RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470356.3

HMG20B-209, Transcript of high mobility group 20B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HMG20B, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20B-209ENST00000470356 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa54.35■■■■■ 6.29
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HMG20B-209ENST00000470356 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa54.11■■■■■ 6.25
HMG20B-209ENST00000470356 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP53.73■■■■■ 6.19
HMG20B-209ENST00000470356 ADCY10Q96PN6 1610 aa53.7■■■■■ 6.19
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HMG20B-209ENST00000470356 IQGAP2Q13576 1575 aa53.67■■■■■ 6.18
HMG20B-209ENST00000470356 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa53.65■■■■■ 6.18
HMG20B-209ENST00000470356 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa53.62■■■■■ 6.17
HMG20B-209ENST00000470356 PTPRGP23470 1445 aa53.6■■■■■ 6.17
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HMG20B-209ENST00000470356 UGGT2Q9NYU1 1516 aa53.37■■■■■ 6.13
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HMG20B-209ENST00000470356 TEX14Q8IWB6 1497 aa52.42■■■■■ 5.98
HMG20B-209ENST00000470356 KCNH8Q96L42 1107 aa52.32■■■■■ 5.97
HMG20B-209ENST00000470356 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP52.3■■■■■ 5.96
HMG20B-209ENST00000470356 ATP10BO94823 1461 aa52.26■■■■■ 5.96
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HMG20B-209ENST00000470356 CFAP43Q8NDM7 1665 aa52.25■■■■■ 5.95
HMG20B-209ENST00000470356 CD109Q6YHK3 1445 aa52.23■■■■■ 5.95
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HMG20B-209ENST00000470356 CHIC1Q5VXU3 224 aa52.2■■■■■ 5.95
HMG20B-209ENST00000470356 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa52.19■■■■■ 5.94
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HMG20B-209ENST00000470356 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa52.18■■■■■ 5.94
HMG20B-209ENST00000470356 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa52.16■■■■■ 5.94
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HMG20B-209ENST00000470356 EFCAB5A4FU69 1503 aa52■■■■■ 5.92
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HMG20B-209ENST00000470356 ADGRL1O94910 1474 aa51.8■■■■■ 5.88
HMG20B-209ENST00000470356 ARAP3Q8WWN8 1544 aa51.79■■■■■ 5.88
HMG20B-209ENST00000470356 PHLDB1Q86UU1 1377 aa51.75■■■■■ 5.88
HMG20B-209ENST00000470356 PLEKHD1A6NEE1 506 aa51.73■■■■■ 5.87
HMG20B-209ENST00000470356 NEO1Q92859 1461 aa51.63■■■■■ 5.86
HMG20B-209ENST00000470356 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa51.58■■■■■ 5.85
HMG20B-209ENST00000470356 FMN1Q68DA7 1419 aa51.55■■■■■ 5.84
HMG20B-209ENST00000470356 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP51.48■■■■■ 5.83
HMG20B-209ENST00000470356 RAPGEF3O95398 923 aa51.46■■■■■ 5.83
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HMG20B-209ENST00000470356 TTC37Q6PGP7 1564 aa51.36■■■■■ 5.81
HMG20B-209ENST00000470356 FANCAO15360 1455 aa51.32■■■■■ 5.81
HMG20B-209ENST00000470356 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa51.32■■■■■ 5.81
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HMG20B-209ENST00000470356 CFAP74Q9C0B2 1584 aa51.29■■■■■ 5.8
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HMG20B-209ENST00000470356 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa51.1■■■■■ 5.77
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HMG20B-209ENST00000470356 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa51.04■■■■■ 5.76
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HMG20B-209ENST00000470356 ADAMTSL3P82987 1691 aa51.02■■■■■ 5.76
HMG20B-209ENST00000470356 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa51.01■■■■■ 5.76
HMG20B-209ENST00000470356 CLIP1P30622 1438 aa51■■■■■ 5.75
HMG20B-209ENST00000470356 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa50.99■■■■■ 5.75
HMG20B-209ENST00000470356 SCAPERQ9BY12 1400 aa50.97■■■■■ 5.75
HMG20B-209ENST00000470356 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP50.97■■■■■ 5.75
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HMG20B-209ENST00000470356 HECW2Q9P2P5 1572 aa50.96■■■■■ 5.75
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