RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 IGF1RP08069 1367 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-209ENST00000473257 KIF13AQ9H1H9 1805 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-209ENST00000473257 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
ACTB-209ENST00000473257 KIF27Q86VH2 1401 aa19.7■□□□□ 0.74
ACTB-209ENST00000473257 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.7■□□□□ 0.74
ACTB-209ENST00000473257 ADCY10Q96PN6 1610 aa19.69■□□□□ 0.74
ACTB-209ENST00000473257 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa19.67■□□□□ 0.74
ACTB-209ENST00000473257 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.65■□□□□ 0.74
ACTB-209ENST00000473257 CUL7Q14999 1698 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-209ENST00000473257 ABCC10Q5T3U5 1492 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-209ENST00000473257 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.61■□□□□ 0.73
ACTB-209ENST00000473257 DIP2BQ9P265 1576 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-209ENST00000473257 MAPKBP1O60336 1514 aa19.6■□□□□ 0.73
ACTB-209ENST00000473257 PTPRGP23470 1445 aa19.56■□□□□ 0.72
ACTB-209ENST00000473257 TSPOAP1O95153 1857 aa19.54■□□□□ 0.72
ACTB-209ENST00000473257 IQGAP2Q13576 1575 aa19.49■□□□□ 0.71
ACTB-209ENST00000473257 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.48■□□□□ 0.71
ACTB-209ENST00000473257 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.46■□□□□ 0.71
ACTB-209ENST00000473257 KDM6BO15054 1643 aa19.45■□□□□ 0.7
ACTB-209ENST00000473257 DISP1Q96F81 1524 aa19.45■□□□□ 0.7
ACTB-209ENST00000473257 ABCC2Q92887 1545 aa19.44■□□□□ 0.7
ACTB-209ENST00000473257 ASXL2Q76L83 1435 aa19.43■□□□□ 0.7
ACTB-209ENST00000473257 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-209ENST00000473257 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.4■□□□□ 0.7
ACTB-209ENST00000473257 UACAQ9BZF9 1416 aa19.39■□□□□ 0.69
ACTB-209ENST00000473257 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa19.35■□□□□ 0.69
ACTB-209ENST00000473257 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
ACTB-209ENST00000473257 UGGT2Q9NYU1 1516 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTB-209ENST00000473257 PLB1Q6P1J6 1458 aa19.34■□□□□ 0.69
ACTB-209ENST00000473257 KIAA0556O60303 1618 aa19.32■□□□□ 0.68
ACTB-209ENST00000473257 GLI2P10070 1586 aa19.3■□□□□ 0.68
ACTB-209ENST00000473257 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
ACTB-209ENST00000473257 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
ACTB-209ENST00000473257 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
ACTB-209ENST00000473257 KDM5BQ9UGL1 1544 aa19.29■□□□□ 0.68
ACTB-209ENST00000473257 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTB-209ENST00000473257 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTB-209ENST00000473257 ARID3CA6NKF2 412 aa19.22■□□□□ 0.67
ACTB-209ENST00000473257 KCNH8Q96L42 1107 aa19.2■□□□□ 0.66
ACTB-209ENST00000473257 P3H3Q8IVL6 736 aa19.19■□□□□ 0.66
ACTB-209ENST00000473257 WDR7Q9Y4E6 1490 aa19.18■□□□□ 0.66
ACTB-209ENST00000473257 ADGRL1O94910 1474 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-209ENST00000473257 PRXQ9BXM0 1461 aa19.17■□□□□ 0.66
ACTB-209ENST00000473257 ABCA8O94911 1581 aa19.15■□□□□ 0.66
ACTB-209ENST00000473257 GOLGA3Q08378 1498 aa19.14■□□□□ 0.65
ACTB-209ENST00000473257 TEX14Q8IWB6 1497 aa19.13■□□□□ 0.65
ACTB-209ENST00000473257 CD109Q6YHK3 1445 aa19.1■□□□□ 0.65
ACTB-209ENST00000473257 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
ACTB-209ENST00000473257 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.03■□□□□ 0.64
ACTB-209ENST00000473257 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.03■□□□□ 0.64
ACTB-209ENST00000473257 ATP10BO94823 1461 aa19.03■□□□□ 0.64
ACTB-209ENST00000473257 CFAP43Q8NDM7 1665 aa19.02■□□□□ 0.64
ACTB-209ENST00000473257 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
ACTB-209ENST00000473257 SAMD9Q5K651 1589 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-209ENST00000473257 KIF21BO75037 1637 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTB-209ENST00000473257 HECW2Q9P2P5 1572 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-209ENST00000473257 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
ACTB-209ENST00000473257 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
ACTB-209ENST00000473257 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-209ENST00000473257 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
ACTB-209ENST00000473257 RAPGEF3O95398 923 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-209ENST00000473257 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-209ENST00000473257 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.92■□□□□ 0.62
ACTB-209ENST00000473257 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
ACTB-209ENST00000473257 ARAP3Q8WWN8 1544 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-209ENST00000473257 ABCA9Q8IUA7 1624 aa18.89■□□□□ 0.61
ACTB-209ENST00000473257 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa18.81■□□□□ 0.6
ACTB-209ENST00000473257 EEA1Q15075 1411 aa18.8■□□□□ 0.6
ACTB-209ENST00000473257 NEO1Q92859 1461 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-209ENST00000473257 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
ACTB-209ENST00000473257 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-209ENST00000473257 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
ACTB-209ENST00000473257 PHLDB1Q86UU1 1377 aa18.75■□□□□ 0.59
ACTB-209ENST00000473257 ADAMTSL3P82987 1691 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-209ENST00000473257 PTPRMP28827 1452 aa18.74■□□□□ 0.59
ACTB-209ENST00000473257 TTC37Q6PGP7 1564 aa18.73■□□□□ 0.59
ACTB-209ENST00000473257 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP18.73■□□□□ 0.592e-34■■■■□ 20.9
ACTB-209ENST00000473257 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
ACTB-209ENST00000473257 AKNAQ7Z591 1439 aa18.71■□□□□ 0.59
ACTB-209ENST00000473257 UBTFP17480 764 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
ACTB-209ENST00000473257 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.7■□□□□ 0.58
ACTB-209ENST00000473257 MADDQ8WXG6 1647 aa18.7■□□□□ 0.58
ACTB-209ENST00000473257 FANCAO15360 1455 aa18.7■□□□□ 0.58
ACTB-209ENST00000473257 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
ACTB-209ENST00000473257 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.69■□□□□ 0.58
ACTB-209ENST00000473257 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.69■□□□□ 0.58
ACTB-209ENST00000473257 RICTORQ6R327 1708 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-209ENST00000473257 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa18.67■□□□□ 0.58
ACTB-209ENST00000473257 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-209ENST00000473257 YEATS2Q9ULM3 1422 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-209ENST00000473257 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.64■□□□□ 0.57
ACTB-209ENST00000473257 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
ACTB-209ENST00000473257 MLECQ14165 292 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-209ENST00000473257 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa18.62■□□□□ 0.57
ACTB-209ENST00000473257 CFAP74Q9C0B2 1584 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-209ENST00000473257 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-209ENST00000473257 SCAPERQ9BY12 1400 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-209ENST00000473257 HSPA2P54652 639 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-209ENST00000473257 HECW1Q76N89 1606 aa18.59■□□□□ 0.57
ACTB-209ENST00000473257 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.58■□□□□ 0.56
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