RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.47■■□□□ 1.19
HPS1-211ENST00000478087 CUL7Q14999 1698 aa22.46■■□□□ 1.19
HPS1-211ENST00000478087 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.41■■□□□ 1.18
HPS1-211ENST00000478087 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.36■■□□□ 1.17
HPS1-211ENST00000478087 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HPS1-211ENST00000478087 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.21■■□□□ 1.15
HPS1-211ENST00000478087 IQGAP2Q13576 1575 aa22.2■■□□□ 1.14
HPS1-211ENST00000478087 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.2■■□□□ 1.14
HPS1-211ENST00000478087 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.19■■□□□ 1.14
HPS1-211ENST00000478087 PTPRGP23470 1445 aa22.13■■□□□ 1.13
HPS1-211ENST00000478087 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
HPS1-211ENST00000478087 DISP1Q96F81 1524 aa22.11■■□□□ 1.13
HPS1-211ENST00000478087 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.1■■□□□ 1.13
HPS1-211ENST00000478087 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.09■■□□□ 1.13
HPS1-211ENST00000478087 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.07■■□□□ 1.12
HPS1-211ENST00000478087 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.06■■□□□ 1.12
HPS1-211ENST00000478087 PRXQ9BXM0 1461 aa22.05■■□□□ 1.12
HPS1-211ENST00000478087 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.04■■□□□ 1.12
HPS1-211ENST00000478087 MAPKBP1O60336 1514 aa22.03■■□□□ 1.12
HPS1-211ENST00000478087 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.02■■□□□ 1.12
HPS1-211ENST00000478087 KIAA0556O60303 1618 aa22■■□□□ 1.11
HPS1-211ENST00000478087 DIP2BQ9P265 1576 aa21.99■■□□□ 1.11
HPS1-211ENST00000478087 TSPOAP1O95153 1857 aa21.98■■□□□ 1.11
HPS1-211ENST00000478087 CSRNP3Q8WYN3 585 aa21.98■■□□□ 1.11
HPS1-211ENST00000478087 UACAQ9BZF9 1416 aa21.96■■□□□ 1.11
HPS1-211ENST00000478087 ABCC2Q92887 1545 aa21.96■■□□□ 1.11
HPS1-211ENST00000478087 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
HPS1-211ENST00000478087 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.92■■□□□ 1.1
HPS1-211ENST00000478087 ASXL2Q76L83 1435 aa21.89■■□□□ 1.09
HPS1-211ENST00000478087 P3H3Q8IVL6 736 aa21.88■■□□□ 1.09
HPS1-211ENST00000478087 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.87■■□□□ 1.09
HPS1-211ENST00000478087 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HPS1-211ENST00000478087 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.86■■□□□ 1.09
HPS1-211ENST00000478087 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.85■■□□□ 1.09
HPS1-211ENST00000478087 GOLGA3Q08378 1498 aa21.84■■□□□ 1.09
HPS1-211ENST00000478087 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HPS1-211ENST00000478087 EEA1Q15075 1411 aa21.8■■□□□ 1.08
HPS1-211ENST00000478087 ABCA8O94911 1581 aa21.79■■□□□ 1.08
HPS1-211ENST00000478087 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
HPS1-211ENST00000478087 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.77■■□□□ 1.08
HPS1-211ENST00000478087 GLI2P10070 1586 aa21.76■■□□□ 1.07
HPS1-211ENST00000478087 ARID3CA6NKF2 412 aa21.75■■□□□ 1.07
HPS1-211ENST00000478087 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HPS1-211ENST00000478087 SAMD9Q5K651 1589 aa21.73■■□□□ 1.07
HPS1-211ENST00000478087 KDM6BO15054 1643 aa21.73■■□□□ 1.07
HPS1-211ENST00000478087 KCNH8Q96L42 1107 aa21.7■■□□□ 1.06
HPS1-211ENST00000478087 KIF21BO75037 1637 aa21.69■■□□□ 1.06
HPS1-211ENST00000478087 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.69■■□□□ 1.06
HPS1-211ENST00000478087 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.68■■□□□ 1.06
HPS1-211ENST00000478087 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
HPS1-211ENST00000478087 ATP10BO94823 1461 aa21.64■■□□□ 1.06
HPS1-211ENST00000478087 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.63■■□□□ 1.05
HPS1-211ENST00000478087 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
HPS1-211ENST00000478087 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.61■■□□□ 1.05
HPS1-211ENST00000478087 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
HPS1-211ENST00000478087 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.56■■□□□ 1.04
HPS1-211ENST00000478087 CD109Q6YHK3 1445 aa21.55■■□□□ 1.04
HPS1-211ENST00000478087 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HPS1-211ENST00000478087 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HPS1-211ENST00000478087 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HPS1-211ENST00000478087 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.52■■□□□ 1.04
HPS1-211ENST00000478087 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS1-211ENST00000478087 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS1-211ENST00000478087 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.49■■□□□ 1.03
HPS1-211ENST00000478087 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.44■■□□□ 1.02
HPS1-211ENST00000478087 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.44■■□□□ 1.02
HPS1-211ENST00000478087 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
HPS1-211ENST00000478087 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.39■■□□□ 1.01
HPS1-211ENST00000478087 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
HPS1-211ENST00000478087 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.33■■□□□ 1.01
HPS1-211ENST00000478087 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.32■■□□□ 1
HPS1-211ENST00000478087 RAPGEF3O95398 923 aa21.31■■□□□ 1
HPS1-211ENST00000478087 ADGRL1O94910 1474 aa21.31■■□□□ 1
HPS1-211ENST00000478087 FMN1Q68DA7 1419 aa21.3■■□□□ 1
HPS1-211ENST00000478087 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 1
HPS1-211ENST00000478087 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.29■■□□□ 1
HPS1-211ENST00000478087 HECW1Q76N89 1606 aa21.28■■□□□ 1
HPS1-211ENST00000478087 NEO1Q92859 1461 aa21.25■□□□□ 0.99
HPS1-211ENST00000478087 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.23■□□□□ 0.99
HPS1-211ENST00000478087 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.23■□□□□ 0.99
HPS1-211ENST00000478087 KIF14Q15058 1648 aa21.2■□□□□ 0.98
HPS1-211ENST00000478087 AKNAQ7Z591 1439 aa21.2■□□□□ 0.98
HPS1-211ENST00000478087 FANCAO15360 1455 aa21.2■□□□□ 0.98
HPS1-211ENST00000478087 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
HPS1-211ENST00000478087 RICTORQ6R327 1708 aa21.18■□□□□ 0.98
HPS1-211ENST00000478087 CLIP1P30622 1438 aa21.16■□□□□ 0.98
HPS1-211ENST00000478087 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
HPS1-211ENST00000478087 PLCH2O75038 1416 aa21.14■□□□□ 0.98
HPS1-211ENST00000478087 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.14■□□□□ 0.98
HPS1-211ENST00000478087 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.14■□□□□ 0.97
HPS1-211ENST00000478087 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.13■□□□□ 0.97
HPS1-211ENST00000478087 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
HPS1-211ENST00000478087 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
HPS1-211ENST00000478087 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.08■□□□□ 0.97
HPS1-211ENST00000478087 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.07■□□□□ 0.96
HPS1-211ENST00000478087 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.07■□□□□ 0.96
HPS1-211ENST00000478087 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.06■□□□□ 0.96
HPS1-211ENST00000478087 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.05■□□□□ 0.96
HPS1-211ENST00000478087 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.05■□□□□ 0.96
HPS1-211ENST00000478087 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.05■□□□□ 0.96
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