RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491426.3

PDE4DIP-216, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, humanhuman

TSL 2

Gene PDE4DIP, Length 670 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIP-216ENST00000491426 NUP160Q12769 1436 aa21.14■□□□□ 0.98
PDE4DIP-216ENST00000491426 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.13■□□□□ 0.97
PDE4DIP-216ENST00000491426 CEP170Q5SW79 1584 aa21.1■□□□□ 0.97
PDE4DIP-216ENST00000491426 CEP162Q5TB80 1403 aa21.1■□□□□ 0.97
PDE4DIP-216ENST00000491426 IQGAP2Q13576 1575 aa21.08■□□□□ 0.97
PDE4DIP-216ENST00000491426 CLIP1P30622 1438 aa21.05■□□□□ 0.96
PDE4DIP-216ENST00000491426 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
PDE4DIP-216ENST00000491426 OSCARQ8IYS5 282 aa21.02■□□□□ 0.96
PDE4DIP-216ENST00000491426 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.99■□□□□ 0.95
PDE4DIP-216ENST00000491426 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.99■□□□□ 0.95
PDE4DIP-216ENST00000491426 JPH4Q96JJ6 628 aa20.98■□□□□ 0.95
PDE4DIP-216ENST00000491426 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.95■□□□□ 0.94
PDE4DIP-216ENST00000491426 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.94■□□□□ 0.94
PDE4DIP-216ENST00000491426 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.93■□□□□ 0.94
PDE4DIP-216ENST00000491426 SAMD9Q5K651 1589 aa20.92■□□□□ 0.94
PDE4DIP-216ENST00000491426 SHROOM2Q13796 1616 aa20.89■□□□□ 0.94
PDE4DIP-216ENST00000491426 P3H3Q8IVL6 736 aa20.86■□□□□ 0.93
PDE4DIP-216ENST00000491426 DISP1Q96F81 1524 aa20.86■□□□□ 0.93
PDE4DIP-216ENST00000491426 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
PDE4DIP-216ENST00000491426 KIAA0556O60303 1618 aa20.86■□□□□ 0.93
PDE4DIP-216ENST00000491426 ARAP1Q96P48 1450 aa20.85■□□□□ 0.93
PDE4DIP-216ENST00000491426 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.82■□□□□ 0.92
PDE4DIP-216ENST00000491426 FMN1Q68DA7 1419 aa20.82■□□□□ 0.92
PDE4DIP-216ENST00000491426 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.82■□□□□ 0.92
PDE4DIP-216ENST00000491426 PTPRGP23470 1445 aa20.71■□□□□ 0.91
PDE4DIP-216ENST00000491426 APLP2Q06481 763 aa20.69■□□□□ 0.9
PDE4DIP-216ENST00000491426 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.69■□□□□ 0.9
PDE4DIP-216ENST00000491426 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
PDE4DIP-216ENST00000491426 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.68■□□□□ 0.9
PDE4DIP-216ENST00000491426 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.68■□□□□ 0.9
PDE4DIP-216ENST00000491426 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
PDE4DIP-216ENST00000491426 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
PDE4DIP-216ENST00000491426 HECW1Q76N89 1606 aa20.61■□□□□ 0.89
PDE4DIP-216ENST00000491426 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.61■□□□□ 0.89
PDE4DIP-216ENST00000491426 ARHGEF11O15085 1522 aa20.6■□□□□ 0.89
PDE4DIP-216ENST00000491426 ABCA8O94911 1581 aa20.59■□□□□ 0.89
PDE4DIP-216ENST00000491426 PLB1Q6P1J6 1458 aa20.58■□□□□ 0.89
PDE4DIP-216ENST00000491426 UACAQ9BZF9 1416 aa20.58■□□□□ 0.88
PDE4DIP-216ENST00000491426 MAP3K1Q13233 1512 aa20.58■□□□□ 0.88
PDE4DIP-216ENST00000491426 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.56■□□□□ 0.88
PDE4DIP-216ENST00000491426 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.53■□□□□ 0.88
PDE4DIP-216ENST00000491426 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.53■□□□□ 0.88
PDE4DIP-216ENST00000491426 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.53■□□□□ 0.88
PDE4DIP-216ENST00000491426 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.53■□□□□ 0.88
PDE4DIP-216ENST00000491426 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PDE4DIP-216ENST00000491426 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
PDE4DIP-216ENST00000491426 ABCC2Q92887 1545 aa20.52■□□□□ 0.87
PDE4DIP-216ENST00000491426 TIAM1Q13009 1591 aa20.51■□□□□ 0.87
PDE4DIP-216ENST00000491426 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PDE4DIP-216ENST00000491426 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.48■□□□□ 0.87
PDE4DIP-216ENST00000491426 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PDE4DIP-216ENST00000491426 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PDE4DIP-216ENST00000491426 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.46■□□□□ 0.87
PDE4DIP-216ENST00000491426 ATP10BO94823 1461 aa20.43■□□□□ 0.86
PDE4DIP-216ENST00000491426 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.43■□□□□ 0.86
PDE4DIP-216ENST00000491426 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
PDE4DIP-216ENST00000491426 ARID3CA6NKF2 412 aa20.42■□□□□ 0.86
PDE4DIP-216ENST00000491426 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
PDE4DIP-216ENST00000491426 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.42■□□□□ 0.86
PDE4DIP-216ENST00000491426 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.42■□□□□ 0.86
PDE4DIP-216ENST00000491426 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4DIP-216ENST00000491426 ADCY10Q96PN6 1610 aa20.41■□□□□ 0.86
PDE4DIP-216ENST00000491426 PLEKHD1A6NEE1 506 aa20.4■□□□□ 0.86
PDE4DIP-216ENST00000491426 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PDE4DIP-216ENST00000491426 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PDE4DIP-216ENST00000491426 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.37■□□□□ 0.85
PDE4DIP-216ENST00000491426 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PDE4DIP-216ENST00000491426 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.35■□□□□ 0.85
PDE4DIP-216ENST00000491426 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PDE4DIP-216ENST00000491426 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.3■□□□□ 0.84
PDE4DIP-216ENST00000491426 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PDE4DIP-216ENST00000491426 NCOA2Q15596 1464 aa20.24■□□□□ 0.83
PDE4DIP-216ENST00000491426 KIF14Q15058 1648 aa20.24■□□□□ 0.83
PDE4DIP-216ENST00000491426 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.24■□□□□ 0.83
PDE4DIP-216ENST00000491426 ASXL2Q76L83 1435 aa20.23■□□□□ 0.83
PDE4DIP-216ENST00000491426 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PDE4DIP-216ENST00000491426 MAPKBP1O60336 1514 aa20.2■□□□□ 0.82
PDE4DIP-216ENST00000491426 KCNH8Q96L42 1107 aa20.19■□□□□ 0.82
PDE4DIP-216ENST00000491426 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.18■□□□□ 0.82
PDE4DIP-216ENST00000491426 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.17■□□□□ 0.82
PDE4DIP-216ENST00000491426 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.16■□□□□ 0.82
PDE4DIP-216ENST00000491426 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.13■□□□□ 0.81
PDE4DIP-216ENST00000491426 MIA2Q96PC5 1412 aa20.12■□□□□ 0.81
PDE4DIP-216ENST00000491426 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PDE4DIP-216ENST00000491426 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.12■□□□□ 0.81
PDE4DIP-216ENST00000491426 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
PDE4DIP-216ENST00000491426 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PDE4DIP-216ENST00000491426 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.1■□□□□ 0.81
PDE4DIP-216ENST00000491426 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PDE4DIP-216ENST00000491426 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.08■□□□□ 0.8
PDE4DIP-216ENST00000491426 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
PDE4DIP-216ENST00000491426 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.06■□□□□ 0.8
PDE4DIP-216ENST00000491426 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.06■□□□□ 0.8
PDE4DIP-216ENST00000491426 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.06■□□□□ 0.8
PDE4DIP-216ENST00000491426 PLCH2O75038 1416 aa20.04■□□□□ 0.8
PDE4DIP-216ENST00000491426 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PDE4DIP-216ENST00000491426 PREX2Q70Z35 1606 aa20.04■□□□□ 0.8
PDE4DIP-216ENST00000491426 GLI2P10070 1586 aa20.04■□□□□ 0.8
PDE4DIP-216ENST00000491426 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.02■□□□□ 0.8
PDE4DIP-216ENST00000491426 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.02■□□□□ 0.8
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