RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492135.5

NOP56-216, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOP56, Length 1,143 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-216ENST00000492135 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.17■■□□□ 1.46
NOP56-216ENST00000492135 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.13■■□□□ 1.45
NOP56-216ENST00000492135 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.13■■□□□ 1.45
NOP56-216ENST00000492135 JPH4Q96JJ6 628 aa24.1■■□□□ 1.45
NOP56-216ENST00000492135 PRXQ9BXM0 1461 aa24.08■■□□□ 1.45
NOP56-216ENST00000492135 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
NOP56-216ENST00000492135 IQGAP2Q13576 1575 aa24.01■■□□□ 1.43
NOP56-216ENST00000492135 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24■■□□□ 1.43
NOP56-216ENST00000492135 EEA1Q15075 1411 aa24■■□□□ 1.43
NOP56-216ENST00000492135 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.95■■□□□ 1.43
NOP56-216ENST00000492135 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
NOP56-216ENST00000492135 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.89■■□□□ 1.41
NOP56-216ENST00000492135 DISP1Q96F81 1524 aa23.88■■□□□ 1.41
NOP56-216ENST00000492135 KIF21BO75037 1637 aa23.83■■□□□ 1.41
NOP56-216ENST00000492135 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.82■■□□□ 1.4
NOP56-216ENST00000492135 KIAA0556O60303 1618 aa23.81■■□□□ 1.4
NOP56-216ENST00000492135 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.78■■□□□ 1.4
NOP56-216ENST00000492135 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.77■■□□□ 1.4
NOP56-216ENST00000492135 PTPRGP23470 1445 aa23.76■■□□□ 1.39
NOP56-216ENST00000492135 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
NOP56-216ENST00000492135 GOLGA3Q08378 1498 aa23.68■■□□□ 1.38
NOP56-216ENST00000492135 SAMD9Q5K651 1589 aa23.65■■□□□ 1.38
NOP56-216ENST00000492135 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.65■■□□□ 1.38
NOP56-216ENST00000492135 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
NOP56-216ENST00000492135 UACAQ9BZF9 1416 aa23.62■■□□□ 1.37
NOP56-216ENST00000492135 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.62■■□□□ 1.37
NOP56-216ENST00000492135 ABCC2Q92887 1545 aa23.6■■□□□ 1.37
NOP56-216ENST00000492135 P3H3Q8IVL6 736 aa23.58■■□□□ 1.37
NOP56-216ENST00000492135 MAPKBP1O60336 1514 aa23.58■■□□□ 1.36
NOP56-216ENST00000492135 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.57■■□□□ 1.36
NOP56-216ENST00000492135 ABCA8O94911 1581 aa23.56■■□□□ 1.36
NOP56-216ENST00000492135 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
NOP56-216ENST00000492135 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
NOP56-216ENST00000492135 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.54■■□□□ 1.36
NOP56-216ENST00000492135 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
NOP56-216ENST00000492135 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.51■■□□□ 1.35
NOP56-216ENST00000492135 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
NOP56-216ENST00000492135 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.5■■□□□ 1.35
NOP56-216ENST00000492135 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.49■■□□□ 1.35
NOP56-216ENST00000492135 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.47■■□□□ 1.35
NOP56-216ENST00000492135 DIP2BQ9P265 1576 aa23.47■■□□□ 1.35
NOP56-216ENST00000492135 ASXL2Q76L83 1435 aa23.44■■□□□ 1.34
NOP56-216ENST00000492135 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.42■■□□□ 1.34
NOP56-216ENST00000492135 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.41■■□□□ 1.34
NOP56-216ENST00000492135 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.39■■□□□ 1.33
NOP56-216ENST00000492135 ATP10BO94823 1461 aa23.35■■□□□ 1.33
NOP56-216ENST00000492135 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
NOP56-216ENST00000492135 ARID3CA6NKF2 412 aa23.33■■□□□ 1.33
NOP56-216ENST00000492135 GLI2P10070 1586 aa23.31■■□□□ 1.32
NOP56-216ENST00000492135 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
NOP56-216ENST00000492135 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.3■■□□□ 1.32
NOP56-216ENST00000492135 TSPOAP1O95153 1857 aa23.28■■□□□ 1.32
NOP56-216ENST00000492135 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
NOP56-216ENST00000492135 FMN1Q68DA7 1419 aa23.24■■□□□ 1.31
NOP56-216ENST00000492135 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.23■■□□□ 1.31
NOP56-216ENST00000492135 CLIP1P30622 1438 aa23.22■■□□□ 1.31
NOP56-216ENST00000492135 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.2■■□□□ 1.3
NOP56-216ENST00000492135 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
NOP56-216ENST00000492135 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.17■■□□□ 1.3
NOP56-216ENST00000492135 KCNH8Q96L42 1107 aa23.17■■□□□ 1.3
NOP56-216ENST00000492135 HECW1Q76N89 1606 aa23.17■■□□□ 1.3
NOP56-216ENST00000492135 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
NOP56-216ENST00000492135 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.14■■□□□ 1.29
NOP56-216ENST00000492135 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
NOP56-216ENST00000492135 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
NOP56-216ENST00000492135 CEP162Q5TB80 1403 aa23.13■■□□□ 1.29
NOP56-216ENST00000492135 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
NOP56-216ENST00000492135 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.09■■□□□ 1.29
NOP56-216ENST00000492135 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.09■■□□□ 1.29
NOP56-216ENST00000492135 CD109Q6YHK3 1445 aa23.08■■□□□ 1.28
NOP56-216ENST00000492135 KDM6BO15054 1643 aa23.07■■□□□ 1.28
NOP56-216ENST00000492135 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.05■■□□□ 1.28
NOP56-216ENST00000492135 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.05■■□□□ 1.28
NOP56-216ENST00000492135 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.04■■□□□ 1.28
NOP56-216ENST00000492135 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.03■■□□□ 1.28
NOP56-216ENST00000492135 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
NOP56-216ENST00000492135 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
NOP56-216ENST00000492135 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.99■■□□□ 1.27
NOP56-216ENST00000492135 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.98■■□□□ 1.27
NOP56-216ENST00000492135 KIF14Q15058 1648 aa22.96■■□□□ 1.27
NOP56-216ENST00000492135 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
NOP56-216ENST00000492135 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
NOP56-216ENST00000492135 NEO1Q92859 1461 aa22.86■■□□□ 1.25
NOP56-216ENST00000492135 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.86■■□□□ 1.25
NOP56-216ENST00000492135 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.84■■□□□ 1.25
NOP56-216ENST00000492135 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.84■■□□□ 1.25
NOP56-216ENST00000492135 PLCH2O75038 1416 aa22.82■■□□□ 1.24
NOP56-216ENST00000492135 FANCAO15360 1455 aa22.82■■□□□ 1.24
NOP56-216ENST00000492135 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.8■■□□□ 1.24
NOP56-216ENST00000492135 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.8■■□□□ 1.24
NOP56-216ENST00000492135 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.79■■□□□ 1.24
NOP56-216ENST00000492135 AKNAQ7Z591 1439 aa22.78■■□□□ 1.24
NOP56-216ENST00000492135 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.78■■□□□ 1.24
NOP56-216ENST00000492135 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.76■■□□□ 1.23
NOP56-216ENST00000492135 TIAM1Q13009 1591 aa22.75■■□□□ 1.23
NOP56-216ENST00000492135 PREX2Q70Z35 1606 aa22.75■■□□□ 1.23
NOP56-216ENST00000492135 RAPGEF3O95398 923 aa22.74■■□□□ 1.23
NOP56-216ENST00000492135 RICTORQ6R327 1708 aa22.74■■□□□ 1.23
NOP56-216ENST00000492135 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.73■■□□□ 1.23
NOP56-216ENST00000492135 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.72■■□□□ 1.23
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