RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485896.5

C1orf35-205, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

TSL 2

Gene C1orf35, Length 1,429 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-205ENST00000485896 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.04■■■■□ 3.2
C1orf35-205ENST00000485896 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35■■■■□ 3.19
C1orf35-205ENST00000485896 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa34.99■■■■□ 3.19
C1orf35-205ENST00000485896 JPH4Q96JJ6 628 aa34.97■■■■□ 3.19
C1orf35-205ENST00000485896 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
C1orf35-205ENST00000485896 PRXQ9BXM0 1461 aa34.87■■■■□ 3.17
C1orf35-205ENST00000485896 EEA1Q15075 1411 aa34.83■■■■□ 3.17
C1orf35-205ENST00000485896 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.83■■■■□ 3.17
C1orf35-205ENST00000485896 IQGAP2Q13576 1575 aa34.82■■■■□ 3.17
C1orf35-205ENST00000485896 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
C1orf35-205ENST00000485896 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.71■■■■□ 3.15
C1orf35-205ENST00000485896 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa34.62■■■■□ 3.13
C1orf35-205ENST00000485896 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.61■■■■□ 3.13
C1orf35-205ENST00000485896 DISP1Q96F81 1524 aa34.57■■■■□ 3.12
C1orf35-205ENST00000485896 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
C1orf35-205ENST00000485896 KIF21BO75037 1637 aa34.53■■■■□ 3.12
C1orf35-205ENST00000485896 TNIKQ9UKE5 1360 aa34.51■■■■□ 3.12
C1orf35-205ENST00000485896 PTPRGP23470 1445 aa34.5■■■■□ 3.11
C1orf35-205ENST00000485896 KIAA0556O60303 1618 aa34.5■■■■□ 3.11
C1orf35-205ENST00000485896 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
C1orf35-205ENST00000485896 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.43■■■■□ 3.1
C1orf35-205ENST00000485896 ADCY10Q96PN6 1610 aa34.43■■■■□ 3.1
C1orf35-205ENST00000485896 GOLGA3Q08378 1498 aa34.4■■■■□ 3.1
C1orf35-205ENST00000485896 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
C1orf35-205ENST00000485896 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP34.3■■■■□ 3.08
C1orf35-205ENST00000485896 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
C1orf35-205ENST00000485896 UACAQ9BZF9 1416 aa34.26■■■■□ 3.08
C1orf35-205ENST00000485896 P3H3Q8IVL6 736 aa34.26■■■■□ 3.07
C1orf35-205ENST00000485896 SAMD9Q5K651 1589 aa34.25■■■■□ 3.07
C1orf35-205ENST00000485896 ABCC2Q92887 1545 aa34.22■■■■□ 3.07
C1orf35-205ENST00000485896 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.21■■■■□ 3.07
C1orf35-205ENST00000485896 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.18■■■■□ 3.06
C1orf35-205ENST00000485896 MAPKBP1O60336 1514 aa34.17■■■■□ 3.06
C1orf35-205ENST00000485896 ABCA8O94911 1581 aa34.1■■■■□ 3.05
C1orf35-205ENST00000485896 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.09■■■■□ 3.05
C1orf35-205ENST00000485896 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.07■■■■□ 3.05
C1orf35-205ENST00000485896 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.06■■■■□ 3.04
C1orf35-205ENST00000485896 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.06■■■■□ 3.04
C1orf35-205ENST00000485896 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
C1orf35-205ENST00000485896 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.02■■■■□ 3.04
C1orf35-205ENST00000485896 ASXL2Q76L83 1435 aa34■■■■□ 3.03
C1orf35-205ENST00000485896 DIP2BQ9P265 1576 aa34■■■■□ 3.03
C1orf35-205ENST00000485896 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.98■■■■□ 3.03
C1orf35-205ENST00000485896 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa33.94■■■■□ 3.02
C1orf35-205ENST00000485896 ARID3CA6NKF2 412 aa33.93■■■■□ 3.02
C1orf35-205ENST00000485896 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.92■■■■□ 3.02
C1orf35-205ENST00000485896 ATP10BO94823 1461 aa33.82■■■■□ 3
C1orf35-205ENST00000485896 WDR7Q9Y4E6 1490 aa33.82■■■■□ 3
C1orf35-205ENST00000485896 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
C1orf35-205ENST00000485896 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
C1orf35-205ENST00000485896 TSPOAP1O95153 1857 aa33.78■■■■□ 3
C1orf35-205ENST00000485896 GLI2P10070 1586 aa33.75■■■□□ 2.99
C1orf35-205ENST00000485896 FMN1Q68DA7 1419 aa33.75■■■□□ 2.99
C1orf35-205ENST00000485896 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
C1orf35-205ENST00000485896 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
C1orf35-205ENST00000485896 CLIP1P30622 1438 aa33.72■■■□□ 2.99
C1orf35-205ENST00000485896 KCNH8Q96L42 1107 aa33.7■■■□□ 2.98
C1orf35-205ENST00000485896 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
C1orf35-205ENST00000485896 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.65■■■□□ 2.98
C1orf35-205ENST00000485896 HECW1Q76N89 1606 aa33.63■■■□□ 2.97
C1orf35-205ENST00000485896 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa33.63■■■□□ 2.97
C1orf35-205ENST00000485896 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
C1orf35-205ENST00000485896 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
C1orf35-205ENST00000485896 CEP162Q5TB80 1403 aa33.58■■■□□ 2.97
C1orf35-205ENST00000485896 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.55■■■□□ 2.96
C1orf35-205ENST00000485896 CFAP43Q8NDM7 1665 aa33.54■■■□□ 2.96
C1orf35-205ENST00000485896 CD109Q6YHK3 1445 aa33.51■■■□□ 2.96
C1orf35-205ENST00000485896 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.51■■■□□ 2.95
C1orf35-205ENST00000485896 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.5■■■□□ 2.95
C1orf35-205ENST00000485896 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa33.48■■■□□ 2.95
C1orf35-205ENST00000485896 TEX14Q8IWB6 1497 aa33.47■■■□□ 2.95
C1orf35-205ENST00000485896 KDM6BO15054 1643 aa33.47■■■□□ 2.95
C1orf35-205ENST00000485896 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.46■■■□□ 2.95
C1orf35-205ENST00000485896 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.43■■■□□ 2.94
C1orf35-205ENST00000485896 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa33.42■■■□□ 2.94
C1orf35-205ENST00000485896 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.37■■■□□ 2.93
C1orf35-205ENST00000485896 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
C1orf35-205ENST00000485896 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.33■■■□□ 2.93
C1orf35-205ENST00000485896 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.31■■■□□ 2.92
C1orf35-205ENST00000485896 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
C1orf35-205ENST00000485896 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.29■■■□□ 2.92
C1orf35-205ENST00000485896 KIF14Q15058 1648 aa33.25■■■□□ 2.91
C1orf35-205ENST00000485896 NEO1Q92859 1461 aa33.16■■■□□ 2.9
C1orf35-205ENST00000485896 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.15■■■□□ 2.9
C1orf35-205ENST00000485896 FANCAO15360 1455 aa33.13■■■□□ 2.89
C1orf35-205ENST00000485896 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.13■■■□□ 2.89
C1orf35-205ENST00000485896 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.12■■■□□ 2.89
C1orf35-205ENST00000485896 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.11■■■□□ 2.89
C1orf35-205ENST00000485896 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.1■■■□□ 2.89
C1orf35-205ENST00000485896 PLCH2O75038 1416 aa33.09■■■□□ 2.89
C1orf35-205ENST00000485896 AKNAQ7Z591 1439 aa33.05■■■□□ 2.88
C1orf35-205ENST00000485896 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.05■■■□□ 2.88
C1orf35-205ENST00000485896 RAPGEF3O95398 923 aa33.02■■■□□ 2.88
C1orf35-205ENST00000485896 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.01■■■□□ 2.88
C1orf35-205ENST00000485896 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa32.97■■■□□ 2.87
C1orf35-205ENST00000485896 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.97■■■□□ 2.87
C1orf35-205ENST00000485896 PREX2Q70Z35 1606 aa32.97■■■□□ 2.87
C1orf35-205ENST00000485896 TIAM1Q13009 1591 aa32.96■■■□□ 2.87
C1orf35-205ENST00000485896 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa32.96■■■□□ 2.87
C1orf35-205ENST00000485896 ADGRL1O94910 1474 aa32.96■■■□□ 2.87
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