RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 CUL7Q14999 1698 aa38.91■■■■□ 3.82
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OPN3-204ENST00000469376 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP38.81■■■■□ 3.8
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OPN3-204ENST00000469376 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.74■■■■□ 3.79
OPN3-204ENST00000469376 ADAMTS12P58397 1594 aa38.72■■■■□ 3.79
OPN3-204ENST00000469376 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.7■■■■□ 3.79
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OPN3-204ENST00000469376 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.68■■■■□ 3.78
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OPN3-204ENST00000469376 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
OPN3-204ENST00000469376 GRIN2AQ12879 1464 aa38.47■■■■□ 3.75
OPN3-204ENST00000469376 FBLN2P98095 1184 aa38.45■■■■□ 3.75
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OPN3-204ENST00000469376 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
OPN3-204ENST00000469376 CLSPNQ9HAW4 1339 aa38.39■■■■□ 3.74
OPN3-204ENST00000469376 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.37■■■■□ 3.73
OPN3-204ENST00000469376 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.34■■■■□ 3.73
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OPN3-204ENST00000469376 CEP170Q5SW79 1584 aa38.22■■■■□ 3.71
OPN3-204ENST00000469376 NUP160Q12769 1436 aa38.22■■■■□ 3.71
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OPN3-204ENST00000469376 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.82■■■■□ 3.65
OPN3-204ENST00000469376 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.82■■■■□ 3.64
OPN3-204ENST00000469376 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.81■■■■□ 3.64
OPN3-204ENST00000469376 KIAA0556O60303 1618 aa37.79■■■■□ 3.64
OPN3-204ENST00000469376 OSCARQ8IYS5 282 aa37.77■■■■□ 3.64
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OPN3-204ENST00000469376 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.72■■■■□ 3.63
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OPN3-204ENST00000469376 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.61■■■■□ 3.61
OPN3-204ENST00000469376 ITGAEP38570 1179 aa37.59■■■■□ 3.61
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OPN3-204ENST00000469376 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.47■■■■□ 3.59
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OPN3-204ENST00000469376 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.36■■■■□ 3.57
OPN3-204ENST00000469376 HECW1Q76N89 1606 aa37.36■■■■□ 3.57
OPN3-204ENST00000469376 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.36■■■■□ 3.57
OPN3-204ENST00000469376 ABCA8O94911 1581 aa37.29■■■■□ 3.56
OPN3-204ENST00000469376 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.27■■■■□ 3.56
OPN3-204ENST00000469376 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.27■■■■□ 3.56
OPN3-204ENST00000469376 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa37.27■■■■□ 3.56
OPN3-204ENST00000469376 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
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OPN3-204ENST00000469376 ARID3CA6NKF2 412 aa37.21■■■■□ 3.55
OPN3-204ENST00000469376 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.2■■■■□ 3.55
OPN3-204ENST00000469376 UACAQ9BZF9 1416 aa37.2■■■■□ 3.55
OPN3-204ENST00000469376 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
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OPN3-204ENST00000469376 ARHGEF11O15085 1522 aa37.1■■■■□ 3.53
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OPN3-204ENST00000469376 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.98■■■■□ 3.51
OPN3-204ENST00000469376 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.96■■■■□ 3.51
OPN3-204ENST00000469376 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.95■■■■□ 3.5
OPN3-204ENST00000469376 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.95■■■■□ 3.5
OPN3-204ENST00000469376 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.95■■■■□ 3.5
OPN3-204ENST00000469376 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.92■■■■□ 3.5
OPN3-204ENST00000469376 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
OPN3-204ENST00000469376 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.89■■■■□ 3.5
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