RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490316.6

MTMR1-211, Transcript of myotubularin related protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MTMR1, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1-211ENST00000490316 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa50.35■■■■■ 5.65
MTMR1-211ENST00000490316 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP50.33■■■■■ 5.65
MTMR1-211ENST00000490316 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa50.17■■■■■ 5.62
MTMR1-211ENST00000490316 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa50.16■■■■■ 5.62
MTMR1-211ENST00000490316 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa49.78■■■■■ 5.56
MTMR1-211ENST00000490316 IQGAP2Q13576 1575 aa49.75■■■■■ 5.55
MTMR1-211ENST00000490316 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP49.68■■■■■ 5.54
MTMR1-211ENST00000490316 ADCY10Q96PN6 1610 aa49.67■■■■■ 5.54
MTMR1-211ENST00000490316 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa49.67■■■■■ 5.54
MTMR1-211ENST00000490316 PTPRGP23470 1445 aa49.61■■■■■ 5.53
MTMR1-211ENST00000490316 TNIKQ9UKE5 1360 aa49.56■■■■■ 5.52
MTMR1-211ENST00000490316 KIF13AQ9H1H9 1805 aa49.55■■■■■ 5.52
MTMR1-211ENST00000490316 MAPKBP1O60336 1514 aa49.54■■■■■ 5.52
MTMR1-211ENST00000490316 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP49.5■■■■■ 5.51
MTMR1-211ENST00000490316 DISP1Q96F81 1524 aa49.47■■■■■ 5.51
MTMR1-211ENST00000490316 UGGT2Q9NYU1 1516 aa49.45■■■■■ 5.51
MTMR1-211ENST00000490316 ABCC10Q5T3U5 1492 aa49.43■■■■■ 5.5
MTMR1-211ENST00000490316 FAM69CQ0P6D2 419 aa49.38■■■■■ 5.5
MTMR1-211ENST00000490316 PRXQ9BXM0 1461 aa49.37■■■■■ 5.49
MTMR1-211ENST00000490316 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa49.35■■■■■ 5.49
MTMR1-211ENST00000490316 DIP2BQ9P265 1576 aa49.31■■■■■ 5.48
MTMR1-211ENST00000490316 KIAA0556O60303 1618 aa49.28■■■■■ 5.48
MTMR1-211ENST00000490316 ABCC2Q92887 1545 aa49.28■■■■■ 5.48
MTMR1-211ENST00000490316 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa49.25■■■■■ 5.48
MTMR1-211ENST00000490316 UACAQ9BZF9 1416 aa49.25■■■■■ 5.47
MTMR1-211ENST00000490316 CSRNP3Q8WYN3 585 aa49.14■■■■■ 5.46
MTMR1-211ENST00000490316 GOLGA3Q08378 1498 aa49.11■■■■■ 5.45
MTMR1-211ENST00000490316 ASXL2Q76L83 1435 aa49.06■■■■■ 5.44
MTMR1-211ENST00000490316 PLB1Q6P1J6 1458 aa49.04■■■■■ 5.44
MTMR1-211ENST00000490316 KDM5BQ9UGL1 1544 aa49.03■■■■■ 5.44
MTMR1-211ENST00000490316 EEA1Q15075 1411 aa49.01■■■■■ 5.44
MTMR1-211ENST00000490316 TSPOAP1O95153 1857 aa48.93■■■■■ 5.42
MTMR1-211ENST00000490316 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP48.92■■■■■ 5.42
MTMR1-211ENST00000490316 GLI2P10070 1586 aa48.88■■■■■ 5.42
MTMR1-211ENST00000490316 ABCA8O94911 1581 aa48.81■■■■■ 5.4
MTMR1-211ENST00000490316 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP48.78■■■■■ 5.4
MTMR1-211ENST00000490316 KDM6BO15054 1643 aa48.77■■■■■ 5.4
MTMR1-211ENST00000490316 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP48.77■■■■■ 5.4
MTMR1-211ENST00000490316 P3H3Q8IVL6 736 aa48.72■■■■■ 5.39
MTMR1-211ENST00000490316 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP48.67■■■■■ 5.38
MTMR1-211ENST00000490316 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP48.67■■■■■ 5.38
MTMR1-211ENST00000490316 SAMD9Q5K651 1589 aa48.67■■■■■ 5.38
MTMR1-211ENST00000490316 WDR7Q9Y4E6 1490 aa48.66■■■■■ 5.38
MTMR1-211ENST00000490316 CHIC1Q5VXU3 224 aa48.65■■■■■ 5.38
MTMR1-211ENST00000490316 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa48.62■■■■■ 5.37
MTMR1-211ENST00000490316 KIF21BO75037 1637 aa48.58■■■■■ 5.37
MTMR1-211ENST00000490316 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP48.48■■■■■ 5.35
MTMR1-211ENST00000490316 TEX14Q8IWB6 1497 aa48.46■■■■■ 5.35
MTMR1-211ENST00000490316 KCNH8Q96L42 1107 aa48.44■■■■■ 5.34
MTMR1-211ENST00000490316 ATP10BO94823 1461 aa48.42■■■■■ 5.34
MTMR1-211ENST00000490316 ARID3CA6NKF2 412 aa48.4■■■■■ 5.34
MTMR1-211ENST00000490316 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa48.39■■■■■ 5.34
MTMR1-211ENST00000490316 CFAP43Q8NDM7 1665 aa48.35■■■■■ 5.33
MTMR1-211ENST00000490316 FHOD3Q2V2M9 1422 aa48.34■■■■■ 5.33
MTMR1-211ENST00000490316 CD109Q6YHK3 1445 aa48.32■■■■■ 5.33
MTMR1-211ENST00000490316 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP48.31■■■■■ 5.32
MTMR1-211ENST00000490316 EFCAB5A4FU69 1503 aa48.27■■■■■ 5.32
MTMR1-211ENST00000490316 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa48.27■■■■■ 5.32
MTMR1-211ENST00000490316 UBTFP17480 764 aaKnown RBP48.22■■■■■ 5.31
MTMR1-211ENST00000490316 EHMT2Q96KQ7 1210 aa48.22■■■■■ 5.31
MTMR1-211ENST00000490316 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP48.2■■■■■ 5.31
MTMR1-211ENST00000490316 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP48.17■■■■■ 5.3
MTMR1-211ENST00000490316 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP48.17■■■■■ 5.3
MTMR1-211ENST00000490316 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa48.07■■■■■ 5.29
MTMR1-211ENST00000490316 ABCA9Q8IUA7 1624 aa48.07■■■■■ 5.29
MTMR1-211ENST00000490316 PLEKHD1A6NEE1 506 aa47.94■■■■■ 5.26
MTMR1-211ENST00000490316 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa47.91■■■■■ 5.26
MTMR1-211ENST00000490316 ARAP3Q8WWN8 1544 aa47.88■■■■■ 5.26
MTMR1-211ENST00000490316 FMN1Q68DA7 1419 aa47.86■■■■■ 5.25
MTMR1-211ENST00000490316 PHLDB1Q86UU1 1377 aa47.85■■■■■ 5.25
MTMR1-211ENST00000490316 ADGRL1O94910 1474 aa47.79■■■■■ 5.24
MTMR1-211ENST00000490316 NEO1Q92859 1461 aa47.78■■■■■ 5.24
MTMR1-211ENST00000490316 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP47.77■■■■■ 5.24
MTMR1-211ENST00000490316 HECW1Q76N89 1606 aa47.72■■■■■ 5.23
MTMR1-211ENST00000490316 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP47.72■■■■■ 5.23
MTMR1-211ENST00000490316 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP47.68■■■■■ 5.22
MTMR1-211ENST00000490316 RAPGEF3O95398 923 aa47.6■■■■■ 5.21
MTMR1-211ENST00000490316 TTC37Q6PGP7 1564 aa47.59■■■■■ 5.21
MTMR1-211ENST00000490316 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP47.54■■■■■ 5.2
MTMR1-211ENST00000490316 FANCAO15360 1455 aa47.53■■■■■ 5.2
MTMR1-211ENST00000490316 CFAP74Q9C0B2 1584 aa47.52■■■■■ 5.2
MTMR1-211ENST00000490316 AKNAQ7Z591 1439 aa47.5■■■■■ 5.19
MTMR1-211ENST00000490316 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa47.49■■■■■ 5.19
MTMR1-211ENST00000490316 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa47.44■■■■■ 5.18
MTMR1-211ENST00000490316 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP47.43■■■■■ 5.18
MTMR1-211ENST00000490316 PLCH2O75038 1416 aa47.4■■■■■ 5.18
MTMR1-211ENST00000490316 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa47.39■■■■■ 5.18
MTMR1-211ENST00000490316 RICTORQ6R327 1708 aa47.37■■■■■ 5.17
MTMR1-211ENST00000490316 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP47.37■■■■■ 5.17
MTMR1-211ENST00000490316 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP47.36■■■■■ 5.17
MTMR1-211ENST00000490316 CLIP1P30622 1438 aa47.34■■■■■ 5.17
MTMR1-211ENST00000490316 KIF14Q15058 1648 aa47.33■■■■■ 5.17
MTMR1-211ENST00000490316 MYO5CQ9NQX4 1742 aa47.3■■■■■ 5.16
MTMR1-211ENST00000490316 CCDC18Q5T9S5 1454 aa47.28■■■■■ 5.16
MTMR1-211ENST00000490316 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa47.23■■■■■ 5.15
MTMR1-211ENST00000490316 FYCO1Q9BQS8 1478 aa47.21■■■■■ 5.15
MTMR1-211ENST00000490316 SCAPERQ9BY12 1400 aa47.21■■■■■ 5.15
MTMR1-211ENST00000490316 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa47.2■■■■■ 5.15
MTMR1-211ENST00000490316 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa47.2■■■■■ 5.15
MTMR1-211ENST00000490316 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP47.14■■■■■ 5.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.7 ms