RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.89■■■□□ 2.7
SYF2-203ENST00000474160 JPH4Q96JJ6 628 aa31.87■■■□□ 2.69
SYF2-203ENST00000474160 EEA1Q15075 1411 aa31.84■■■□□ 2.69
SYF2-203ENST00000474160 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
SYF2-203ENST00000474160 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.77■■■□□ 2.68
SYF2-203ENST00000474160 PRXQ9BXM0 1461 aa31.77■■■□□ 2.68
SYF2-203ENST00000474160 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.74■■■□□ 2.67
SYF2-203ENST00000474160 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.7■■■□□ 2.67
SYF2-203ENST00000474160 IQGAP2Q13576 1575 aa31.69■■■□□ 2.66
SYF2-203ENST00000474160 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.6■■■□□ 2.65
SYF2-203ENST00000474160 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.55■■■□□ 2.64
SYF2-203ENST00000474160 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.54■■■□□ 2.64
SYF2-203ENST00000474160 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.48■■■□□ 2.63
SYF2-203ENST00000474160 DISP1Q96F81 1524 aa31.44■■■□□ 2.62
SYF2-203ENST00000474160 PTPRGP23470 1445 aa31.43■■■□□ 2.62
SYF2-203ENST00000474160 KIF21BO75037 1637 aa31.42■■■□□ 2.62
SYF2-203ENST00000474160 GOLGA3Q08378 1498 aa31.41■■■□□ 2.62
SYF2-203ENST00000474160 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
SYF2-203ENST00000474160 KIAA0556O60303 1618 aa31.37■■■□□ 2.61
SYF2-203ENST00000474160 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.3■■■□□ 2.6
SYF2-203ENST00000474160 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.28■■■□□ 2.6
SYF2-203ENST00000474160 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
SYF2-203ENST00000474160 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.26■■■□□ 2.59
SYF2-203ENST00000474160 UACAQ9BZF9 1416 aa31.24■■■□□ 2.59
SYF2-203ENST00000474160 MAPKBP1O60336 1514 aa31.2■■■□□ 2.59
SYF2-203ENST00000474160 ABCC2Q92887 1545 aa31.18■■■□□ 2.58
SYF2-203ENST00000474160 SAMD9Q5K651 1589 aa31.16■■■□□ 2.58
SYF2-203ENST00000474160 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
SYF2-203ENST00000474160 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
SYF2-203ENST00000474160 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.08■■■□□ 2.57
SYF2-203ENST00000474160 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.08■■■□□ 2.57
SYF2-203ENST00000474160 ABCA8O94911 1581 aa31.05■■■□□ 2.56
SYF2-203ENST00000474160 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.04■■■□□ 2.56
SYF2-203ENST00000474160 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.02■■■□□ 2.56
SYF2-203ENST00000474160 P3H3Q8IVL6 736 aa30.97■■■□□ 2.55
SYF2-203ENST00000474160 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.95■■■□□ 2.55
SYF2-203ENST00000474160 ASXL2Q76L83 1435 aa30.94■■■□□ 2.54
SYF2-203ENST00000474160 DIP2BQ9P265 1576 aa30.94■■■□□ 2.54
SYF2-203ENST00000474160 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
SYF2-203ENST00000474160 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.91■■■□□ 2.54
SYF2-203ENST00000474160 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.9■■■□□ 2.54
SYF2-203ENST00000474160 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
SYF2-203ENST00000474160 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.88■■■□□ 2.53
SYF2-203ENST00000474160 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.86■■■□□ 2.53
SYF2-203ENST00000474160 GLI2P10070 1586 aa30.84■■■□□ 2.53
SYF2-203ENST00000474160 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.82■■■□□ 2.52
SYF2-203ENST00000474160 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.82■■■□□ 2.52
SYF2-203ENST00000474160 FMN1Q68DA7 1419 aa30.8■■■□□ 2.52
SYF2-203ENST00000474160 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
SYF2-203ENST00000474160 ATP10BO94823 1461 aa30.77■■■□□ 2.52
SYF2-203ENST00000474160 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
SYF2-203ENST00000474160 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.63■■■□□ 2.49
SYF2-203ENST00000474160 CLIP1P30622 1438 aa30.63■■■□□ 2.49
SYF2-203ENST00000474160 HECW1Q76N89 1606 aa30.61■■■□□ 2.49
SYF2-203ENST00000474160 ARID3CA6NKF2 412 aa30.59■■■□□ 2.49
SYF2-203ENST00000474160 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
SYF2-203ENST00000474160 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
SYF2-203ENST00000474160 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.58■■■□□ 2.49
SYF2-203ENST00000474160 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.58■■■□□ 2.49
SYF2-203ENST00000474160 TSPOAP1O95153 1857 aa30.57■■■□□ 2.48
SYF2-203ENST00000474160 KCNH8Q96L42 1107 aa30.56■■■□□ 2.48
SYF2-203ENST00000474160 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.55■■■□□ 2.48
SYF2-203ENST00000474160 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
SYF2-203ENST00000474160 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.52■■■□□ 2.48
SYF2-203ENST00000474160 CD109Q6YHK3 1445 aa30.52■■■□□ 2.48
SYF2-203ENST00000474160 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.51■■■□□ 2.47
SYF2-203ENST00000474160 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.48■■■□□ 2.47
SYF2-203ENST00000474160 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
SYF2-203ENST00000474160 CEP162Q5TB80 1403 aa30.47■■■□□ 2.47
SYF2-203ENST00000474160 KDM6BO15054 1643 aa30.46■■■□□ 2.47
SYF2-203ENST00000474160 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
SYF2-203ENST00000474160 FYCO1Q9BQS8 1478 aa30.44■■■□□ 2.46
SYF2-203ENST00000474160 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
SYF2-203ENST00000474160 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.44■■■□□ 2.46
SYF2-203ENST00000474160 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
SYF2-203ENST00000474160 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.39■■■□□ 2.45
SYF2-203ENST00000474160 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.36■■■□□ 2.45
SYF2-203ENST00000474160 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
SYF2-203ENST00000474160 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.3■■■□□ 2.44
SYF2-203ENST00000474160 NEO1Q92859 1461 aa30.3■■■□□ 2.44
SYF2-203ENST00000474160 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.3■■■□□ 2.44
SYF2-203ENST00000474160 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.25■■■□□ 2.43
SYF2-203ENST00000474160 KIF14Q15058 1648 aa30.25■■■□□ 2.43
SYF2-203ENST00000474160 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
SYF2-203ENST00000474160 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.21■■■□□ 2.43
SYF2-203ENST00000474160 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.21■■■□□ 2.43
SYF2-203ENST00000474160 PLCH2O75038 1416 aa30.18■■■□□ 2.42
SYF2-203ENST00000474160 FANCAO15360 1455 aa30.16■■■□□ 2.42
SYF2-203ENST00000474160 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.15■■■□□ 2.42
SYF2-203ENST00000474160 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.11■■■□□ 2.41
SYF2-203ENST00000474160 AKNAQ7Z591 1439 aa30.11■■■□□ 2.41
SYF2-203ENST00000474160 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.08■■■□□ 2.41
SYF2-203ENST00000474160 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.05■■■□□ 2.4
SYF2-203ENST00000474160 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
SYF2-203ENST00000474160 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa30.01■■■□□ 2.4
SYF2-203ENST00000474160 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.99■■■□□ 2.39
SYF2-203ENST00000474160 ADGRL1O94910 1474 aa29.99■■■□□ 2.39
SYF2-203ENST00000474160 MAP3K1Q13233 1512 aa29.98■■■□□ 2.39
SYF2-203ENST00000474160 PREX2Q70Z35 1606 aa29.98■■■□□ 2.39
SYF2-203ENST00000474160 RAPGEF3O95398 923 aa29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms