RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.06■■■■□ 3.52
NELFE-210ENST00000491139 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.05■■■■□ 3.52
NELFE-210ENST00000491139 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.03■■■■□ 3.52
NELFE-210ENST00000491139 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.99■■■■□ 3.51
NELFE-210ENST00000491139 MAPKBP1O60336 1514 aa36.93■■■■□ 3.5
NELFE-210ENST00000491139 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.87■■■■□ 3.49
NELFE-210ENST00000491139 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.87■■■■□ 3.49
NELFE-210ENST00000491139 DIP2BQ9P265 1576 aa36.84■■■■□ 3.49
NELFE-210ENST00000491139 IGF1RP08069 1367 aa36.83■■■■□ 3.49
NELFE-210ENST00000491139 KIF27Q86VH2 1401 aa36.78■■■■□ 3.48
NELFE-210ENST00000491139 CUL7Q14999 1698 aa36.74■■■■□ 3.47
NELFE-210ENST00000491139 KDM6BO15054 1643 aa36.67■■■■□ 3.46
NELFE-210ENST00000491139 PTPRGP23470 1445 aa36.65■■■■□ 3.46
NELFE-210ENST00000491139 TSPOAP1O95153 1857 aa36.63■■■■□ 3.45
NELFE-210ENST00000491139 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
NELFE-210ENST00000491139 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.58■■■■□ 3.45
NELFE-210ENST00000491139 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.56■■■■□ 3.44
NELFE-210ENST00000491139 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.55■■■■□ 3.44
NELFE-210ENST00000491139 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.53■■■■□ 3.44
NELFE-210ENST00000491139 ABCC2Q92887 1545 aa36.49■■■■□ 3.43
NELFE-210ENST00000491139 ASXL2Q76L83 1435 aa36.42■■■■□ 3.42
NELFE-210ENST00000491139 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.42■■■■□ 3.42
NELFE-210ENST00000491139 IQGAP2Q13576 1575 aa36.41■■■■□ 3.42
NELFE-210ENST00000491139 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.36■■■■□ 3.41
NELFE-210ENST00000491139 GLI2P10070 1586 aa36.36■■■■□ 3.41
NELFE-210ENST00000491139 UACAQ9BZF9 1416 aa36.34■■■■□ 3.41
NELFE-210ENST00000491139 DISP1Q96F81 1524 aa36.29■■■■□ 3.4
NELFE-210ENST00000491139 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
NELFE-210ENST00000491139 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.2■■■■□ 3.39
NELFE-210ENST00000491139 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
NELFE-210ENST00000491139 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.18■■■■□ 3.38
NELFE-210ENST00000491139 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.17■■■■□ 3.38
NELFE-210ENST00000491139 ADGRL1O94910 1474 aa36.12■■■■□ 3.37
NELFE-210ENST00000491139 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
NELFE-210ENST00000491139 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.12■■■■□ 3.37
NELFE-210ENST00000491139 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.11■■■■□ 3.37
NELFE-210ENST00000491139 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
NELFE-210ENST00000491139 KIAA0556O60303 1618 aa36.08■■■■□ 3.37
NELFE-210ENST00000491139 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.98■■■■□ 3.35
NELFE-210ENST00000491139 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
NELFE-210ENST00000491139 GOLGA3Q08378 1498 aa35.87■■■■□ 3.33
NELFE-210ENST00000491139 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.85■■■■□ 3.33
NELFE-210ENST00000491139 CD109Q6YHK3 1445 aa35.84■■■■□ 3.33
NELFE-210ENST00000491139 KCNH8Q96L42 1107 aa35.84■■■■□ 3.33
NELFE-210ENST00000491139 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.81■■■■□ 3.32
NELFE-210ENST00000491139 ABCA8O94911 1581 aa35.79■■■■□ 3.32
NELFE-210ENST00000491139 HECW2Q9P2P5 1572 aa35.78■■■■□ 3.32
NELFE-210ENST00000491139 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.78■■■■□ 3.32
NELFE-210ENST00000491139 PRXQ9BXM0 1461 aa35.67■■■■□ 3.3
NELFE-210ENST00000491139 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
NELFE-210ENST00000491139 ARID3CA6NKF2 412 aa35.57■■■■□ 3.28
NELFE-210ENST00000491139 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.55■■■■□ 3.28
NELFE-210ENST00000491139 P3H3Q8IVL6 736 aa35.54■■■■□ 3.28
NELFE-210ENST00000491139 KIF21BO75037 1637 aa35.52■■■■□ 3.28
NELFE-210ENST00000491139 ATP10BO94823 1461 aa35.52■■■■□ 3.28
NELFE-210ENST00000491139 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.47■■■■□ 3.27
NELFE-210ENST00000491139 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.42■■■■□ 3.26
NELFE-210ENST00000491139 RAPGEF3O95398 923 aa35.36■■■■□ 3.25
NELFE-210ENST00000491139 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
NELFE-210ENST00000491139 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
NELFE-210ENST00000491139 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.32■■■■□ 3.24
NELFE-210ENST00000491139 NEO1Q92859 1461 aa35.32■■■■□ 3.24
NELFE-210ENST00000491139 SAMD9Q5K651 1589 aa35.32■■■■□ 3.24
NELFE-210ENST00000491139 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.31■■■■□ 3.24
NELFE-210ENST00000491139 PTPRMP28827 1452 aa35.29■■■■□ 3.24
NELFE-210ENST00000491139 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.28■■■■□ 3.24
NELFE-210ENST00000491139 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
NELFE-210ENST00000491139 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
NELFE-210ENST00000491139 FBXO41Q8TF61 875 aa35.19■■■■□ 3.22
NELFE-210ENST00000491139 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.17■■■■□ 3.22
NELFE-210ENST00000491139 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
NELFE-210ENST00000491139 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.15■■■■□ 3.22
NELFE-210ENST00000491139 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.13■■■■□ 3.21
NELFE-210ENST00000491139 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.1■■■■□ 3.21
NELFE-210ENST00000491139 MADDQ8WXG6 1647 aa35.1■■■■□ 3.21
NELFE-210ENST00000491139 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
NELFE-210ENST00000491139 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
NELFE-210ENST00000491139 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.04■■■■□ 3.2
NELFE-210ENST00000491139 EEA1Q15075 1411 aa35.04■■■■□ 3.2
NELFE-210ENST00000491139 AKNAQ7Z591 1439 aa35.04■■■■□ 3.2
NELFE-210ENST00000491139 FANCAO15360 1455 aa35.01■■■■□ 3.19
NELFE-210ENST00000491139 LMTK3Q96Q04 1460 aa35■■■■□ 3.19
NELFE-210ENST00000491139 RICTORQ6R327 1708 aa35■■■■□ 3.19
NELFE-210ENST00000491139 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.97■■■■□ 3.19
NELFE-210ENST00000491139 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.96■■■■□ 3.193e-7■□□□□ 8.5
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NELFE-210ENST00000491139 POGZQ7Z3K3 1410 aa34.93■■■■□ 3.18
NELFE-210ENST00000491139 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.9■■■■□ 3.18
NELFE-210ENST00000491139 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.89■■■■□ 3.18
NELFE-210ENST00000491139 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.88■■■■□ 3.17
NELFE-210ENST00000491139 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.87■■■■□ 3.17
NELFE-210ENST00000491139 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa34.86■■■■□ 3.17
NELFE-210ENST00000491139 MAGI2Q86UL8 1455 aa34.84■■■■□ 3.17
NELFE-210ENST00000491139 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.84■■■■□ 3.17
NELFE-210ENST00000491139 HSPA2P54652 639 aa34.84■■■■□ 3.17
NELFE-210ENST00000491139 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
NELFE-210ENST00000491139 MLECQ14165 292 aa34.79■■■■□ 3.16
NELFE-210ENST00000491139 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.78■■■■□ 3.16
NELFE-210ENST00000491139 PLCH2O75038 1416 aa34.77■■■■□ 3.16
NELFE-210ENST00000491139 HECW1Q76N89 1606 aa34.77■■■■□ 3.16
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