RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470744.5

CLTA-207, Transcript of clathrin light chain A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CLTA, Length 1,102 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTA-207ENST00000470744 JPH4Q96JJ6 628 aa42.96■■■■■ 4.47
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CLTA-207ENST00000470744 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.78■■■■■ 4.44
CLTA-207ENST00000470744 IQGAP2Q13576 1575 aa42.58■■■■■ 4.41
CLTA-207ENST00000470744 PRXQ9BXM0 1461 aa42.57■■■■■ 4.41
CLTA-207ENST00000470744 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
CLTA-207ENST00000470744 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.49■■■■■ 4.39
CLTA-207ENST00000470744 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.48■■■■■ 4.39
CLTA-207ENST00000470744 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.45■■■■■ 4.39
CLTA-207ENST00000470744 EEA1Q15075 1411 aa42.44■■■■■ 4.38
CLTA-207ENST00000470744 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.36■■■■■ 4.37
CLTA-207ENST00000470744 PTPRGP23470 1445 aa42.35■■■■■ 4.37
CLTA-207ENST00000470744 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.34■■■■■ 4.37
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CLTA-207ENST00000470744 DISP1Q96F81 1524 aa42.33■■■■■ 4.37
CLTA-207ENST00000470744 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
CLTA-207ENST00000470744 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.31■■■■■ 4.36
CLTA-207ENST00000470744 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.24■■■■■ 4.35
CLTA-207ENST00000470744 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.21■■■■■ 4.35
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CLTA-207ENST00000470744 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42■■■■■ 4.31
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CLTA-207ENST00000470744 ABCC2Q92887 1545 aa41.98■■■■■ 4.31
CLTA-207ENST00000470744 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.9■■■■■ 4.3
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CLTA-207ENST00000470744 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.8■■■■■ 4.28
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CLTA-207ENST00000470744 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.47■■■■■ 4.23
CLTA-207ENST00000470744 ATP10BO94823 1461 aa41.44■■■■■ 4.22
CLTA-207ENST00000470744 TSPOAP1O95153 1857 aa41.43■■■■■ 4.22
CLTA-207ENST00000470744 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.35■■■■■ 4.21
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CLTA-207ENST00000470744 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.15■■■■■ 4.18
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CLTA-207ENST00000470744 CLIP1P30622 1438 aa41.02■■■■■ 4.16
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CLTA-207ENST00000470744 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.42■■■■■ 4.06
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CLTA-207ENST00000470744 RICTORQ6R327 1708 aa40.32■■■■■ 4.05
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