RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 KIF21BO75037 1637 aa35.87■■■■□ 3.33
RALGPS1-212ENST00000472427 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.86■■■■□ 3.33
RALGPS1-212ENST00000472427 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.86■■■■□ 3.33
RALGPS1-212ENST00000472427 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.86■■■■□ 3.33
RALGPS1-212ENST00000472427 SHROOM2Q13796 1616 aa35.86■■■■□ 3.33
RALGPS1-212ENST00000472427 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.82■■■■□ 3.33
RALGPS1-212ENST00000472427 IQGAP2Q13576 1575 aa35.82■■■■□ 3.32
RALGPS1-212ENST00000472427 JPH4Q96JJ6 628 aa35.78■■■■□ 3.32
RALGPS1-212ENST00000472427 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
RALGPS1-212ENST00000472427 GOLGA3Q08378 1498 aa35.71■■■■□ 3.31
RALGPS1-212ENST00000472427 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.62■■■■□ 3.29
RALGPS1-212ENST00000472427 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.61■■■■□ 3.29
RALGPS1-212ENST00000472427 ARAP1Q96P48 1450 aa35.6■■■■□ 3.29
RALGPS1-212ENST00000472427 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.6■■■■□ 3.29
RALGPS1-212ENST00000472427 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
RALGPS1-212ENST00000472427 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.56■■■■□ 3.28
RALGPS1-212ENST00000472427 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.52■■■■□ 3.28
RALGPS1-212ENST00000472427 DISP1Q96F81 1524 aa35.46■■■■□ 3.27
RALGPS1-212ENST00000472427 KIAA0556O60303 1618 aa35.46■■■■□ 3.27
RALGPS1-212ENST00000472427 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.42■■■■□ 3.26
RALGPS1-212ENST00000472427 PTPRGP23470 1445 aa35.35■■■■□ 3.25
RALGPS1-212ENST00000472427 SAMD9Q5K651 1589 aa35.33■■■■□ 3.25
RALGPS1-212ENST00000472427 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
RALGPS1-212ENST00000472427 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.32■■■■□ 3.24
RALGPS1-212ENST00000472427 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
RALGPS1-212ENST00000472427 P3H3Q8IVL6 736 aa35.2■■■■□ 3.23
RALGPS1-212ENST00000472427 UACAQ9BZF9 1416 aa35.13■■■■□ 3.21
RALGPS1-212ENST00000472427 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.11■■■■□ 3.21
RALGPS1-212ENST00000472427 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.11■■■■□ 3.21
RALGPS1-212ENST00000472427 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.09■■■■□ 3.21
RALGPS1-212ENST00000472427 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.08■■■■□ 3.21
RALGPS1-212ENST00000472427 ABCC2Q92887 1545 aa35.07■■■■□ 3.21
RALGPS1-212ENST00000472427 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.07■■■■□ 3.2
RALGPS1-212ENST00000472427 CLIP1P30622 1438 aa35.05■■■■□ 3.2
RALGPS1-212ENST00000472427 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.04■■■■□ 3.2
RALGPS1-212ENST00000472427 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.02■■■■□ 3.2
RALGPS1-212ENST00000472427 ABCA8O94911 1581 aa35.01■■■■□ 3.2
RALGPS1-212ENST00000472427 FMN1Q68DA7 1419 aa34.98■■■■□ 3.19
RALGPS1-212ENST00000472427 CEP162Q5TB80 1403 aa34.96■■■■□ 3.19
RALGPS1-212ENST00000472427 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.95■■■■□ 3.18
RALGPS1-212ENST00000472427 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.88■■■■□ 3.17
RALGPS1-212ENST00000472427 MAPKBP1O60336 1514 aa34.87■■■■□ 3.17
RALGPS1-212ENST00000472427 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
RALGPS1-212ENST00000472427 HECW1Q76N89 1606 aa34.78■■■■□ 3.16
RALGPS1-212ENST00000472427 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
RALGPS1-212ENST00000472427 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.15
RALGPS1-212ENST00000472427 ASXL2Q76L83 1435 aa34.72■■■■□ 3.15
RALGPS1-212ENST00000472427 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
RALGPS1-212ENST00000472427 ARID3CA6NKF2 412 aa34.71■■■■□ 3.15
RALGPS1-212ENST00000472427 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
RALGPS1-212ENST00000472427 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
RALGPS1-212ENST00000472427 ATP10BO94823 1461 aa34.69■■■■□ 3.14
RALGPS1-212ENST00000472427 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
RALGPS1-212ENST00000472427 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.68■■■■□ 3.14
RALGPS1-212ENST00000472427 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.66■■■■□ 3.14
RALGPS1-212ENST00000472427 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.64■■■■□ 3.14
RALGPS1-212ENST00000472427 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.63■■■■□ 3.13
RALGPS1-212ENST00000472427 DIP2BQ9P265 1576 aa34.6■■■■□ 3.13
RALGPS1-212ENST00000472427 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
RALGPS1-212ENST00000472427 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.58■■■■□ 3.13
RALGPS1-212ENST00000472427 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM69CQ0P6D2 419 aa34.55■■■■□ 3.12
RALGPS1-212ENST00000472427 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.55■■■■□ 3.12
RALGPS1-212ENST00000472427 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
RALGPS1-212ENST00000472427 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.53■■■■□ 3.12
RALGPS1-212ENST00000472427 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.52■■■■□ 3.12
RALGPS1-212ENST00000472427 GLI2P10070 1586 aa34.49■■■■□ 3.11
RALGPS1-212ENST00000472427 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.47■■■■□ 3.11
RALGPS1-212ENST00000472427 KCNH8Q96L42 1107 aa34.45■■■■□ 3.11
RALGPS1-212ENST00000472427 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.35■■■■□ 3.09
RALGPS1-212ENST00000472427 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.33■■■■□ 3.09
RALGPS1-212ENST00000472427 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
RALGPS1-212ENST00000472427 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.3■■■■□ 3.08
RALGPS1-212ENST00000472427 KIF14Q15058 1648 aa34.3■■■■□ 3.08
RALGPS1-212ENST00000472427 TSPOAP1O95153 1857 aa34.29■■■■□ 3.08
RALGPS1-212ENST00000472427 CD109Q6YHK3 1445 aa34.27■■■■□ 3.08
RALGPS1-212ENST00000472427 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.25■■■■□ 3.07
RALGPS1-212ENST00000472427 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.24■■■■□ 3.07
RALGPS1-212ENST00000472427 APLP2Q06481 763 aa34.24■■■■□ 3.07
RALGPS1-212ENST00000472427 TIAM1Q13009 1591 aa34.23■■■■□ 3.07
RALGPS1-212ENST00000472427 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.2■■■■□ 3.07
RALGPS1-212ENST00000472427 MAP3K1Q13233 1512 aa34.2■■■■□ 3.06
RALGPS1-212ENST00000472427 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.2■■■■□ 3.06
RALGPS1-212ENST00000472427 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.2■■■■□ 3.06
RALGPS1-212ENST00000472427 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.17■■■■□ 3.06
RALGPS1-212ENST00000472427 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
RALGPS1-212ENST00000472427 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.1■■■■□ 3.05
RALGPS1-212ENST00000472427 CFAP74Q9C0B2 1584 aa34.06■■■■□ 3.04
RALGPS1-212ENST00000472427 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.06■■■■□ 3.04
RALGPS1-212ENST00000472427 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
RALGPS1-212ENST00000472427 PLCH2O75038 1416 aa34.02■■■■□ 3.04
RALGPS1-212ENST00000472427 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.01■■■■□ 3.04
RALGPS1-212ENST00000472427 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.01■■■■□ 3.04
RALGPS1-212ENST00000472427 NEO1Q92859 1461 aa34.01■■■■□ 3.03
RALGPS1-212ENST00000472427 KDM6BO15054 1643 aa34.01■■■■□ 3.03
RALGPS1-212ENST00000472427 FANCAO15360 1455 aa33.99■■■■□ 3.03
RALGPS1-212ENST00000472427 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.97■■■■□ 3.03
RALGPS1-212ENST00000472427 PREX2Q70Z35 1606 aa33.97■■■■□ 3.03
RALGPS1-212ENST00000472427 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.97■■■■□ 3.03
RALGPS1-212ENST00000472427 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.9 ms