RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.77■■■■■ 5.08
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.62■■■■■ 4.25
SH3BP4-209ENST00000484097 ABCC9O60706 1549 aa40.89■■■■■ 4.14
SH3BP4-209ENST00000484097 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.34■■■■□ 3.89
SH3BP4-209ENST00000484097 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.28■■■■□ 3.88
SH3BP4-209ENST00000484097 NACADO15069 1562 aa39.19■■■■□ 3.86
SH3BP4-209ENST00000484097 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
SH3BP4-209ENST00000484097 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.86■■■■□ 3.81
SH3BP4-209ENST00000484097 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.65■■■■□ 3.78
SH3BP4-209ENST00000484097 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.35■■■■□ 3.73
SH3BP4-209ENST00000484097 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.24■■■■□ 3.71
SH3BP4-209ENST00000484097 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.02■■■■□ 3.68
SH3BP4-209ENST00000484097 SCRIBQ14160 1630 aa38■■■■□ 3.67
SH3BP4-209ENST00000484097 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.63■■■■□ 3.61
SH3BP4-209ENST00000484097 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.62■■■■□ 3.61
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
SH3BP4-209ENST00000484097 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.96■■■■□ 3.51
SH3BP4-209ENST00000484097 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.75■■■■□ 3.47
SH3BP4-209ENST00000484097 SMARCA4P51532 1647 aa36.31■■■■□ 3.4
SH3BP4-209ENST00000484097 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
SH3BP4-209ENST00000484097 NCAPD3P42695 1498 aa36.15■■■■□ 3.38
SH3BP4-209ENST00000484097 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.15■■■■□ 3.38
SH3BP4-209ENST00000484097 SMARCA2P51531 1590 aa36.12■■■■□ 3.37
SH3BP4-209ENST00000484097 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.03■■■■□ 3.36
SH3BP4-209ENST00000484097 HMGXB3Q12766 1538 aa35.93■■■■□ 3.34
SH3BP4-209ENST00000484097 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.91■■■■□ 3.34
SH3BP4-209ENST00000484097 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
SH3BP4-209ENST00000484097 WIZO95785 1651 aa35.67■■■■□ 3.3
SH3BP4-209ENST00000484097 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
SH3BP4-209ENST00000484097 NESP48681 1621 aa35.32■■■■□ 3.25
SH3BP4-209ENST00000484097 ERCC6Q03468 1493 aa35.3■■■■□ 3.24
SH3BP4-209ENST00000484097 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
SH3BP4-209ENST00000484097 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.23■■■■□ 3.23
SH3BP4-209ENST00000484097 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.13■■■■□ 3.21
SH3BP4-209ENST00000484097 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.05■■■■□ 3.2
SH3BP4-209ENST00000484097 CUX2O14529 1486 aa34.91■■■■□ 3.18
SH3BP4-209ENST00000484097 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.9■■■■□ 3.18
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.87■■■■□ 3.17
SH3BP4-209ENST00000484097 CFTRP13569 1480 aa34.85■■■■□ 3.17
SH3BP4-209ENST00000484097 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
SH3BP4-209ENST00000484097 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
SH3BP4-209ENST00000484097 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.71■■■■□ 3.15
SH3BP4-209ENST00000484097 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.69■■■■□ 3.14
SH3BP4-209ENST00000484097 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.65■■■■□ 3.14
SH3BP4-209ENST00000484097 PRDM2Q13029 1718 aa34.6■■■■□ 3.13
SH3BP4-209ENST00000484097 WDR62O43379 1518 aa34.5■■■■□ 3.11
SH3BP4-209ENST00000484097 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
SH3BP4-209ENST00000484097 ABCC8Q09428 1581 aa34.18■■■■□ 3.06
SH3BP4-209ENST00000484097 TOPBP1Q92547 1522 aa34.14■■■■□ 3.06
SH3BP4-209ENST00000484097 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.07■■■■□ 3.05
SH3BP4-209ENST00000484097 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.03■■■■□ 3.04
SH3BP4-209ENST00000484097 IFT140Q96RY7 1462 aa33.96■■■■□ 3.03
SH3BP4-209ENST00000484097 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3.01
SH3BP4-209ENST00000484097 CUX1P39880 1505 aa33.81■■■■□ 3
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
SH3BP4-209ENST00000484097 SOGA1O94964 1423 aa33.75■■■□□ 2.99
SH3BP4-209ENST00000484097 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.74■■■□□ 2.99
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SH3BP4-209ENST00000484097 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.7■■■□□ 2.99
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SH3BP4-209ENST00000484097 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.96
SH3BP4-209ENST00000484097 OSCARQ8IYS5 282 aa33.55■■■□□ 2.96
SH3BP4-209ENST00000484097 TOP2BQ02880 1626 aa33.5■■■□□ 2.95
SH3BP4-209ENST00000484097 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.49■■■□□ 2.95
SH3BP4-209ENST00000484097 WDR97A6NE52 1622 aa33.48■■■□□ 2.95
SH3BP4-209ENST00000484097 SYNJ1O43426 1573 aa33.46■■■□□ 2.95
SH3BP4-209ENST00000484097 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.39■■■□□ 2.94
SH3BP4-209ENST00000484097 FBLN2P98095 1184 aa33.37■■■□□ 2.93
SH3BP4-209ENST00000484097 GRIN2BQ13224 1484 aa33.34■■■□□ 2.93
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SH3BP4-209ENST00000484097 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.3■■■□□ 2.92
SH3BP4-209ENST00000484097 CHD1O14646 1710 aa33.28■■■□□ 2.92
SH3BP4-209ENST00000484097 PBRM1Q86U86 1689 aa33.25■■■□□ 2.91
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SH3BP4-209ENST00000484097 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.24■■■□□ 2.91
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SH3BP4-209ENST00000484097 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33■■■□□ 2.87
SH3BP4-209ENST00000484097 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.94■■■□□ 2.86
SH3BP4-209ENST00000484097 TRIM41Q8WV44 630 aa32.94■■■□□ 2.86
SH3BP4-209ENST00000484097 ADAMTS12P58397 1594 aa32.94■■■□□ 2.86
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SH3BP4-209ENST00000484097 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.92■■■□□ 2.86
SH3BP4-209ENST00000484097 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.92■■■□□ 2.86
SH3BP4-209ENST00000484097 ARHGEF11O15085 1522 aa32.89■■■□□ 2.86
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SH3BP4-209ENST00000484097 NUP160Q12769 1436 aa32.72■■■□□ 2.83
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SH3BP4-209ENST00000484097 CEP170Q5SW79 1584 aa32.7■■■□□ 2.83
SH3BP4-209ENST00000484097 CUL7Q14999 1698 aa32.69■■■□□ 2.82
SH3BP4-209ENST00000484097 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.63■■■□□ 2.81
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SH3BP4-209ENST00000484097 JPH4Q96JJ6 628 aa32.51■■■□□ 2.79
SH3BP4-209ENST00000484097 SHROOM2Q13796 1616 aa32.48■■■□□ 2.79
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