RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		29.64	■■■□□ 2.34
HDAC10-216	ENST00000489424	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		29.64	■■■□□ 2.33
HDAC10-216	ENST00000489424	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	29.62	■■■□□ 2.33
HDAC10-216	ENST00000489424	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		29.58	■■■□□ 2.33
HDAC10-216	ENST00000489424	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		29.4	■■■□□ 2.3
HDAC10-216	ENST00000489424	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		29.35	■■■□□ 2.29
HDAC10-216	ENST00000489424	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	29.31	■■■□□ 2.28
HDAC10-216	ENST00000489424	IQGAP2	Q13576	1575 aa		29.29	■■■□□ 2.28
HDAC10-216	ENST00000489424	PTPRG	P23470	1445 aa		29.27	■■■□□ 2.28
HDAC10-216	ENST00000489424	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		29.26	■■■□□ 2.28
HDAC10-216	ENST00000489424	PRX	Q9BXM0	1461 aa		29.21	■■■□□ 2.27
HDAC10-216	ENST00000489424	MAPKBP1	O60336	1514 aa		29.2	■■■□□ 2.26
HDAC10-216	ENST00000489424	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		29.2	■■■□□ 2.26
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		29.18	■■■□□ 2.26
HDAC10-216	ENST00000489424	DISP1	Q96F81	1524 aa		29.14	■■■□□ 2.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		29.13	■■■□□ 2.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		29.12	■■■□□ 2.25
HDAC10-216	ENST00000489424	EEA1	Q15075	1411 aa		29.11	■■■□□ 2.25
HDAC10-216	ENST00000489424	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		29.11	■■■□□ 2.25
HDAC10-216	ENST00000489424	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		29.09	■■■□□ 2.25
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCC2	Q92887	1545 aa		29.05	■■■□□ 2.24
HDAC10-216	ENST00000489424	UACA	Q9BZF9	1416 aa		29.05	■■■□□ 2.24
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA3	Q08378	1498 aa		29.04	■■■□□ 2.24
HDAC10-216	ENST00000489424	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		29.03	■■■□□ 2.24
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.98	■■■□□ 2.23
HDAC10-216	ENST00000489424	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		28.96	■■■□□ 2.23
HDAC10-216	ENST00000489424	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		28.95	■■■□□ 2.22
HDAC10-216	ENST00000489424	DIP2B	Q9P265	1576 aa		28.94	■■■□□ 2.22
HDAC10-216	ENST00000489424	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		28.94	■■■□□ 2.22
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPOAP1	O95153	1857 aa		28.88	■■■□□ 2.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ASXL2	Q76L83	1435 aa		28.87	■■■□□ 2.21
HDAC10-216	ENST00000489424	GLI2	P10070	1586 aa		28.82	■■■□□ 2.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		28.79	■■■□□ 2.2
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCA8	O94911	1581 aa		28.75	■■■□□ 2.19
HDAC10-216	ENST00000489424	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
HDAC10-216	ENST00000489424	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
HDAC10-216	ENST00000489424	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF21B	O75037	1637 aa		28.68	■■■□□ 2.18
HDAC10-216	ENST00000489424	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.67	■■■□□ 2.18
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		28.67	■■■□□ 2.18
HDAC10-216	ENST00000489424	KDM6B	O15054	1643 aa		28.65	■■■□□ 2.18
HDAC10-216	ENST00000489424	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	28.59	■■■□□ 2.17
HDAC10-216	ENST00000489424	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.59	■■■□□ 2.17
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		28.59	■■■□□ 2.17
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		28.55	■■■□□ 2.16
HDAC10-216	ENST00000489424	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.53	■■■□□ 2.16
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP10B	O94823	1461 aa		28.53	■■■□□ 2.16
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		28.49	■■■□□ 2.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CD109	Q6YHK3	1445 aa		28.48	■■■□□ 2.15
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNH8	Q96L42	1107 aa		28.46	■■■□□ 2.15
HDAC10-216	ENST00000489424	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		28.45	■■■□□ 2.14
HDAC10-216	ENST00000489424	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
HDAC10-216	ENST00000489424	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.43	■■■□□ 2.14
HDAC10-216	ENST00000489424	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		28.42	■■■□□ 2.14
HDAC10-216	ENST00000489424	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	28.4	■■■□□ 2.14
HDAC10-216	ENST00000489424	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		28.4	■■■□□ 2.14
HDAC10-216	ENST00000489424	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	28.37	■■■□□ 2.13
HDAC10-216	ENST00000489424	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.36	■■■□□ 2.13
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		28.34	■■■□□ 2.13
HDAC10-216	ENST00000489424	ARID3C	A6NKF2	412 aa		28.34	■■■□□ 2.13
HDAC10-216	ENST00000489424	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.34	■■■□□ 2.13
HDAC10-216	ENST00000489424	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
HDAC10-216	ENST00000489424	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		28.29	■■■□□ 2.12
HDAC10-216	ENST00000489424	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		28.27	■■■□□ 2.12
HDAC10-216	ENST00000489424	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		28.26	■■■□□ 2.11
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.26	■■■□□ 2.11
HDAC10-216	ENST00000489424	NEO1	Q92859	1461 aa		28.22	■■■□□ 2.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	28.19	■■■□□ 2.1
HDAC10-216	ENST00000489424	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		28.17	■■■□□ 2.1
HDAC10-216	ENST00000489424	HECW1	Q76N89	1606 aa		28.1	■■■□□ 2.09
HDAC10-216	ENST00000489424	ADGRL1	O94910	1474 aa		28.08	■■■□□ 2.09
HDAC10-216	ENST00000489424	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	28.05	■■■□□ 2.08	1e-6	■□□□□ 10.3
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
HDAC10-216	ENST00000489424	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.02	■■■□□ 2.08
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
HDAC10-216	ENST00000489424	PLCH2	O75038	1416 aa		28.01	■■■□□ 2.07
HDAC10-216	ENST00000489424	FANCA	O15360	1455 aa		28	■■■□□ 2.07
HDAC10-216	ENST00000489424	AKNA	Q7Z591	1439 aa		28	■■■□□ 2.07
HDAC10-216	ENST00000489424	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		27.98	■■■□□ 2.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		27.97	■■■□□ 2.07
HDAC10-216	ENST00000489424	RAPGEF3	O95398	923 aa		27.97	■■■□□ 2.07
HDAC10-216	ENST00000489424	CLIP1	P30622	1438 aa		27.97	■■■□□ 2.07
HDAC10-216	ENST00000489424	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
HDAC10-216	ENST00000489424	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		27.93	■■■□□ 2.06
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		27.92	■■■□□ 2.06
HDAC10-216	ENST00000489424	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		27.9	■■■□□ 2.06
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		27.88	■■■□□ 2.05
HDAC10-216	ENST00000489424	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		27.86	■■■□□ 2.05
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF14	Q15058	1648 aa		27.85	■■■□□ 2.05
HDAC10-216	ENST00000489424	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		27.82	■■■□□ 2.04
HDAC10-216	ENST00000489424	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		27.82	■■■□□ 2.04
HDAC10-216	ENST00000489424	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
HDAC10-216	ENST00000489424	RICTOR	Q6R327	1708 aa		27.79	■■■□□ 2.04
HDAC10-216	ENST00000489424	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		27.77	■■■□□ 2.04
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		27.76	■■■□□ 2.03
HDAC10-216	ENST00000489424	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		27.75	■■■□□ 2.03

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