RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.76■■■■■ 6.04
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NELFE-210ENST00000491139 NACADO15069 1562 aa45.07■■■■■ 4.8
NELFE-210ENST00000491139 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.84■■■■■ 4.77
NELFE-210ENST00000491139 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.66■■■■■ 4.74
NELFE-210ENST00000491139 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.38■■■■■ 4.7
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NELFE-210ENST00000491139 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.54■■■■■ 4.56
NELFE-210ENST00000491139 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.32■■■■■ 4.53
NELFE-210ENST00000491139 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.31■■■■■ 4.52
NELFE-210ENST00000491139 SCRIBQ14160 1630 aa43.28■■■■■ 4.52
NELFE-210ENST00000491139 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
NELFE-210ENST00000491139 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.11■■■■■ 4.33
NELFE-210ENST00000491139 NCAPD3P42695 1498 aa41.63■■■■■ 4.25
NELFE-210ENST00000491139 CUX2O14529 1486 aa41.57■■■■■ 4.25
NELFE-210ENST00000491139 ERCC6Q03468 1493 aa41.51■■■■■ 4.24
NELFE-210ENST00000491139 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.42■■■■■ 4.22
NELFE-210ENST00000491139 SMARCA2P51531 1590 aa41.29■■■■■ 4.2
NELFE-210ENST00000491139 HMGXB3Q12766 1538 aa41.24■■■■■ 4.19
NELFE-210ENST00000491139 SMARCA4P51532 1647 aa41.24■■■■■ 4.19
NELFE-210ENST00000491139 NESP48681 1621 aa41.1■■■■■ 4.17
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NELFE-210ENST00000491139 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
NELFE-210ENST00000491139 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.74■■■■■ 4.11
NELFE-210ENST00000491139 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.65■■■■■ 4.1
NELFE-210ENST00000491139 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.57■■■■■ 4.08
NELFE-210ENST00000491139 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.51■■■■■ 4.08
NELFE-210ENST00000491139 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.35■■■■■ 4.05
NELFE-210ENST00000491139 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.21■■■■■ 4.03
NELFE-210ENST00000491139 WIZO95785 1651 aa40.11■■■■■ 4.01
NELFE-210ENST00000491139 WDR62O43379 1518 aa40.1■■■■■ 4.01
NELFE-210ENST00000491139 TRIM41Q8WV44 630 aa40.08■■■■■ 4.01
NELFE-210ENST00000491139 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.96■■■■□ 3.99
NELFE-210ENST00000491139 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.88■■■■□ 3.98
NELFE-210ENST00000491139 CFTRP13569 1480 aa39.78■■■■□ 3.96
NELFE-210ENST00000491139 OSCARQ8IYS5 282 aa39.66■■■■□ 3.94
NELFE-210ENST00000491139 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
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NELFE-210ENST00000491139 IFT140Q96RY7 1462 aa39.19■■■■□ 3.86
NELFE-210ENST00000491139 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.17■■■■□ 3.86
NELFE-210ENST00000491139 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.15■■■■□ 3.86
NELFE-210ENST00000491139 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.1■■■■□ 3.85
NELFE-210ENST00000491139 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.1■■■■□ 3.85
NELFE-210ENST00000491139 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.1■■■■□ 3.85
NELFE-210ENST00000491139 TOPBP1Q92547 1522 aa39.07■■■■□ 3.84
NELFE-210ENST00000491139 ABCC8Q09428 1581 aa38.99■■■■□ 3.83
NELFE-210ENST00000491139 ARHGEF11O15085 1522 aa38.95■■■■□ 3.83
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NELFE-210ENST00000491139 CHD1O14646 1710 aa38.68■■■■□ 3.78
NELFE-210ENST00000491139 FBLN2P98095 1184 aa38.66■■■■□ 3.78
NELFE-210ENST00000491139 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.63■■■■□ 3.77
NELFE-210ENST00000491139 ARAP1Q96P48 1450 aa38.53■■■■□ 3.76
NELFE-210ENST00000491139 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.51■■■■□ 3.76
NELFE-210ENST00000491139 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.49■■■■□ 3.75
NELFE-210ENST00000491139 SOGA1O94964 1423 aa38.48■■■■□ 3.75
NELFE-210ENST00000491139 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.47■■■■□ 3.75
NELFE-210ENST00000491139 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.34■■■■□ 3.73
NELFE-210ENST00000491139 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.33■■■■□ 3.73
NELFE-210ENST00000491139 WDR97A6NE52 1622 aa38.3■■■■□ 3.72
NELFE-210ENST00000491139 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.3■■■■□ 3.72
NELFE-210ENST00000491139 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.23■■■■□ 3.71
NELFE-210ENST00000491139 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.22■■■■□ 3.71
NELFE-210ENST00000491139 CUX1P39880 1505 aa38.21■■■■□ 3.71
NELFE-210ENST00000491139 SYNJ1O43426 1573 aa38.2■■■■□ 3.71
NELFE-210ENST00000491139 GRIN2BQ13224 1484 aa38.19■■■■□ 3.7
NELFE-210ENST00000491139 SYNJ2O15056 1496 aa38.11■■■■□ 3.69
NELFE-210ENST00000491139 GAPVD1Q14C86 1478 aa38■■■■□ 3.67
NELFE-210ENST00000491139 PBRM1Q86U86 1689 aa37.95■■■■□ 3.66
NELFE-210ENST00000491139 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.87■■■■□ 3.65
NELFE-210ENST00000491139 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.82■■■■□ 3.64
NELFE-210ENST00000491139 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
NELFE-210ENST00000491139 GRIN2AQ12879 1464 aa37.69■■■■□ 3.62
NELFE-210ENST00000491139 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.67■■■■□ 3.62
NELFE-210ENST00000491139 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.61
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NELFE-210ENST00000491139 NUP160Q12769 1436 aa37.58■■■■□ 3.61
NELFE-210ENST00000491139 ADAMTS12P58397 1594 aa37.57■■■■□ 3.6
NELFE-210ENST00000491139 CEP170Q5SW79 1584 aa37.54■■■■□ 3.6
NELFE-210ENST00000491139 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.51■■■■□ 3.59
NELFE-210ENST00000491139 TOP2BQ02880 1626 aa37.47■■■■□ 3.59
NELFE-210ENST00000491139 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.46■■■■□ 3.59
NELFE-210ENST00000491139 SHROOM2Q13796 1616 aa37.43■■■■□ 3.58
NELFE-210ENST00000491139 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.39■■■■□ 3.58
NELFE-210ENST00000491139 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
NELFE-210ENST00000491139 JPH4Q96JJ6 628 aa37.25■■■■□ 3.55
NELFE-210ENST00000491139 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.17■■■■□ 3.54
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