RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		42.6	■■■■■ 4.41
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		38.03	■■■■□ 3.68
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCC9	O60706	1549 aa		37.57	■■■■□ 3.61
HDAC10-216	ENST00000489424	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		36.04	■■■■□ 3.36
HDAC10-216	ENST00000489424	NACAD	O15069	1562 aa		35.95	■■■■□ 3.35
HDAC10-216	ENST00000489424	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		35.74	■■■■□ 3.31
HDAC10-216	ENST00000489424	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		35.64	■■■■□ 3.3
HDAC10-216	ENST00000489424	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	35.38	■■■■□ 3.25
HDAC10-216	ENST00000489424	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		35.37	■■■■□ 3.25
HDAC10-216	ENST00000489424	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		35.17	■■■■□ 3.22
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		35.08	■■■■□ 3.21
HDAC10-216	ENST00000489424	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	35.01	■■■■□ 3.2
HDAC10-216	ENST00000489424	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		34.88	■■■■□ 3.17
HDAC10-216	ENST00000489424	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		34.76	■■■■□ 3.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SCRIB	Q14160	1630 aa		34.48	■■■■□ 3.11
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	34.02	■■■■□ 3.04
HDAC10-216	ENST00000489424	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		33.97	■■■■□ 3.03
HDAC10-216	ENST00000489424	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		33.85	■■■■□ 3.01
HDAC10-216	ENST00000489424	NCAPD3	P42695	1498 aa		33.24	■■■□□ 2.91
HDAC10-216	ENST00000489424	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		33.09	■■■□□ 2.89
HDAC10-216	ENST00000489424	SMARCA4	P51532	1647 aa		33.06	■■■□□ 2.88
HDAC10-216	ENST00000489424	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
HDAC10-216	ENST00000489424	SMARCA2	P51531	1590 aa		33.05	■■■□□ 2.88
HDAC10-216	ENST00000489424	HMGXB3	Q12766	1538 aa		32.96	■■■□□ 2.87
HDAC10-216	ENST00000489424	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		32.89	■■■□□ 2.86
HDAC10-216	ENST00000489424	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
HDAC10-216	ENST00000489424	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		32.73	■■■□□ 2.83
HDAC10-216	ENST00000489424	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.43	■■■□□ 2.78
HDAC10-216	ENST00000489424	CUX2	O14529	1486 aa		32.39	■■■□□ 2.78
HDAC10-216	ENST00000489424	NES	P48681	1621 aa		32.35	■■■□□ 2.77
HDAC10-216	ENST00000489424	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		32.34	■■■□□ 2.77
HDAC10-216	ENST00000489424	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
HDAC10-216	ENST00000489424	WIZ	O95785	1651 aa		32.25	■■■□□ 2.75
HDAC10-216	ENST00000489424	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		32.21	■■■□□ 2.75
HDAC10-216	ENST00000489424	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		32.21	■■■□□ 2.75
HDAC10-216	ENST00000489424	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		32.03	■■■□□ 2.72
HDAC10-216	ENST00000489424	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	32.03	■■■□□ 2.72
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		32.01	■■■□□ 2.71
HDAC10-216	ENST00000489424	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	31.97	■■■□□ 2.71
HDAC10-216	ENST00000489424	CFTR	P13569	1480 aa		31.91	■■■□□ 2.7
HDAC10-216	ENST00000489424	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		31.8	■■■□□ 2.68
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		31.75	■■■□□ 2.67
HDAC10-216	ENST00000489424	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		31.74	■■■□□ 2.67
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR62	O43379	1518 aa		31.7	■■■□□ 2.67
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		31.66	■■■□□ 2.66
HDAC10-216	ENST00000489424	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
HDAC10-216	ENST00000489424	PRDM2	Q13029	1718 aa		31.41	■■■□□ 2.62
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCC8	Q09428	1581 aa		31.33	■■■□□ 2.61
HDAC10-216	ENST00000489424	IFT140	Q96RY7	1462 aa		31.17	■■■□□ 2.58
HDAC10-216	ENST00000489424	TOPBP1	Q92547	1522 aa		31.17	■■■□□ 2.58
HDAC10-216	ENST00000489424	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		31.1	■■■□□ 2.57
HDAC10-216	ENST00000489424	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.01	■■■□□ 2.55
HDAC10-216	ENST00000489424	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		30.99	■■■□□ 2.55
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	30.91	■■■□□ 2.54
HDAC10-216	ENST00000489424	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	30.89	■■■□□ 2.53
HDAC10-216	ENST00000489424	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	30.84	■■■□□ 2.53
HDAC10-216	ENST00000489424	SOGA1	O94964	1423 aa		30.8	■■■□□ 2.52
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM41	Q8WV44	630 aa		30.79	■■■□□ 2.52
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	30.74	■■■□□ 2.51
HDAC10-216	ENST00000489424	CUX1	P39880	1505 aa		30.73	■■■□□ 2.51
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR97	A6NE52	1622 aa		30.73	■■■□□ 2.51
HDAC10-216	ENST00000489424	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	30.73	■■■□□ 2.51	1e-8	■■■□□ 18.9
HDAC10-216	ENST00000489424	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		30.7	■■■□□ 2.51
HDAC10-216	ENST00000489424	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		30.68	■■■□□ 2.5
HDAC10-216	ENST00000489424	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	30.61	■■■□□ 2.49
HDAC10-216	ENST00000489424	CHD1	O14646	1710 aa		30.53	■■■□□ 2.48
HDAC10-216	ENST00000489424	GRIN2B	Q13224	1484 aa		30.5	■■■□□ 2.47
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		30.49	■■■□□ 2.47
HDAC10-216	ENST00000489424	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	30.49	■■■□□ 2.47
HDAC10-216	ENST00000489424	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	30.47	■■■□□ 2.47
HDAC10-216	ENST00000489424	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		30.47	■■■□□ 2.47
HDAC10-216	ENST00000489424	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		30.47	■■■□□ 2.47
HDAC10-216	ENST00000489424	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		30.47	■■■□□ 2.47
HDAC10-216	ENST00000489424	FBLN2	P98095	1184 aa		30.42	■■■□□ 2.46
HDAC10-216	ENST00000489424	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		30.42	■■■□□ 2.46
HDAC10-216	ENST00000489424	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		30.41	■■■□□ 2.46
HDAC10-216	ENST00000489424	TOP2B	Q02880	1626 aa		30.4	■■■□□ 2.46
HDAC10-216	ENST00000489424	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	30.39	■■■□□ 2.46
HDAC10-216	ENST00000489424	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		30.36	■■■□□ 2.45
HDAC10-216	ENST00000489424	SYNJ2	O15056	1496 aa		30.35	■■■□□ 2.45
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGEF11	O15085	1522 aa		30.35	■■■□□ 2.45
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		30.29	■■■□□ 2.44
HDAC10-216	ENST00000489424	SYNJ1	O43426	1573 aa		30.25	■■■□□ 2.43
HDAC10-216	ENST00000489424	PBRM1	Q86U86	1689 aa		30.22	■■■□□ 2.43
HDAC10-216	ENST00000489424	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		30.19	■■■□□ 2.42
HDAC10-216	ENST00000489424	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		30.13	■■■□□ 2.41
HDAC10-216	ENST00000489424	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		30.13	■■■□□ 2.41
HDAC10-216	ENST00000489424	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		30.11	■■■□□ 2.41
HDAC10-216	ENST00000489424	GRIN2A	Q12879	1464 aa		30.06	■■■□□ 2.4
HDAC10-216	ENST00000489424	ARAP1	Q96P48	1450 aa		30.06	■■■□□ 2.4
HDAC10-216	ENST00000489424	NUP160	Q12769	1436 aa		30.02	■■■□□ 2.4
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAMTS12	P58397	1594 aa		30.02	■■■□□ 2.4
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF27	Q86VH2	1401 aa		29.9	■■■□□ 2.38
HDAC10-216	ENST00000489424	IGF1R	P08069	1367 aa		29.85	■■■□□ 2.37
HDAC10-216	ENST00000489424	CEP170	Q5SW79	1584 aa		29.84	■■■□□ 2.37
HDAC10-216	ENST00000489424	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
HDAC10-216	ENST00000489424	SHROOM2	Q13796	1616 aa		29.75	■■■□□ 2.35
HDAC10-216	ENST00000489424	JPH4	Q96JJ6	628 aa		29.73	■■■□□ 2.35
HDAC10-216	ENST00000489424	CUL7	Q14999	1698 aa		29.69	■■■□□ 2.34
HDAC10-216	ENST00000489424	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		29.68	■■■□□ 2.34

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