RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470512.5

GNAS-229, Transcript of GNAS complex locus, humanhuman

TSL 5

Gene GNAS, Length 913 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAS-229ENST00000470512 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.1■■■■■ 7.53
GNAS-229ENST00000470512 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.39■■■■■ 6.46
GNAS-229ENST00000470512 ABCC9O60706 1549 aa54.95■■■■■ 6.39
GNAS-229ENST00000470512 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.51■■■■■ 6
GNAS-229ENST00000470512 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.3■■■■■ 5.96
GNAS-229ENST00000470512 NACADO15069 1562 aa52.29■■■■■ 5.96
GNAS-229ENST00000470512 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.74■■■■■ 5.87
GNAS-229ENST00000470512 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.58■■■■■ 5.85
GNAS-229ENST00000470512 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.31■■■■■ 5.8
GNAS-229ENST00000470512 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.3■■■■■ 5.8
GNAS-229ENST00000470512 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.22■■■■■ 5.79
GNAS-229ENST00000470512 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.06■■■■■ 5.76
GNAS-229ENST00000470512 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.94■■■■■ 5.75
GNAS-229ENST00000470512 SCRIBQ14160 1630 aa50.58■■■■■ 5.69
GNAS-229ENST00000470512 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.31■■■■■ 5.64
GNAS-229ENST00000470512 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.66■■■■■ 5.54
GNAS-229ENST00000470512 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.62■■■■■ 5.53
GNAS-229ENST00000470512 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.44■■■■■ 5.5
GNAS-229ENST00000470512 NCAPD3P42695 1498 aa48.29■■■■■ 5.32
GNAS-229ENST00000470512 SMARCA4P51532 1647 aa48.29■■■■■ 5.32
GNAS-229ENST00000470512 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.23■■■■■ 5.31
GNAS-229ENST00000470512 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.16■■■■■ 5.3
GNAS-229ENST00000470512 SMARCA2P51531 1590 aa48.1■■■■■ 5.29
GNAS-229ENST00000470512 HMGXB3Q12766 1538 aa47.95■■■■■ 5.27
GNAS-229ENST00000470512 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.87■■■■■ 5.25
GNAS-229ENST00000470512 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.8■■■■■ 5.24
GNAS-229ENST00000470512 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.8■■■■■ 5.24
GNAS-229ENST00000470512 ERCC6Q03468 1493 aa47.4■■■■■ 5.18
GNAS-229ENST00000470512 NESP48681 1621 aa47.36■■■■■ 5.17
GNAS-229ENST00000470512 WIZO95785 1651 aa47.29■■■■■ 5.16
GNAS-229ENST00000470512 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.11■■■■■ 5.13
GNAS-229ENST00000470512 CUX2O14529 1486 aa47.08■■■■■ 5.13
GNAS-229ENST00000470512 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.07■■■■■ 5.13
GNAS-229ENST00000470512 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.88■■■■■ 5.1
GNAS-229ENST00000470512 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.85■■■■■ 5.09
GNAS-229ENST00000470512 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.75■■■■■ 5.07
GNAS-229ENST00000470512 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.69■■■■■ 5.07
GNAS-229ENST00000470512 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.68■■■■■ 5.06
GNAS-229ENST00000470512 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.46■■■■■ 5.03
GNAS-229ENST00000470512 CFTRP13569 1480 aa46.44■■■■■ 5.03
GNAS-229ENST00000470512 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.38■■■■■ 5.02
GNAS-229ENST00000470512 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.33■■■■■ 5.01
GNAS-229ENST00000470512 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.32■■■■■ 5.01
GNAS-229ENST00000470512 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.25■■■■■ 5
GNAS-229ENST00000470512 WDR62O43379 1518 aa46.22■■■■■ 4.99
GNAS-229ENST00000470512 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.9■■■■■ 4.94
GNAS-229ENST00000470512 PRDM2Q13029 1718 aa45.89■■■■■ 4.94
GNAS-229ENST00000470512 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.55■■■■■ 4.88
GNAS-229ENST00000470512 TOPBP1Q92547 1522 aa45.51■■■■■ 4.88
GNAS-229ENST00000470512 ABCC8Q09428 1581 aa45.45■■■■■ 4.87
GNAS-229ENST00000470512 IFT140Q96RY7 1462 aa45.38■■■■■ 4.86
GNAS-229ENST00000470512 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.37■■■■■ 4.85
GNAS-229ENST00000470512 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.26■■■■■ 4.84
GNAS-229ENST00000470512 OSCARQ8IYS5 282 aa45.11■■■■■ 4.81
GNAS-229ENST00000470512 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.09■■■■■ 4.81
GNAS-229ENST00000470512 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.02■■■■■ 4.8
GNAS-229ENST00000470512 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.99■■■■■ 4.79
GNAS-229ENST00000470512 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.95■■■■■ 4.794e-9■■■■□ 20.3
GNAS-229ENST00000470512 SOGA1O94964 1423 aa44.93■■■■■ 4.78
GNAS-229ENST00000470512 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.93■■■■■ 4.78
GNAS-229ENST00000470512 CUX1P39880 1505 aa44.93■■■■■ 4.78
GNAS-229ENST00000470512 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.89■■■■■ 4.78
GNAS-229ENST00000470512 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.78■■■■■ 4.76
GNAS-229ENST00000470512 TRIM41Q8WV44 630 aa44.71■■■■■ 4.75
GNAS-229ENST00000470512 FBLN2P98095 1184 aa44.59■■■■■ 4.73
GNAS-229ENST00000470512 WDR97A6NE52 1622 aa44.59■■■■■ 4.73
GNAS-229ENST00000470512 CHD1O14646 1710 aa44.51■■■■■ 4.72
GNAS-229ENST00000470512 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.48■■■■■ 4.71
GNAS-229ENST00000470512 GRIN2BQ13224 1484 aa44.45■■■■■ 4.71
GNAS-229ENST00000470512 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.43■■■■■ 4.74e-6■■□□□ 11.4
GNAS-229ENST00000470512 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.4■■■■■ 4.7
GNAS-229ENST00000470512 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.37■■■■■ 4.69
GNAS-229ENST00000470512 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.37■■■■■ 4.69
GNAS-229ENST00000470512 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.36■■■■■ 4.69
GNAS-229ENST00000470512 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.36■■■■■ 4.69
GNAS-229ENST00000470512 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.36■■■■■ 4.69
GNAS-229ENST00000470512 TOP2BQ02880 1626 aa44.35■■■■■ 4.69
GNAS-229ENST00000470512 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
GNAS-229ENST00000470512 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.32■■■■■ 4.69
GNAS-229ENST00000470512 SYNJ1O43426 1573 aa44.32■■■■■ 4.69
GNAS-229ENST00000470512 ARHGEF11O15085 1522 aa44.31■■■■■ 4.68
GNAS-229ENST00000470512 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.24■■■■■ 4.67
GNAS-229ENST00000470512 PBRM1Q86U86 1689 aa44.23■■■■■ 4.67
GNAS-229ENST00000470512 SYNJ2O15056 1496 aa44.22■■■■■ 4.67
GNAS-229ENST00000470512 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.05■■■■■ 4.64
GNAS-229ENST00000470512 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.03■■■■■ 4.64
GNAS-229ENST00000470512 ARAP1Q96P48 1450 aa43.92■■■■■ 4.62
GNAS-229ENST00000470512 ADAMTS12P58397 1594 aa43.88■■■■■ 4.62
GNAS-229ENST00000470512 GRIN2AQ12879 1464 aa43.87■■■■■ 4.61
GNAS-229ENST00000470512 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.84■■■■■ 4.61
GNAS-229ENST00000470512 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.84■■■■■ 4.61
GNAS-229ENST00000470512 NUP160Q12769 1436 aa43.69■■■■■ 4.58
GNAS-229ENST00000470512 CEP170Q5SW79 1584 aa43.66■■■■■ 4.58
GNAS-229ENST00000470512 KIF27Q86VH2 1401 aa43.56■■■■■ 4.56
GNAS-229ENST00000470512 IGF1RP08069 1367 aa43.49■■■■■ 4.55
GNAS-229ENST00000470512 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.44■■■■■ 4.54
GNAS-229ENST00000470512 SHROOM2Q13796 1616 aa43.38■■■■■ 4.54
GNAS-229ENST00000470512 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.37■■■■■ 4.53
GNAS-229ENST00000470512 JPH4Q96JJ6 628 aa43.31■■■■■ 4.52
GNAS-229ENST00000470512 CUL7Q14999 1698 aa43.3■■■■■ 4.52
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