RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.42■■■□□ 2.78
SH3BP4-209ENST00000484097 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.41■■■□□ 2.78
SH3BP4-209ENST00000484097 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
SH3BP4-209ENST00000484097 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.4■■■□□ 2.78
SH3BP4-209ENST00000484097 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.3■■■□□ 2.76
SH3BP4-209ENST00000484097 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.25■■■□□ 2.75
SH3BP4-209ENST00000484097 IQGAP2Q13576 1575 aa32.21■■■□□ 2.75
SH3BP4-209ENST00000484097 EEA1Q15075 1411 aa32.21■■■□□ 2.75
SH3BP4-209ENST00000484097 PRXQ9BXM0 1461 aa32.2■■■□□ 2.75
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.16■■■□□ 2.74
SH3BP4-209ENST00000484097 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.15■■■□□ 2.74
SH3BP4-209ENST00000484097 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa32.15■■■□□ 2.74
SH3BP4-209ENST00000484097 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.08■■■□□ 2.73
SH3BP4-209ENST00000484097 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
SH3BP4-209ENST00000484097 PTPRGP23470 1445 aa32.03■■■□□ 2.72
SH3BP4-209ENST00000484097 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.03■■■□□ 2.72
SH3BP4-209ENST00000484097 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.01■■■□□ 2.72
SH3BP4-209ENST00000484097 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32■■■□□ 2.71
SH3BP4-209ENST00000484097 DISP1Q96F81 1524 aa31.96■■■□□ 2.71
SH3BP4-209ENST00000484097 GOLGA3Q08378 1498 aa31.9■■■□□ 2.7
SH3BP4-209ENST00000484097 KIAA0556O60303 1618 aa31.89■■■□□ 2.7
SH3BP4-209ENST00000484097 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.87■■■□□ 2.69
SH3BP4-209ENST00000484097 KIF21BO75037 1637 aa31.84■■■□□ 2.69
SH3BP4-209ENST00000484097 UACAQ9BZF9 1416 aa31.78■■■□□ 2.68
SH3BP4-209ENST00000484097 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.77■■■□□ 2.68
SH3BP4-209ENST00000484097 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
SH3BP4-209ENST00000484097 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
SH3BP4-209ENST00000484097 P3H3Q8IVL6 736 aa31.74■■■□□ 2.67
SH3BP4-209ENST00000484097 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.72■■■□□ 2.67
SH3BP4-209ENST00000484097 MAPKBP1O60336 1514 aa31.7■■■□□ 2.66
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SH3BP4-209ENST00000484097 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.63■■■□□ 2.65
SH3BP4-209ENST00000484097 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.61■■■□□ 2.65
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SH3BP4-209ENST00000484097 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.57■■■□□ 2.64
SH3BP4-209ENST00000484097 ABCA8O94911 1581 aa31.55■■■□□ 2.64
SH3BP4-209ENST00000484097 ASXL2Q76L83 1435 aa31.53■■■□□ 2.64
SH3BP4-209ENST00000484097 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
SH3BP4-209ENST00000484097 DIP2BQ9P265 1576 aa31.51■■■□□ 2.63
SH3BP4-209ENST00000484097 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.49■■■□□ 2.63
SH3BP4-209ENST00000484097 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.48■■■□□ 2.63
SH3BP4-209ENST00000484097 ARID3CA6NKF2 412 aa31.4■■■□□ 2.62
SH3BP4-209ENST00000484097 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.39■■■□□ 2.62
SH3BP4-209ENST00000484097 TSPOAP1O95153 1857 aa31.37■■■□□ 2.61
SH3BP4-209ENST00000484097 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
SH3BP4-209ENST00000484097 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
SH3BP4-209ENST00000484097 GLI2P10070 1586 aa31.34■■■□□ 2.61
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SH3BP4-209ENST00000484097 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP10BO94823 1461 aa31.33■■■□□ 2.61
SH3BP4-209ENST00000484097 KCNH8Q96L42 1107 aa31.32■■■□□ 2.6
SH3BP4-209ENST00000484097 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.3■■■□□ 2.6
SH3BP4-209ENST00000484097 FMN1Q68DA7 1419 aa31.24■■■□□ 2.59
SH3BP4-209ENST00000484097 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.22■■■□□ 2.59
SH3BP4-209ENST00000484097 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa31.17■■■□□ 2.58
SH3BP4-209ENST00000484097 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.16■■■□□ 2.58
SH3BP4-209ENST00000484097 CLIP1P30622 1438 aa31.12■■■□□ 2.57
SH3BP4-209ENST00000484097 CD109Q6YHK3 1445 aa31.12■■■□□ 2.57
SH3BP4-209ENST00000484097 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
SH3BP4-209ENST00000484097 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.11■■■□□ 2.57
SH3BP4-209ENST00000484097 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.11■■■□□ 2.57
SH3BP4-209ENST00000484097 KDM6BO15054 1643 aa31.1■■■□□ 2.57
SH3BP4-209ENST00000484097 HECW1Q76N89 1606 aa31.08■■■□□ 2.57
SH3BP4-209ENST00000484097 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
SH3BP4-209ENST00000484097 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.02■■■□□ 2.56
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SH3BP4-209ENST00000484097 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.01■■■□□ 2.55
SH3BP4-209ENST00000484097 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.98■■■□□ 2.55
SH3BP4-209ENST00000484097 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.95■■■□□ 2.54
SH3BP4-209ENST00000484097 CEP162Q5TB80 1403 aa30.92■■■□□ 2.54
SH3BP4-209ENST00000484097 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.87■■■□□ 2.53
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.86■■■□□ 2.53
SH3BP4-209ENST00000484097 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.86■■■□□ 2.53
SH3BP4-209ENST00000484097 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
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SH3BP4-209ENST00000484097 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.75■■■□□ 2.51
SH3BP4-209ENST00000484097 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.74■■■□□ 2.51
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SH3BP4-209ENST00000484097 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.68■■■□□ 2.5
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SH3BP4-209ENST00000484097 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
SH3BP4-209ENST00000484097 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.66■■■□□ 2.5
SH3BP4-209ENST00000484097 RAPGEF3O95398 923 aa30.65■■■□□ 2.5
SH3BP4-209ENST00000484097 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.64■■■□□ 2.5
SH3BP4-209ENST00000484097 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
SH3BP4-209ENST00000484097 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.59■■■□□ 2.49
SH3BP4-209ENST00000484097 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.56■■■□□ 2.48
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SH3BP4-209ENST00000484097 ADGRL1O94910 1474 aa30.53■■■□□ 2.48
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SH3BP4-209ENST00000484097 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.49■■■□□ 2.47
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