RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.24■■■□□ 2.75
HPS1-211ENST00000478087 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.76■■■□□ 2.2
HPS1-211ENST00000478087 ABCC9O60706 1549 aa28.61■■■□□ 2.17
HPS1-211ENST00000478087 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.25■■□□□ 1.95
HPS1-211ENST00000478087 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.22■■□□□ 1.95
HPS1-211ENST00000478087 NACADO15069 1562 aa27.12■■□□□ 1.93
HPS1-211ENST00000478087 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.82■■□□□ 1.88
HPS1-211ENST00000478087 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.76■■□□□ 1.87
HPS1-211ENST00000478087 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
HPS1-211ENST00000478087 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
HPS1-211ENST00000478087 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.7■■□□□ 1.86
HPS1-211ENST00000478087 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.56■■□□□ 1.84
HPS1-211ENST00000478087 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.54■■□□□ 1.84
HPS1-211ENST00000478087 SCRIBQ14160 1630 aa26.33■■□□□ 1.81
HPS1-211ENST00000478087 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.98■■□□□ 1.75
HPS1-211ENST00000478087 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.85■■□□□ 1.73
HPS1-211ENST00000478087 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
HPS1-211ENST00000478087 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.69■■□□□ 1.7
HPS1-211ENST00000478087 SMARCA4P51532 1647 aa25.1■■□□□ 1.61
HPS1-211ENST00000478087 NCAPD3P42695 1498 aa25.05■■□□□ 1.6
HPS1-211ENST00000478087 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.04■■□□□ 1.6
HPS1-211ENST00000478087 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
HPS1-211ENST00000478087 SMARCA2P51531 1590 aa24.93■■□□□ 1.58
HPS1-211ENST00000478087 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.9■■□□□ 1.58
HPS1-211ENST00000478087 HMGXB3Q12766 1538 aa24.86■■□□□ 1.57
HPS1-211ENST00000478087 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.8■■□□□ 1.56
HPS1-211ENST00000478087 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
HPS1-211ENST00000478087 NESP48681 1621 aa24.69■■□□□ 1.54
HPS1-211ENST00000478087 WIZO95785 1651 aa24.66■■□□□ 1.54
HPS1-211ENST00000478087 ERCC6Q03468 1493 aa24.6■■□□□ 1.53
HPS1-211ENST00000478087 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
HPS1-211ENST00000478087 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.43■■□□□ 1.5
HPS1-211ENST00000478087 CUX2O14529 1486 aa24.41■■□□□ 1.5
HPS1-211ENST00000478087 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.38■■□□□ 1.49
HPS1-211ENST00000478087 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.31■■□□□ 1.48
HPS1-211ENST00000478087 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
HPS1-211ENST00000478087 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.27■■□□□ 1.48
HPS1-211ENST00000478087 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
HPS1-211ENST00000478087 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.2■■□□□ 1.46
HPS1-211ENST00000478087 CFTRP13569 1480 aa24.09■■□□□ 1.45
HPS1-211ENST00000478087 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.07■■□□□ 1.44
HPS1-211ENST00000478087 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.06■■□□□ 1.44
HPS1-211ENST00000478087 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.04■■□□□ 1.44
HPS1-211ENST00000478087 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.02■■□□□ 1.44
HPS1-211ENST00000478087 WDR62O43379 1518 aa24■■□□□ 1.43
HPS1-211ENST00000478087 PRDM2Q13029 1718 aa23.93■■□□□ 1.42
HPS1-211ENST00000478087 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
HPS1-211ENST00000478087 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
HPS1-211ENST00000478087 TOPBP1Q92547 1522 aa23.64■■□□□ 1.38
HPS1-211ENST00000478087 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HPS1-211ENST00000478087 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.55■■□□□ 1.36
HPS1-211ENST00000478087 IFT140Q96RY7 1462 aa23.52■■□□□ 1.36
HPS1-211ENST00000478087 ABCC8Q09428 1581 aa23.52■■□□□ 1.36
HPS1-211ENST00000478087 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
HPS1-211ENST00000478087 OSCARQ8IYS5 282 aa23.43■■□□□ 1.34
HPS1-211ENST00000478087 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
HPS1-211ENST00000478087 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HPS1-211ENST00000478087 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.343e-7■■■■■ 32.1
HPS1-211ENST00000478087 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.39■■□□□ 1.34
HPS1-211ENST00000478087 CUX1P39880 1505 aa23.37■■□□□ 1.33
HPS1-211ENST00000478087 SOGA1O94964 1423 aa23.33■■□□□ 1.32
HPS1-211ENST00000478087 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.31■■□□□ 1.32
HPS1-211ENST00000478087 TRIM41Q8WV44 630 aa23.31■■□□□ 1.32
HPS1-211ENST00000478087 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HPS1-211ENST00000478087 CHD1O14646 1710 aa23.25■■□□□ 1.31
HPS1-211ENST00000478087 FBLN2P98095 1184 aa23.18■■□□□ 1.3
HPS1-211ENST00000478087 WDR97A6NE52 1622 aa23.15■■□□□ 1.3
HPS1-211ENST00000478087 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.13■■□□□ 1.29
HPS1-211ENST00000478087 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.13■■□□□ 1.29
HPS1-211ENST00000478087 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.13■■□□□ 1.29
HPS1-211ENST00000478087 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.11■■□□□ 1.29
HPS1-211ENST00000478087 SYNJ1O43426 1573 aa23.06■■□□□ 1.28
HPS1-211ENST00000478087 PBRM1Q86U86 1689 aa23.05■■□□□ 1.28
HPS1-211ENST00000478087 ARHGEF11O15085 1522 aa23.04■■□□□ 1.28
HPS1-211ENST00000478087 GRIN2BQ13224 1484 aa23.04■■□□□ 1.28
HPS1-211ENST00000478087 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.04■■□□□ 1.28
HPS1-211ENST00000478087 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
HPS1-211ENST00000478087 TOP2BQ02880 1626 aa23.03■■□□□ 1.28
HPS1-211ENST00000478087 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.03■■□□□ 1.28
HPS1-211ENST00000478087 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.03■■□□□ 1.28
HPS1-211ENST00000478087 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HPS1-211ENST00000478087 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23■■□□□ 1.27
HPS1-211ENST00000478087 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HPS1-211ENST00000478087 SYNJ2O15056 1496 aa22.93■■□□□ 1.26
HPS1-211ENST00000478087 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.93■■□□□ 1.26
HPS1-211ENST00000478087 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.9■■□□□ 1.26
HPS1-211ENST00000478087 ARAP1Q96P48 1450 aa22.85■■□□□ 1.25
HPS1-211ENST00000478087 ADAMTS12P58397 1594 aa22.79■■□□□ 1.24
HPS1-211ENST00000478087 GRIN2AQ12879 1464 aa22.77■■□□□ 1.24
HPS1-211ENST00000478087 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.72■■□□□ 1.23
HPS1-211ENST00000478087 CEP170Q5SW79 1584 aa22.72■■□□□ 1.23
HPS1-211ENST00000478087 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.72■■□□□ 1.23
HPS1-211ENST00000478087 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.67■■□□□ 1.22
HPS1-211ENST00000478087 NUP160Q12769 1436 aa22.66■■□□□ 1.22
HPS1-211ENST00000478087 IGF1RP08069 1367 aa22.58■■□□□ 1.21
HPS1-211ENST00000478087 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
HPS1-211ENST00000478087 SHROOM2Q13796 1616 aa22.56■■□□□ 1.2
HPS1-211ENST00000478087 KIF27Q86VH2 1401 aa22.55■■□□□ 1.2
HPS1-211ENST00000478087 JPH4Q96JJ6 628 aa22.5■■□□□ 1.19
HPS1-211ENST00000478087 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
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