RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.26■■■□□ 2.11
ACTB-209ENST00000473257 ABCC9O60706 1549 aa25.6■■□□□ 1.69
ACTB-209ENST00000473257 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.3■■□□□ 1.64
ACTB-209ENST00000473257 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.17■■□□□ 1.46
ACTB-209ENST00000473257 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.16■■□□□ 1.46
ACTB-209ENST00000473257 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.05■■□□□ 1.44
ACTB-209ENST00000473257 NACADO15069 1562 aa23.95■■□□□ 1.43
ACTB-209ENST00000473257 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.41
ACTB-209ENST00000473257 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.69■■□□□ 1.38
ACTB-209ENST00000473257 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-209ENST00000473257 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTB-209ENST00000473257 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
ACTB-209ENST00000473257 SCRIBQ14160 1630 aa23.23■■□□□ 1.31
ACTB-209ENST00000473257 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.22■■□□□ 1.31
ACTB-209ENST00000473257 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.04■■□□□ 1.28
ACTB-209ENST00000473257 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.02■■□□□ 1.28
ACTB-209ENST00000473257 CECR2Q9BXF3 1484 aa23■■□□□ 1.27
ACTB-209ENST00000473257 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
ACTB-209ENST00000473257 NCAPD3P42695 1498 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-209ENST00000473257 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-209ENST00000473257 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTB-209ENST00000473257 SMARCA4P51532 1647 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTB-209ENST00000473257 ERCC6Q03468 1493 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTB-209ENST00000473257 NESP48681 1621 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-209ENST00000473257 SMARCA2P51531 1590 aa21.98■■□□□ 1.11
ACTB-209ENST00000473257 HMGXB3Q12766 1538 aa21.95■■□□□ 1.1
ACTB-209ENST00000473257 CUX2O14529 1486 aa21.94■■□□□ 1.1
ACTB-209ENST00000473257 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
ACTB-209ENST00000473257 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
ACTB-209ENST00000473257 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.85■■□□□ 1.09
ACTB-209ENST00000473257 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.77■■□□□ 1.08
ACTB-209ENST00000473257 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
ACTB-209ENST00000473257 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-209ENST00000473257 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-209ENST00000473257 WIZO95785 1651 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-209ENST00000473257 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-209ENST00000473257 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-209ENST00000473257 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.4■■□□□ 1.02
ACTB-209ENST00000473257 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
ACTB-209ENST00000473257 WDR62O43379 1518 aa21.33■■□□□ 1
ACTB-209ENST00000473257 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-209ENST00000473257 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.29■■□□□ 1
ACTB-209ENST00000473257 TRIM41Q8WV44 630 aa21.24■□□□□ 0.99
ACTB-209ENST00000473257 CFTRP13569 1480 aa21.23■□□□□ 0.99
ACTB-209ENST00000473257 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
ACTB-209ENST00000473257 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
ACTB-209ENST00000473257 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.05■□□□□ 0.96
ACTB-209ENST00000473257 OSCARQ8IYS5 282 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-209ENST00000473257 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
ACTB-209ENST00000473257 PRDM2Q13029 1718 aa20.94■□□□□ 0.94
ACTB-209ENST00000473257 TOPBP1Q92547 1522 aa20.88■□□□□ 0.93
ACTB-209ENST00000473257 IFT140Q96RY7 1462 aa20.85■□□□□ 0.93
ACTB-209ENST00000473257 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.76■□□□□ 0.91
ACTB-209ENST00000473257 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.76■□□□□ 0.91
ACTB-209ENST00000473257 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.76■□□□□ 0.91
ACTB-209ENST00000473257 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
ACTB-209ENST00000473257 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.76■□□□□ 0.91
ACTB-209ENST00000473257 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.75■□□□□ 0.913e-16■■■■■ 41.8
ACTB-209ENST00000473257 ABCC8Q09428 1581 aa20.69■□□□□ 0.9
ACTB-209ENST00000473257 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
ACTB-209ENST00000473257 ARHGEF11O15085 1522 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-209ENST00000473257 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
ACTB-209ENST00000473257 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-209ENST00000473257 FBLN2P98095 1184 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-209ENST00000473257 CHD1O14646 1710 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-209ENST00000473257 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ACTB-209ENST00000473257 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.59■□□□□ 0.89
ACTB-209ENST00000473257 SOGA1O94964 1423 aa20.57■□□□□ 0.88
ACTB-209ENST00000473257 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.54■□□□□ 0.88
ACTB-209ENST00000473257 CUX1P39880 1505 aa20.53■□□□□ 0.88
ACTB-209ENST00000473257 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-209ENST00000473257 ARAP1Q96P48 1450 aa20.5■□□□□ 0.87
ACTB-209ENST00000473257 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ACTB-209ENST00000473257 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-209ENST00000473257 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-209ENST00000473257 GRIN2BQ13224 1484 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-209ENST00000473257 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-209ENST00000473257 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
ACTB-209ENST00000473257 WDR97A6NE52 1622 aa20.33■□□□□ 0.84
ACTB-209ENST00000473257 SYNJ2O15056 1496 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-209ENST00000473257 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.3■□□□□ 0.84
ACTB-209ENST00000473257 SYNJ1O43426 1573 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-209ENST00000473257 PBRM1Q86U86 1689 aa20.29■□□□□ 0.84
ACTB-209ENST00000473257 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.24■□□□□ 0.83
ACTB-209ENST00000473257 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.23■□□□□ 0.83
ACTB-209ENST00000473257 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.16■□□□□ 0.82
ACTB-209ENST00000473257 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.823e-23■■□□□ 11.8
ACTB-209ENST00000473257 GRIN2AQ12879 1464 aa20.11■□□□□ 0.81
ACTB-209ENST00000473257 ADAMTS12P58397 1594 aa20.1■□□□□ 0.81
ACTB-209ENST00000473257 TOP2BQ02880 1626 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-209ENST00000473257 CEP170Q5SW79 1584 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-209ENST00000473257 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.09■□□□□ 0.81
ACTB-209ENST00000473257 NUP160Q12769 1436 aa20.03■□□□□ 0.8
ACTB-209ENST00000473257 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.02■□□□□ 0.79
ACTB-209ENST00000473257 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.95■□□□□ 0.78
ACTB-209ENST00000473257 SHROOM2Q13796 1616 aa19.94■□□□□ 0.78
ACTB-209ENST00000473257 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
ACTB-209ENST00000473257 JPH4Q96JJ6 628 aa19.87■□□□□ 0.77
ACTB-209ENST00000473257 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.81■□□□□ 0.76
ACTB-209ENST00000473257 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
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