RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470512.5

GNAS-229, Transcript of GNAS complex locus, human

TSL 5

Gene GNAS, Length 913 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNAS-229	ENST00000470512	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	43.26	■■■■■ 4.52
GNAS-229	ENST00000470512	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		43.24	■■■■■ 4.51
GNAS-229	ENST00000470512	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		43.21	■■■■■ 4.51
GNAS-229	ENST00000470512	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		43.13	■■■■■ 4.5
GNAS-229	ENST00000470512	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		42.86	■■■■■ 4.45
GNAS-229	ENST00000470512	IQGAP2	Q13576	1575 aa		42.76	■■■■■ 4.44
GNAS-229	ENST00000470512	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		42.71	■■■■■ 4.43
GNAS-229	ENST00000470512	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	42.7	■■■■■ 4.43
GNAS-229	ENST00000470512	PTPRG	P23470	1445 aa		42.67	■■■■■ 4.42
GNAS-229	ENST00000470512	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	42.66	■■■■■ 4.42
GNAS-229	ENST00000470512	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		42.64	■■■■■ 4.42
GNAS-229	ENST00000470512	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.63	■■■■■ 4.41
GNAS-229	ENST00000470512	DISP1	Q96F81	1524 aa		42.55	■■■■■ 4.4
GNAS-229	ENST00000470512	PRX	Q9BXM0	1461 aa		42.54	■■■■■ 4.4
GNAS-229	ENST00000470512	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		42.52	■■■■■ 4.4
GNAS-229	ENST00000470512	MAPKBP1	O60336	1514 aa		42.48	■■■■■ 4.39
GNAS-229	ENST00000470512	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		42.42	■■■■■ 4.38
GNAS-229	ENST00000470512	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		42.41	■■■■■ 4.38
GNAS-229	ENST00000470512	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		42.41	■■■■■ 4.38
GNAS-229	ENST00000470512	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		42.41	■■■■■ 4.38
GNAS-229	ENST00000470512	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		42.38	■■■■■ 4.38
GNAS-229	ENST00000470512	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.36	■■■■■ 4.37
GNAS-229	ENST00000470512	UACA	Q9BZF9	1416 aa		42.35	■■■■■ 4.37
GNAS-229	ENST00000470512	ABCC2	Q92887	1545 aa		42.34	■■■■■ 4.37
GNAS-229	ENST00000470512	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		42.31	■■■■■ 4.36
GNAS-229	ENST00000470512	DIP2B	Q9P265	1576 aa		42.28	■■■■■ 4.36
GNAS-229	ENST00000470512	EEA1	Q15075	1411 aa		42.27	■■■■■ 4.36
GNAS-229	ENST00000470512	GOLGA3	Q08378	1498 aa		42.25	■■■■■ 4.35
GNAS-229	ENST00000470512	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.18	■■■■■ 4.34
GNAS-229	ENST00000470512	ASXL2	Q76L83	1435 aa		42.15	■■■■■ 4.34
GNAS-229	ENST00000470512	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		42.12	■■■■■ 4.33
GNAS-229	ENST00000470512	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		42.11	■■■■■ 4.33
GNAS-229	ENST00000470512	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		42.09	■■■■■ 4.33
GNAS-229	ENST00000470512	P3H3	Q8IVL6	736 aa		42.02	■■■■■ 4.32
GNAS-229	ENST00000470512	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	41.99	■■■■■ 4.31
GNAS-229	ENST00000470512	ABCA8	O94911	1581 aa		41.96	■■■■■ 4.31
GNAS-229	ENST00000470512	TSPOAP1	O95153	1857 aa		41.94	■■■■■ 4.3
GNAS-229	ENST00000470512	GLI2	P10070	1586 aa		41.93	■■■■■ 4.3
GNAS-229	ENST00000470512	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	41.89	■■■■■ 4.3
GNAS-229	ENST00000470512	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	41.87	■■■■■ 4.29
GNAS-229	ENST00000470512	SAMD9	Q5K651	1589 aa		41.85	■■■■■ 4.29
GNAS-229	ENST00000470512	KIF21B	O75037	1637 aa		41.84	■■■■■ 4.29
GNAS-229	ENST00000470512	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		41.81	■■■■■ 4.28
GNAS-229	ENST00000470512	KDM6B	O15054	1643 aa		41.79	■■■■■ 4.28
GNAS-229	ENST00000470512	ARID3C	A6NKF2	412 aa		41.73	■■■■■ 4.27
GNAS-229	ENST00000470512	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		41.72	■■■■■ 4.27
GNAS-229	ENST00000470512	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	41.71	■■■■■ 4.27
GNAS-229	ENST00000470512	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		41.69	■■■■■ 4.27
GNAS-229	ENST00000470512	KCNH8	Q96L42	1107 aa		41.69	■■■■■ 4.26
GNAS-229	ENST00000470512	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	41.66	■■■■■ 4.26
GNAS-229	ENST00000470512	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		41.66	■■■■■ 4.26
GNAS-229	ENST00000470512	ATP10B	O94823	1461 aa		41.65	■■■■■ 4.26
GNAS-229	ENST00000470512	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	41.64	■■■■■ 4.26
GNAS-229	ENST00000470512	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		41.6	■■■■■ 4.25
GNAS-229	ENST00000470512	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		41.6	■■■■■ 4.25
GNAS-229	ENST00000470512	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		41.56	■■■■■ 4.24
GNAS-229	ENST00000470512	CD109	Q6YHK3	1445 aa		41.53	■■■■■ 4.24
GNAS-229	ENST00000470512	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	41.51	■■■■■ 4.24
GNAS-229	ENST00000470512	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.51	■■■■■ 4.24
GNAS-229	ENST00000470512	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	41.47	■■■■■ 4.23
GNAS-229	ENST00000470512	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	41.47	■■■■■ 4.23
GNAS-229	ENST00000470512	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		41.45	■■■■■ 4.23
GNAS-229	ENST00000470512	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		41.44	■■■■■ 4.23
GNAS-229	ENST00000470512	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		41.29	■■■■■ 4.2
GNAS-229	ENST00000470512	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		41.27	■■■■■ 4.2
GNAS-229	ENST00000470512	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		41.26	■■■■■ 4.2
GNAS-229	ENST00000470512	FMN1	Q68DA7	1419 aa		41.22	■■■■■ 4.19
GNAS-229	ENST00000470512	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		41.21	■■■■■ 4.19
GNAS-229	ENST00000470512	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	41.18	■■■■■ 4.18
GNAS-229	ENST00000470512	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	41.13	■■■■■ 4.18
GNAS-229	ENST00000470512	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		41.1	■■■■■ 4.17
GNAS-229	ENST00000470512	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		41.09	■■■■■ 4.17
GNAS-229	ENST00000470512	HECW1	Q76N89	1606 aa		41.06	■■■■■ 4.16
GNAS-229	ENST00000470512	NEO1	Q92859	1461 aa		41.03	■■■■■ 4.16
GNAS-229	ENST00000470512	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	40.99	■■■■■ 4.15	3e-7	■■■□□ 16.6
GNAS-229	ENST00000470512	ADGRL1	O94910	1474 aa		40.97	■■■■■ 4.15
GNAS-229	ENST00000470512	RAPGEF3	O95398	923 aa		40.94	■■■■■ 4.14
GNAS-229	ENST00000470512	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	40.94	■■■■■ 4.14
GNAS-229	ENST00000470512	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		40.91	■■■■■ 4.14
GNAS-229	ENST00000470512	CLIP1	P30622	1438 aa		40.86	■■■■■ 4.13
GNAS-229	ENST00000470512	FANCA	O15360	1455 aa		40.86	■■■■■ 4.13
GNAS-229	ENST00000470512	AKNA	Q7Z591	1439 aa		40.84	■■■■■ 4.13
GNAS-229	ENST00000470512	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		40.84	■■■■■ 4.13
GNAS-229	ENST00000470512	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	40.79	■■■■■ 4.12
GNAS-229	ENST00000470512	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		40.78	■■■■■ 4.12
GNAS-229	ENST00000470512	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	40.78	■■■■■ 4.12
GNAS-229	ENST00000470512	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	40.77	■■■■■ 4.12
GNAS-229	ENST00000470512	PLCH2	O75038	1416 aa		40.77	■■■■■ 4.12
GNAS-229	ENST00000470512	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		40.77	■■■■■ 4.12
GNAS-229	ENST00000470512	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		40.76	■■■■■ 4.12
GNAS-229	ENST00000470512	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		40.71	■■■■■ 4.11
GNAS-229	ENST00000470512	KIF14	Q15058	1648 aa		40.71	■■■■■ 4.11
GNAS-229	ENST00000470512	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		40.67	■■■■■ 4.1
GNAS-229	ENST00000470512	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		40.66	■■■■■ 4.1
GNAS-229	ENST00000470512	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.63	■■■■■ 4.09
GNAS-229	ENST00000470512	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		40.62	■■■■■ 4.09
GNAS-229	ENST00000470512	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		40.61	■■■■■ 4.09
GNAS-229	ENST00000470512	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		40.53	■■■■■ 4.08
GNAS-229	ENST00000470512	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	40.53	■■■■■ 4.08
GNAS-229	ENST00000470512	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		40.52	■■■■■ 4.08

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms