RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484894.5

POLR2F-210, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 4

Gene POLR2F, Length 551 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-210ENST00000484894 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.37■■□□□ 1.33
POLR2F-210ENST00000484894 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.37■■□□□ 1.33
POLR2F-210ENST00000484894 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.33■■□□□ 1.33
POLR2F-210ENST00000484894 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.31■■□□□ 1.32
POLR2F-210ENST00000484894 JPH4Q96JJ6 628 aa23.3■■□□□ 1.32
POLR2F-210ENST00000484894 EEA1Q15075 1411 aa23.3■■□□□ 1.32
POLR2F-210ENST00000484894 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
POLR2F-210ENST00000484894 PRXQ9BXM0 1461 aa23.3■■□□□ 1.32
POLR2F-210ENST00000484894 IQGAP2Q13576 1575 aa23.29■■□□□ 1.32
POLR2F-210ENST00000484894 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.21■■□□□ 1.31
POLR2F-210ENST00000484894 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
POLR2F-210ENST00000484894 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.15■■□□□ 1.3
POLR2F-210ENST00000484894 KIF21BO75037 1637 aa23.13■■□□□ 1.29
POLR2F-210ENST00000484894 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.11■■□□□ 1.29
POLR2F-210ENST00000484894 DISP1Q96F81 1524 aa23.09■■□□□ 1.29
POLR2F-210ENST00000484894 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
POLR2F-210ENST00000484894 KIAA0556O60303 1618 aa23.08■■□□□ 1.29
POLR2F-210ENST00000484894 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.03■■□□□ 1.28
POLR2F-210ENST00000484894 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.03■■□□□ 1.28
POLR2F-210ENST00000484894 GOLGA3Q08378 1498 aa23■■□□□ 1.27
POLR2F-210ENST00000484894 PTPRGP23470 1445 aa22.99■■□□□ 1.27
POLR2F-210ENST00000484894 SAMD9Q5K651 1589 aa22.93■■□□□ 1.26
POLR2F-210ENST00000484894 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
POLR2F-210ENST00000484894 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.88■■□□□ 1.25
POLR2F-210ENST00000484894 MAPKBP1O60336 1514 aa22.87■■□□□ 1.25
POLR2F-210ENST00000484894 ABCC2Q92887 1545 aa22.87■■□□□ 1.25
POLR2F-210ENST00000484894 UACAQ9BZF9 1416 aa22.87■■□□□ 1.25
POLR2F-210ENST00000484894 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.86■■□□□ 1.25
POLR2F-210ENST00000484894 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
POLR2F-210ENST00000484894 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.82■■□□□ 1.24
POLR2F-210ENST00000484894 ABCA8O94911 1581 aa22.81■■□□□ 1.24
POLR2F-210ENST00000484894 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
POLR2F-210ENST00000484894 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.79■■□□□ 1.24
POLR2F-210ENST00000484894 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
POLR2F-210ENST00000484894 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.78■■□□□ 1.24
POLR2F-210ENST00000484894 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.77■■□□□ 1.24
POLR2F-210ENST00000484894 P3H3Q8IVL6 736 aa22.75■■□□□ 1.23
POLR2F-210ENST00000484894 DIP2BQ9P265 1576 aa22.75■■□□□ 1.23
POLR2F-210ENST00000484894 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
POLR2F-210ENST00000484894 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.73■■□□□ 1.23
POLR2F-210ENST00000484894 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.71■■□□□ 1.23
POLR2F-210ENST00000484894 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.71■■□□□ 1.23
POLR2F-210ENST00000484894 ASXL2Q76L83 1435 aa22.67■■□□□ 1.22
POLR2F-210ENST00000484894 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.65■■□□□ 1.22
POLR2F-210ENST00000484894 TSPOAP1O95153 1857 aa22.62■■□□□ 1.21
POLR2F-210ENST00000484894 GLI2P10070 1586 aa22.61■■□□□ 1.21
POLR2F-210ENST00000484894 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.61■■□□□ 1.21
POLR2F-210ENST00000484894 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.59■■□□□ 1.21
POLR2F-210ENST00000484894 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
POLR2F-210ENST00000484894 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
POLR2F-210ENST00000484894 ATP10BO94823 1461 aa22.56■■□□□ 1.2
POLR2F-210ENST00000484894 FMN1Q68DA7 1419 aa22.55■■□□□ 1.2
POLR2F-210ENST00000484894 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.54■■□□□ 1.2
POLR2F-210ENST00000484894 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
POLR2F-210ENST00000484894 HECW1Q76N89 1606 aa22.51■■□□□ 1.19
POLR2F-210ENST00000484894 ARID3CA6NKF2 412 aa22.5■■□□□ 1.19
POLR2F-210ENST00000484894 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.49■■□□□ 1.19
POLR2F-210ENST00000484894 CLIP1P30622 1438 aa22.48■■□□□ 1.19
POLR2F-210ENST00000484894 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.46■■□□□ 1.19
POLR2F-210ENST00000484894 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
POLR2F-210ENST00000484894 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
POLR2F-210ENST00000484894 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
POLR2F-210ENST00000484894 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
POLR2F-210ENST00000484894 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.41■■□□□ 1.18
POLR2F-210ENST00000484894 KCNH8Q96L42 1107 aa22.39■■□□□ 1.17
POLR2F-210ENST00000484894 CEP162Q5TB80 1403 aa22.39■■□□□ 1.17
POLR2F-210ENST00000484894 KDM6BO15054 1643 aa22.39■■□□□ 1.17
POLR2F-210ENST00000484894 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.37■■□□□ 1.17
POLR2F-210ENST00000484894 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
POLR2F-210ENST00000484894 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.37■■□□□ 1.17
POLR2F-210ENST00000484894 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.34■■□□□ 1.17
POLR2F-210ENST00000484894 CD109Q6YHK3 1445 aa22.34■■□□□ 1.17
POLR2F-210ENST00000484894 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.34■■□□□ 1.17
POLR2F-210ENST00000484894 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.34■■□□□ 1.17
POLR2F-210ENST00000484894 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
POLR2F-210ENST00000484894 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.32■■□□□ 1.16
POLR2F-210ENST00000484894 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.31■■□□□ 1.16
POLR2F-210ENST00000484894 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.169e-7■■■■■ 32.7
POLR2F-210ENST00000484894 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.27■■□□□ 1.16
POLR2F-210ENST00000484894 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
POLR2F-210ENST00000484894 KIF14Q15058 1648 aa22.24■■□□□ 1.15
POLR2F-210ENST00000484894 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.23■■□□□ 1.15
POLR2F-210ENST00000484894 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
POLR2F-210ENST00000484894 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
POLR2F-210ENST00000484894 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.19■■□□□ 1.14
POLR2F-210ENST00000484894 NEO1Q92859 1461 aa22.17■■□□□ 1.14
POLR2F-210ENST00000484894 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.16■■□□□ 1.14
POLR2F-210ENST00000484894 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.14■■□□□ 1.14
POLR2F-210ENST00000484894 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.13■■□□□ 1.13
POLR2F-210ENST00000484894 FANCAO15360 1455 aa22.11■■□□□ 1.13
POLR2F-210ENST00000484894 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.11■■□□□ 1.13
POLR2F-210ENST00000484894 PLCH2O75038 1416 aa22.1■■□□□ 1.13
POLR2F-210ENST00000484894 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.1■■□□□ 1.13
POLR2F-210ENST00000484894 PREX2Q70Z35 1606 aa22.09■■□□□ 1.13
POLR2F-210ENST00000484894 RICTORQ6R327 1708 aa22.07■■□□□ 1.12
POLR2F-210ENST00000484894 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.06■■□□□ 1.12
POLR2F-210ENST00000484894 AKNAQ7Z591 1439 aa22.06■■□□□ 1.12
POLR2F-210ENST00000484894 TIAM1Q13009 1591 aa22.05■■□□□ 1.12
POLR2F-210ENST00000484894 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.05■■□□□ 1.12
POLR2F-210ENST00000484894 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms