Q5TB80 1403 aa39.9■■■■□ 3.98
UPF3A-209ENST00000492270 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
UPF3A-209ENST00000492270 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.88■■■■□ 3.97
UPF3A-209ENST00000492270 PHLDB1Q86UU1 1377 aa39.87■■■■□ 3.97
UPF3A-209ENST00000492270 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
UPF3A-209ENST00000492270 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
UPF3A-209ENST00000492270 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.87■■■■□ 3.97
UPF3A-209ENST00000492270 FANCAO15360 1455 aa39.84■■■■□ 3.97
UPF3A-209ENST00000492270 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.84■■■■□ 3.97
UPF3A-209ENST00000492270 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.83■■■■□ 3.97
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UPF3A-209ENST00000492270 PLCH2O75038 1416 aa39.75■■■■□ 3.95
UPF3A-209ENST00000492270 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.75■■■■□ 3.95
UPF3A-209ENST00000492270 RAPGEF3O95398 923 aa39.75■■■■□ 3.95
UPF3A-209ENST00000492270 ADGRL1O94910 1474 aa39.69■■■■□ 3.94
UPF3A-209ENST00000492270 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.68■■■■□ 3.94
UPF3A-209ENST00000492270 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.67■■■■□ 3.94
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UPF3A-209ENST00000492270 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.61■■■■□ 3.93
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