RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484412.1

HDLBP-240, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 669 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-240ENST00000484412 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.42■■□□□ 1.34
HDLBP-240ENST00000484412 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.42■■□□□ 1.34
HDLBP-240ENST00000484412 PRXQ9BXM0 1461 aa23.4■■□□□ 1.34
HDLBP-240ENST00000484412 SHROOM2Q13796 1616 aa23.38■■□□□ 1.33
HDLBP-240ENST00000484412 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.29■■□□□ 1.32
HDLBP-240ENST00000484412 ARAP1Q96P48 1450 aa23.27■■□□□ 1.32
HDLBP-240ENST00000484412 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
HDLBP-240ENST00000484412 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
HDLBP-240ENST00000484412 IQGAP2Q13576 1575 aa23.17■■□□□ 1.3
HDLBP-240ENST00000484412 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.17■■□□□ 1.3
HDLBP-240ENST00000484412 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.14■■□□□ 1.3
HDLBP-240ENST00000484412 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.13■■□□□ 1.29
HDLBP-240ENST00000484412 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
HDLBP-240ENST00000484412 KIF21BO75037 1637 aa23.09■■□□□ 1.29
HDLBP-240ENST00000484412 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.07■■□□□ 1.28
HDLBP-240ENST00000484412 DISP1Q96F81 1524 aa23.07■■□□□ 1.28
HDLBP-240ENST00000484412 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.06■■□□□ 1.28
HDLBP-240ENST00000484412 PTPRGP23470 1445 aa23.03■■□□□ 1.28
HDLBP-240ENST00000484412 GOLGA3Q08378 1498 aa23.02■■□□□ 1.28
HDLBP-240ENST00000484412 KIAA0556O60303 1618 aa22.93■■□□□ 1.26
HDLBP-240ENST00000484412 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.92■■□□□ 1.26
HDLBP-240ENST00000484412 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
HDLBP-240ENST00000484412 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
HDLBP-240ENST00000484412 UACAQ9BZF9 1416 aa22.89■■□□□ 1.25
HDLBP-240ENST00000484412 SAMD9Q5K651 1589 aa22.85■■□□□ 1.25
HDLBP-240ENST00000484412 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.82■■□□□ 1.24
HDLBP-240ENST00000484412 ABCC2Q92887 1545 aa22.79■■□□□ 1.24
HDLBP-240ENST00000484412 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.78■■□□□ 1.24
HDLBP-240ENST00000484412 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.78■■□□□ 1.24
HDLBP-240ENST00000484412 MAPKBP1O60336 1514 aa22.77■■□□□ 1.24
HDLBP-240ENST00000484412 ABCA8O94911 1581 aa22.76■■□□□ 1.23
HDLBP-240ENST00000484412 P3H3Q8IVL6 736 aa22.74■■□□□ 1.23
HDLBP-240ENST00000484412 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
HDLBP-240ENST00000484412 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
HDLBP-240ENST00000484412 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.71■■□□□ 1.23
HDLBP-240ENST00000484412 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.68■■□□□ 1.22
HDLBP-240ENST00000484412 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.67■■□□□ 1.22
HDLBP-240ENST00000484412 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.64■■□□□ 1.21
HDLBP-240ENST00000484412 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.63■■□□□ 1.21
HDLBP-240ENST00000484412 FMN1Q68DA7 1419 aa22.62■■□□□ 1.21
HDLBP-240ENST00000484412 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
HDLBP-240ENST00000484412 ASXL2Q76L83 1435 aa22.61■■□□□ 1.21
HDLBP-240ENST00000484412 ATP10BO94823 1461 aa22.6■■□□□ 1.21
HDLBP-240ENST00000484412 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.59■■□□□ 1.21
HDLBP-240ENST00000484412 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
HDLBP-240ENST00000484412 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.57■■□□□ 1.2
HDLBP-240ENST00000484412 GLI2P10070 1586 aa22.56■■□□□ 1.2
HDLBP-240ENST00000484412 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.54■■□□□ 1.2
HDLBP-240ENST00000484412 CLIP1P30622 1438 aa22.54■■□□□ 1.2
HDLBP-240ENST00000484412 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.54■■□□□ 1.2
HDLBP-240ENST00000484412 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
HDLBP-240ENST00000484412 DIP2BQ9P265 1576 aa22.53■■□□□ 1.2
HDLBP-240ENST00000484412 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.5■■□□□ 1.19
HDLBP-240ENST00000484412 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
HDLBP-240ENST00000484412 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.47■■□□□ 1.19
HDLBP-240ENST00000484412 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.44■■□□□ 1.18
HDLBP-240ENST00000484412 CEP162Q5TB80 1403 aa22.42■■□□□ 1.18
HDLBP-240ENST00000484412 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HDLBP-240ENST00000484412 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
HDLBP-240ENST00000484412 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
HDLBP-240ENST00000484412 KCNH8Q96L42 1107 aa22.39■■□□□ 1.17
HDLBP-240ENST00000484412 HECW1Q76N89 1606 aa22.38■■□□□ 1.17
HDLBP-240ENST00000484412 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.36■■□□□ 1.17
HDLBP-240ENST00000484412 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.35■■□□□ 1.17
HDLBP-240ENST00000484412 ARID3CA6NKF2 412 aa22.34■■□□□ 1.17
HDLBP-240ENST00000484412 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.34■■□□□ 1.17
HDLBP-240ENST00000484412 CD109Q6YHK3 1445 aa22.33■■□□□ 1.17
HDLBP-240ENST00000484412 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.33■■□□□ 1.16
HDLBP-240ENST00000484412 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.31■■□□□ 1.16
HDLBP-240ENST00000484412 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.31■■□□□ 1.16
HDLBP-240ENST00000484412 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HDLBP-240ENST00000484412 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.3■■□□□ 1.16
HDLBP-240ENST00000484412 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.29■■□□□ 1.16
HDLBP-240ENST00000484412 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HDLBP-240ENST00000484412 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HDLBP-240ENST00000484412 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HDLBP-240ENST00000484412 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HDLBP-240ENST00000484412 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.23■■□□□ 1.15
HDLBP-240ENST00000484412 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.22■■□□□ 1.15
HDLBP-240ENST00000484412 TSPOAP1O95153 1857 aa22.21■■□□□ 1.15
HDLBP-240ENST00000484412 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
HDLBP-240ENST00000484412 NEO1Q92859 1461 aa22.17■■□□□ 1.14
HDLBP-240ENST00000484412 PLCH2O75038 1416 aa22.17■■□□□ 1.14
HDLBP-240ENST00000484412 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.16■■□□□ 1.14
HDLBP-240ENST00000484412 MAP3K1Q13233 1512 aa22.16■■□□□ 1.14
HDLBP-240ENST00000484412 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HDLBP-240ENST00000484412 KDM6BO15054 1643 aa22.11■■□□□ 1.13
HDLBP-240ENST00000484412 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.1■■□□□ 1.13
HDLBP-240ENST00000484412 KIF14Q15058 1648 aa22.07■■□□□ 1.12
HDLBP-240ENST00000484412 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.06■■□□□ 1.12
HDLBP-240ENST00000484412 AKNAQ7Z591 1439 aa22.06■■□□□ 1.12
HDLBP-240ENST00000484412 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.05■■□□□ 1.12
HDLBP-240ENST00000484412 FANCAO15360 1455 aa22.04■■□□□ 1.12
HDLBP-240ENST00000484412 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.01■■□□□ 1.11
HDLBP-240ENST00000484412 TIAM1Q13009 1591 aa22■■□□□ 1.11
HDLBP-240ENST00000484412 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
HDLBP-240ENST00000484412 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.99■■□□□ 1.11
HDLBP-240ENST00000484412 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.99■■□□□ 1.11
HDLBP-240ENST00000484412 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.97■■□□□ 1.11
HDLBP-240ENST00000484412 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
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