RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471500.5

MFSD1-209, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene MFSD1, Length 2,097 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-209ENST00000471500 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.1■■□□□ 1.61
MFSD1-209ENST00000471500 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.05■■□□□ 1.6
MFSD1-209ENST00000471500 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.05■■□□□ 1.6
MFSD1-209ENST00000471500 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
MFSD1-209ENST00000471500 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.04■■□□□ 1.6
MFSD1-209ENST00000471500 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
MFSD1-209ENST00000471500 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.04■■□□□ 1.6
MFSD1-209ENST00000471500 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
MFSD1-209ENST00000471500 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.01■■□□□ 1.59
MFSD1-209ENST00000471500 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
MFSD1-209ENST00000471500 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.59
MFSD1-209ENST00000471500 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
MFSD1-209ENST00000471500 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.99■■□□□ 1.59
MFSD1-209ENST00000471500 P3H3Q8IVL6 736 aa24.99■■□□□ 1.59
MFSD1-209ENST00000471500 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
MFSD1-209ENST00000471500 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.97■■□□□ 1.59
MFSD1-209ENST00000471500 FMN1Q68DA7 1419 aa24.91■■□□□ 1.58
MFSD1-209ENST00000471500 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.9■■□□□ 1.58
MFSD1-209ENST00000471500 SAMD9Q5K651 1589 aa24.9■■□□□ 1.58
MFSD1-209ENST00000471500 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.88■■□□□ 1.57
MFSD1-209ENST00000471500 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.85■■□□□ 1.57
MFSD1-209ENST00000471500 PBRM1Q86U86 1689 aa24.83■■□□□ 1.57
MFSD1-209ENST00000471500 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
MFSD1-209ENST00000471500 ITGAEP38570 1179 aa24.81■■□□□ 1.56
MFSD1-209ENST00000471500 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.77■■□□□ 1.56
MFSD1-209ENST00000471500 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
MFSD1-209ENST00000471500 ADAMTS12P58397 1594 aa24.75■■□□□ 1.55
MFSD1-209ENST00000471500 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.74■■□□□ 1.55
MFSD1-209ENST00000471500 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
MFSD1-209ENST00000471500 GRIN2BQ13224 1484 aa24.74■■□□□ 1.55
MFSD1-209ENST00000471500 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
MFSD1-209ENST00000471500 WDR62O43379 1518 aa24.71■■□□□ 1.55
MFSD1-209ENST00000471500 IFT140Q96RY7 1462 aa24.7■■□□□ 1.54
MFSD1-209ENST00000471500 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.7■■□□□ 1.54
MFSD1-209ENST00000471500 IQGAP2Q13576 1575 aa24.66■■□□□ 1.54
MFSD1-209ENST00000471500 MTUS2Q5JR59 1369 aa24.66■■□□□ 1.54
MFSD1-209ENST00000471500 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.64■■□□□ 1.54
MFSD1-209ENST00000471500 MAPKBP1O60336 1514 aa24.64■■□□□ 1.53
MFSD1-209ENST00000471500 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
MFSD1-209ENST00000471500 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.6■■□□□ 1.53
MFSD1-209ENST00000471500 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
MFSD1-209ENST00000471500 NCOA2Q15596 1464 aa24.58■■□□□ 1.52
MFSD1-209ENST00000471500 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.58■■□□□ 1.52
MFSD1-209ENST00000471500 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
MFSD1-209ENST00000471500 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
MFSD1-209ENST00000471500 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.55■■□□□ 1.52
MFSD1-209ENST00000471500 HECW1Q76N89 1606 aa24.55■■□□□ 1.52
MFSD1-209ENST00000471500 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.54■■□□□ 1.52
MFSD1-209ENST00000471500 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
MFSD1-209ENST00000471500 ARHGEF11O15085 1522 aa24.52■■□□□ 1.52
MFSD1-209ENST00000471500 NEUROD1Q13562 356 aa24.51■■□□□ 1.51
MFSD1-209ENST00000471500 MIER1Q8N108 512 aa24.5■■□□□ 1.51
MFSD1-209ENST00000471500 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.49■■□□□ 1.51
MFSD1-209ENST00000471500 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.48■■□□□ 1.51
MFSD1-209ENST00000471500 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
MFSD1-209ENST00000471500 ERCC6Q03468 1493 aa24.48■■□□□ 1.51
MFSD1-209ENST00000471500 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
MFSD1-209ENST00000471500 PTPRKQ15262 1439 aa24.44■■□□□ 1.5
MFSD1-209ENST00000471500 GRIN2AQ12879 1464 aa24.44■■□□□ 1.5
MFSD1-209ENST00000471500 HFM1A2PYH4 1435 aa24.44■■□□□ 1.5
MFSD1-209ENST00000471500 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.42■■□□□ 1.5
MFSD1-209ENST00000471500 KIAA0556O60303 1618 aa24.4■■□□□ 1.5
MFSD1-209ENST00000471500 DISP1Q96F81 1524 aa24.4■■□□□ 1.5
MFSD1-209ENST00000471500 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
MFSD1-209ENST00000471500 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
MFSD1-209ENST00000471500 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.39■■□□□ 1.49
MFSD1-209ENST00000471500 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
MFSD1-209ENST00000471500 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.35■■□□□ 1.49
MFSD1-209ENST00000471500 NAIPQ13075 1403 aa24.34■■□□□ 1.49
MFSD1-209ENST00000471500 UACAQ9BZF9 1416 aa24.33■■□□□ 1.49
MFSD1-209ENST00000471500 MIA2Q96PC5 1412 aa24.32■■□□□ 1.48
MFSD1-209ENST00000471500 SYNJ2O15056 1496 aa24.31■■□□□ 1.48
MFSD1-209ENST00000471500 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.27■■□□□ 1.48
MFSD1-209ENST00000471500 CEP170Q5SW79 1584 aa24.26■■□□□ 1.47
MFSD1-209ENST00000471500 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
MFSD1-209ENST00000471500 AKNAQ7Z591 1439 aa24.25■■□□□ 1.47
MFSD1-209ENST00000471500 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
MFSD1-209ENST00000471500 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
MFSD1-209ENST00000471500 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.24■■□□□ 1.47
MFSD1-209ENST00000471500 NUP160Q12769 1436 aa24.21■■□□□ 1.47
MFSD1-209ENST00000471500 ARID3CA6NKF2 412 aa24.2■■□□□ 1.47
MFSD1-209ENST00000471500 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
MFSD1-209ENST00000471500 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.2■■□□□ 1.46
MFSD1-209ENST00000471500 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
MFSD1-209ENST00000471500 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.15■■□□□ 1.46
MFSD1-209ENST00000471500 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.13■■□□□ 1.45
MFSD1-209ENST00000471500 TONSLQ96HA7 1378 aa24.13■■□□□ 1.45
MFSD1-209ENST00000471500 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.13■■□□□ 1.45
MFSD1-209ENST00000471500 FBLN2P98095 1184 aa24.11■■□□□ 1.45
MFSD1-209ENST00000471500 JPH4Q96JJ6 628 aa24.1■■□□□ 1.45
MFSD1-209ENST00000471500 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
MFSD1-209ENST00000471500 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.09■■□□□ 1.45
MFSD1-209ENST00000471500 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
MFSD1-209ENST00000471500 ROCK1Q13464 1354 aa24.08■■□□□ 1.45
MFSD1-209ENST00000471500 DAPK1P53355 1430 aa24.08■■□□□ 1.45
MFSD1-209ENST00000471500 KDM6BO15054 1643 aa24.08■■□□□ 1.44
MFSD1-209ENST00000471500 ABCC5O15440 1437 aa24.05■■□□□ 1.44
MFSD1-209ENST00000471500 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
MFSD1-209ENST00000471500 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
MFSD1-209ENST00000471500 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.04■■□□□ 1.44
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