RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 CSRNP3Q8WYN3 585 aa54.94■■■■■ 6.39
CHKB-210ENST00000484266 SHROOM2Q13796 1616 aa54.84■■■■■ 6.37
CHKB-210ENST00000484266 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP54.84■■■■■ 6.37
CHKB-210ENST00000484266 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa54.81■■■■■ 6.36
CHKB-210ENST00000484266 JPH4Q96JJ6 628 aa54.64■■■■■ 6.34
CHKB-210ENST00000484266 ERCC6L2Q5T890 1561 aa54.62■■■■■ 6.33
CHKB-210ENST00000484266 IQGAP2Q13576 1575 aa54.59■■■■■ 6.33
CHKB-210ENST00000484266 ARAP1Q96P48 1450 aa54.59■■■■■ 6.33
CHKB-210ENST00000484266 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa54.56■■■■■ 6.32
CHKB-210ENST00000484266 KIF21BO75037 1637 aa54.55■■■■■ 6.32
CHKB-210ENST00000484266 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP54.53■■■■■ 6.32
CHKB-210ENST00000484266 CYB5RLQ6IPT4 315 aa54.39■■■■■ 6.3
CHKB-210ENST00000484266 UGGT2Q9NYU1 1516 aa54.31■■■■■ 6.28
CHKB-210ENST00000484266 GOLGA3Q08378 1498 aa54.2■■■■■ 6.27
CHKB-210ENST00000484266 DISP1Q96F81 1524 aa54.18■■■■■ 6.26
CHKB-210ENST00000484266 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa54.17■■■■■ 6.26
CHKB-210ENST00000484266 EHMT2Q96KQ7 1210 aa54.1■■■■■ 6.25
CHKB-210ENST00000484266 KIAA0556O60303 1618 aa54.08■■■■■ 6.25
CHKB-210ENST00000484266 TNIKQ9UKE5 1360 aa53.99■■■■■ 6.23
CHKB-210ENST00000484266 UBTFP17480 764 aaKnown RBP53.97■■■■■ 6.23
CHKB-210ENST00000484266 PTPRGP23470 1445 aa53.92■■■■■ 6.22
CHKB-210ENST00000484266 SAMD9Q5K651 1589 aa53.87■■■■■ 6.21
CHKB-210ENST00000484266 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP53.81■■■■■ 6.2
CHKB-210ENST00000484266 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP53.75■■■■■ 6.19
CHKB-210ENST00000484266 ADCY10Q96PN6 1610 aa53.72■■■■■ 6.19
CHKB-210ENST00000484266 P3H3Q8IVL6 736 aa53.67■■■■■ 6.18
CHKB-210ENST00000484266 EFCAB5A4FU69 1503 aa53.66■■■■■ 6.18
CHKB-210ENST00000484266 UACAQ9BZF9 1416 aa53.58■■■■■ 6.17
CHKB-210ENST00000484266 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa53.54■■■■■ 6.16
CHKB-210ENST00000484266 ABCC2Q92887 1545 aa53.52■■■■■ 6.16
CHKB-210ENST00000484266 FHOD3Q2V2M9 1422 aa53.52■■■■■ 6.16
CHKB-210ENST00000484266 PLB1Q6P1J6 1458 aa53.49■■■■■ 6.15
CHKB-210ENST00000484266 ABCA8O94911 1581 aa53.47■■■■■ 6.15
CHKB-210ENST00000484266 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa53.47■■■■■ 6.15
CHKB-210ENST00000484266 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP53.38■■■■■ 6.14
CHKB-210ENST00000484266 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa53.34■■■■■ 6.13
CHKB-210ENST00000484266 KDM5BQ9UGL1 1544 aa53.29■■■■■ 6.12
CHKB-210ENST00000484266 MAPKBP1O60336 1514 aa53.28■■■■■ 6.12
CHKB-210ENST00000484266 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa53.26■■■■■ 6.12
CHKB-210ENST00000484266 CLIP1P30622 1438 aa53.23■■■■■ 6.11
CHKB-210ENST00000484266 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP53.22■■■■■ 6.11
CHKB-210ENST00000484266 TRHP20396 242 aaPredicted RBP53.13■■■■■ 6.1
CHKB-210ENST00000484266 FMN1Q68DA7 1419 aa53.12■■■■■ 6.09
CHKB-210ENST00000484266 CEP162Q5TB80 1403 aa53.09■■■■■ 6.09
CHKB-210ENST00000484266 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP53.06■■■■■ 6.08
CHKB-210ENST00000484266 ASXL2Q76L83 1435 aa53.04■■■■■ 6.08
CHKB-210ENST00000484266 ATP10BO94823 1461 aa52.99■■■■■ 6.07
CHKB-210ENST00000484266 KIF13AQ9H1H9 1805 aa52.98■■■■■ 6.07
CHKB-210ENST00000484266 ABCC10Q5T3U5 1492 aa52.96■■■■■ 6.07
CHKB-210ENST00000484266 ARID3CA6NKF2 412 aa52.96■■■■■ 6.07
CHKB-210ENST00000484266 DIP2BQ9P265 1576 aa52.94■■■■■ 6.07
CHKB-210ENST00000484266 HECW1Q76N89 1606 aa52.88■■■■■ 6.06
CHKB-210ENST00000484266 WDR7Q9Y4E6 1490 aa52.84■■■■■ 6.05
CHKB-210ENST00000484266 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP52.82■■■■■ 6.05
CHKB-210ENST00000484266 FAM69CQ0P6D2 419 aa52.79■■■■■ 6.04
CHKB-210ENST00000484266 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa52.77■■■■■ 6.04
CHKB-210ENST00000484266 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP52.75■■■■■ 6.03
CHKB-210ENST00000484266 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP52.74■■■■■ 6.03
CHKB-210ENST00000484266 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP52.73■■■■■ 6.03
CHKB-210ENST00000484266 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP52.73■■■■■ 6.03
CHKB-210ENST00000484266 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP52.73■■■■■ 6.03
CHKB-210ENST00000484266 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa52.71■■■■■ 6.03
CHKB-210ENST00000484266 GLI2P10070 1586 aa52.7■■■■■ 6.03
CHKB-210ENST00000484266 FYCO1Q9BQS8 1478 aa52.68■■■■■ 6.02
CHKB-210ENST00000484266 KCNH8Q96L42 1107 aa52.55■■■■■ 6
CHKB-210ENST00000484266 CCDC18Q5T9S5 1454 aa52.52■■■■■ 6
CHKB-210ENST00000484266 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa52.51■■■■■ 6
CHKB-210ENST00000484266 PLEKHD1A6NEE1 506 aa52.5■■■■■ 6
CHKB-210ENST00000484266 TSPOAP1O95153 1857 aa52.49■■■■■ 5.99
CHKB-210ENST00000484266 VPS8Q8N3P4 1428 aa52.44■■■■■ 5.98
CHKB-210ENST00000484266 CFAP43Q8NDM7 1665 aa52.42■■■■■ 5.98
CHKB-210ENST00000484266 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP52.39■■■■■ 5.98
CHKB-210ENST00000484266 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP52.37■■■■■ 5.97
CHKB-210ENST00000484266 ABCA9Q8IUA7 1624 aa52.36■■■■■ 5.97
CHKB-210ENST00000484266 CD109Q6YHK3 1445 aa52.28■■■■■ 5.96
CHKB-210ENST00000484266 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP52.28■■■■■ 5.96
CHKB-210ENST00000484266 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa52.25■■■■■ 5.96
CHKB-210ENST00000484266 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP52.22■■■■■ 5.954e-7■■■□□ 18.4
CHKB-210ENST00000484266 KIF14Q15058 1648 aa52.18■■■■■ 5.94
CHKB-210ENST00000484266 TTC37Q6PGP7 1564 aa52.17■■■■■ 5.94
CHKB-210ENST00000484266 TEX14Q8IWB6 1497 aa52.16■■■■■ 5.94
CHKB-210ENST00000484266 TIAM1Q13009 1591 aa52.06■■■■■ 5.92
CHKB-210ENST00000484266 MTUS2Q5JR59 1369 aa51.98■■■■■ 5.91
CHKB-210ENST00000484266 KDM6BO15054 1643 aa51.97■■■■■ 5.91
CHKB-210ENST00000484266 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa51.96■■■■■ 5.91
CHKB-210ENST00000484266 MYO5CQ9NQX4 1742 aa51.95■■■■■ 5.91
CHKB-210ENST00000484266 MAP3K1Q13233 1512 aa51.95■■■■■ 5.91
CHKB-210ENST00000484266 PLCH2O75038 1416 aa51.88■■■■■ 5.9
CHKB-210ENST00000484266 NEO1Q92859 1461 aa51.85■■■■■ 5.89
CHKB-210ENST00000484266 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP51.83■■■■■ 5.89
CHKB-210ENST00000484266 ARAP3Q8WWN8 1544 aa51.83■■■■■ 5.89
CHKB-210ENST00000484266 FANCAO15360 1455 aa51.81■■■■■ 5.88
CHKB-210ENST00000484266 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa51.8■■■■■ 5.88
CHKB-210ENST00000484266 CFAP74Q9C0B2 1584 aa51.8■■■■■ 5.88
CHKB-210ENST00000484266 PHLDB1Q86UU1 1377 aa51.77■■■■■ 5.88
CHKB-210ENST00000484266 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa51.77■■■■■ 5.88
CHKB-210ENST00000484266 PREX2Q70Z35 1606 aa51.77■■■■■ 5.88
CHKB-210ENST00000484266 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa51.76■■■■■ 5.88
CHKB-210ENST00000484266 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP51.72■■■■■ 5.87
CHKB-210ENST00000484266 APLP2Q06481 763 aa51.72■■■■■ 5.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms