RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470199.2

LMNA-211, Transcript of lamin A/C, humanhuman

TSL 4

Gene LMNA, Length 551 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LMNA-211ENST00000470199 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
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LMNA-211ENST00000470199 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.62■■■□□ 2.17
LMNA-211ENST00000470199 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
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LMNA-211ENST00000470199 CD109Q6YHK3 1445 aa28.56■■■□□ 2.16
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LMNA-211ENST00000470199 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.51■■■□□ 2.15
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LMNA-211ENST00000470199 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.44■■■□□ 2.14
LMNA-211ENST00000470199 KIF14Q15058 1648 aa28.43■■■□□ 2.14
LMNA-211ENST00000470199 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.43■■■□□ 2.14
LMNA-211ENST00000470199 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
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LMNA-211ENST00000470199 TIAM1Q13009 1591 aa28.26■■■□□ 2.11
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LMNA-211ENST00000470199 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.22■■■□□ 2.11
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LMNA-211ENST00000470199 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
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LMNA-211ENST00000470199 RAPGEF3O95398 923 aa28.19■■■□□ 2.1
LMNA-211ENST00000470199 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.19■■■□□ 2.1
LMNA-211ENST00000470199 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.17■■■□□ 2.1
LMNA-211ENST00000470199 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.16■■■□□ 2.1
LMNA-211ENST00000470199 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.15■■■□□ 2.1
LMNA-211ENST00000470199 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.15■■■□□ 2.1
LMNA-211ENST00000470199 MAP3K1Q13233 1512 aa28.14■■■□□ 2.1
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