RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
ATG4B-222ENST00000491867 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.24■■□□□ 1.63
ATG4B-222ENST00000491867 MAPKBP1O60336 1514 aa25.22■■□□□ 1.63
ATG4B-222ENST00000491867 DIP2BQ9P265 1576 aa25.21■■□□□ 1.63
ATG4B-222ENST00000491867 KDM6BO15054 1643 aa25.18■■□□□ 1.62
ATG4B-222ENST00000491867 TOP2BQ02880 1626 aa25.17■■□□□ 1.62
ATG4B-222ENST00000491867 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.15■■□□□ 1.62
ATG4B-222ENST00000491867 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.14■■□□□ 1.61
ATG4B-222ENST00000491867 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.11■■□□□ 1.61
ATG4B-222ENST00000491867 TSPOAP1O95153 1857 aa25.1■■□□□ 1.61
ATG4B-222ENST00000491867 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
ATG4B-222ENST00000491867 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.94■■□□□ 1.58
ATG4B-222ENST00000491867 ADGRL1O94910 1474 aa24.92■■□□□ 1.58
ATG4B-222ENST00000491867 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
ATG4B-222ENST00000491867 PTPRGP23470 1445 aa24.89■■□□□ 1.58
ATG4B-222ENST00000491867 ASXL2Q76L83 1435 aa24.83■■□□□ 1.57
ATG4B-222ENST00000491867 IGF1RP08069 1367 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-222ENST00000491867 ABCC2Q92887 1545 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4B-222ENST00000491867 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.81■■□□□ 1.56
ATG4B-222ENST00000491867 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
ATG4B-222ENST00000491867 GLI2P10070 1586 aa24.79■■□□□ 1.56
ATG4B-222ENST00000491867 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.79■■□□□ 1.56
ATG4B-222ENST00000491867 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ATG4B-222ENST00000491867 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.77■■□□□ 1.56
ATG4B-222ENST00000491867 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.73■■□□□ 1.55
ATG4B-222ENST00000491867 CUL7Q14999 1698 aa24.71■■□□□ 1.55
ATG4B-222ENST00000491867 KIF27Q86VH2 1401 aa24.7■■□□□ 1.55
ATG4B-222ENST00000491867 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.68■■□□□ 1.54
ATG4B-222ENST00000491867 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
ATG4B-222ENST00000491867 UACAQ9BZF9 1416 aa24.65■■□□□ 1.54
ATG4B-222ENST00000491867 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.64■■□□□ 1.53
ATG4B-222ENST00000491867 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.63■■□□□ 1.53
ATG4B-222ENST00000491867 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.61■■□□□ 1.53
ATG4B-222ENST00000491867 IQGAP2Q13576 1575 aa24.58■■□□□ 1.52
ATG4B-222ENST00000491867 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.57■■□□□ 1.52
ATG4B-222ENST00000491867 DISP1Q96F81 1524 aa24.55■■□□□ 1.52
ATG4B-222ENST00000491867 FBXO41Q8TF61 875 aa24.53■■□□□ 1.52
ATG4B-222ENST00000491867 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
ATG4B-222ENST00000491867 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.45■■□□□ 1.5
ATG4B-222ENST00000491867 CD109Q6YHK3 1445 aa24.41■■□□□ 1.5
ATG4B-222ENST00000491867 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.4■■□□□ 1.5
ATG4B-222ENST00000491867 KCNH8Q96L42 1107 aa24.38■■□□□ 1.49
ATG4B-222ENST00000491867 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.38■■□□□ 1.49
ATG4B-222ENST00000491867 KIAA0556O60303 1618 aa24.35■■□□□ 1.49
ATG4B-222ENST00000491867 KIF21BO75037 1637 aa24.33■■□□□ 1.49
ATG4B-222ENST00000491867 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.3■■□□□ 1.48
ATG4B-222ENST00000491867 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.3■■□□□ 1.48
ATG4B-222ENST00000491867 PTPRMP28827 1452 aa24.24■■□□□ 1.47
ATG4B-222ENST00000491867 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.21■■□□□ 1.47
ATG4B-222ENST00000491867 ABCA8O94911 1581 aa24.2■■□□□ 1.46
ATG4B-222ENST00000491867 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.18■■□□□ 1.46
ATG4B-222ENST00000491867 GOLGA3Q08378 1498 aa24.15■■□□□ 1.46
ATG4B-222ENST00000491867 ARID3CA6NKF2 412 aa24.12■■□□□ 1.45
ATG4B-222ENST00000491867 RAPGEF3O95398 923 aa24.12■■□□□ 1.45
ATG4B-222ENST00000491867 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
ATG4B-222ENST00000491867 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.09■■□□□ 1.45
ATG4B-222ENST00000491867 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
ATG4B-222ENST00000491867 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.08■■□□□ 1.45
ATG4B-222ENST00000491867 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.05■■□□□ 1.44
ATG4B-222ENST00000491867 MADDQ8WXG6 1647 aa24.04■■□□□ 1.44
ATG4B-222ENST00000491867 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.04■■□□□ 1.44
ATG4B-222ENST00000491867 ATP10BO94823 1461 aa24.03■■□□□ 1.44
ATG4B-222ENST00000491867 HSPA2P54652 639 aa24.01■■□□□ 1.43
ATG4B-222ENST00000491867 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24■■□□□ 1.43
ATG4B-222ENST00000491867 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
ATG4B-222ENST00000491867 NEO1Q92859 1461 aa23.98■■□□□ 1.43
ATG4B-222ENST00000491867 P3H3Q8IVL6 736 aa23.97■■□□□ 1.43
ATG4B-222ENST00000491867 CERKQ8TCT0 537 aa23.95■■□□□ 1.42
ATG4B-222ENST00000491867 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.95■■□□□ 1.42
ATG4B-222ENST00000491867 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.94■■□□□ 1.42
ATG4B-222ENST00000491867 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
ATG4B-222ENST00000491867 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
ATG4B-222ENST00000491867 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
ATG4B-222ENST00000491867 ILDR2Q71H61 639 aa23.87■■□□□ 1.41
ATG4B-222ENST00000491867 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.87■■□□□ 1.41
ATG4B-222ENST00000491867 PRXQ9BXM0 1461 aa23.87■■□□□ 1.41
ATG4B-222ENST00000491867 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.85■■□□□ 1.41
ATG4B-222ENST00000491867 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
ATG4B-222ENST00000491867 SOCS7O14512 581 aa23.82■■□□□ 1.4
ATG4B-222ENST00000491867 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.82■■□□□ 1.4
ATG4B-222ENST00000491867 AKNAQ7Z591 1439 aa23.79■■□□□ 1.4
ATG4B-222ENST00000491867 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.78■■□□□ 1.4
ATG4B-222ENST00000491867 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.78■■□□□ 1.4
ATG4B-222ENST00000491867 FANCAO15360 1455 aa23.78■■□□□ 1.4
ATG4B-222ENST00000491867 RICTORQ6R327 1708 aa23.78■■□□□ 1.4
ATG4B-222ENST00000491867 MLECQ14165 292 aa23.76■■□□□ 1.39
ATG4B-222ENST00000491867 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.74■■□□□ 1.39
ATG4B-222ENST00000491867 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
ATG4B-222ENST00000491867 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.71■■□□□ 1.39
ATG4B-222ENST00000491867 SAMD9Q5K651 1589 aa23.71■■□□□ 1.39
ATG4B-222ENST00000491867 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.71■■□□□ 1.39
ATG4B-222ENST00000491867 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.71■■□□□ 1.39
ATG4B-222ENST00000491867 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.7■■□□□ 1.38
ATG4B-222ENST00000491867 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.68■■□□□ 1.38
ATG4B-222ENST00000491867 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.66■■□□□ 1.38
ATG4B-222ENST00000491867 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.65■■□□□ 1.38
ATG4B-222ENST00000491867 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.65■■□□□ 1.38
ATG4B-222ENST00000491867 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.65■■□□□ 1.38
ATG4B-222ENST00000491867 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
ATG4B-222ENST00000491867 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
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