RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468468.5

TSPAN4-211, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-211ENST00000468468 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.31■■□□□ 1.32
TSPAN4-211ENST00000468468 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
TSPAN4-211ENST00000468468 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.24■■□□□ 1.31
TSPAN4-211ENST00000468468 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TSPAN4-211ENST00000468468 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TSPAN4-211ENST00000468468 WDR97A6NE52 1622 aa23.22■■□□□ 1.31
TSPAN4-211ENST00000468468 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
TSPAN4-211ENST00000468468 CUL7Q14999 1698 aa23.15■■□□□ 1.3
TSPAN4-211ENST00000468468 P3H3Q8IVL6 736 aa23.14■■□□□ 1.29
TSPAN4-211ENST00000468468 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.14■■□□□ 1.29
TSPAN4-211ENST00000468468 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.13■■□□□ 1.29
TSPAN4-211ENST00000468468 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.1■■□□□ 1.29
TSPAN4-211ENST00000468468 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
TSPAN4-211ENST00000468468 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.06■■□□□ 1.28
TSPAN4-211ENST00000468468 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.03■■□□□ 1.28
TSPAN4-211ENST00000468468 ITGAEP38570 1179 aa23.02■■□□□ 1.28
TSPAN4-211ENST00000468468 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.01■■□□□ 1.27
TSPAN4-211ENST00000468468 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.98■■□□□ 1.27
TSPAN4-211ENST00000468468 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.274e-8■■■■■ 31.9
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TSPAN4-211ENST00000468468 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TSPAN4-211ENST00000468468 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TSPAN4-211ENST00000468468 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.95■■□□□ 1.26
TSPAN4-211ENST00000468468 MAP3K1Q13233 1512 aa22.94■■□□□ 1.26
TSPAN4-211ENST00000468468 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-211ENST00000468468 PBRM1Q86U86 1689 aa22.9■■□□□ 1.26
TSPAN4-211ENST00000468468 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.89■■□□□ 1.26
TSPAN4-211ENST00000468468 WDR62O43379 1518 aa22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TSPAN4-211ENST00000468468 ERCC6Q03468 1493 aa22.86■■□□□ 1.25
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TSPAN4-211ENST00000468468 IFT140Q96RY7 1462 aa22.84■■□□□ 1.25
TSPAN4-211ENST00000468468 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.84■■□□□ 1.25
TSPAN4-211ENST00000468468 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.83■■□□□ 1.25
TSPAN4-211ENST00000468468 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.82■■□□□ 1.24
TSPAN4-211ENST00000468468 GRIN2BQ13224 1484 aa22.82■■□□□ 1.24
TSPAN4-211ENST00000468468 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.82■■□□□ 1.24
TSPAN4-211ENST00000468468 SAMD9Q5K651 1589 aa22.82■■□□□ 1.24
TSPAN4-211ENST00000468468 FMN1Q68DA7 1419 aa22.81■■□□□ 1.24
TSPAN4-211ENST00000468468 ADAMTS12P58397 1594 aa22.81■■□□□ 1.24
TSPAN4-211ENST00000468468 MAPKBP1O60336 1514 aa22.8■■□□□ 1.24
TSPAN4-211ENST00000468468 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TSPAN4-211ENST00000468468 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.78■■□□□ 1.24
TSPAN4-211ENST00000468468 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
TSPAN4-211ENST00000468468 IQGAP2Q13576 1575 aa22.7■■□□□ 1.22
TSPAN4-211ENST00000468468 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TSPAN4-211ENST00000468468 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.67■■□□□ 1.22
TSPAN4-211ENST00000468468 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.66■■□□□ 1.22
TSPAN4-211ENST00000468468 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.64■■□□□ 1.21
TSPAN4-211ENST00000468468 GRIN2AQ12879 1464 aa22.58■■□□□ 1.21
TSPAN4-211ENST00000468468 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TSPAN4-211ENST00000468468 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
TSPAN4-211ENST00000468468 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.55■■□□□ 1.2
TSPAN4-211ENST00000468468 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.55■■□□□ 1.2
TSPAN4-211ENST00000468468 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.55■■□□□ 1.2
TSPAN4-211ENST00000468468 KCNH8Q96L42 1107 aa22.55■■□□□ 1.2
TSPAN4-211ENST00000468468 FBLN2P98095 1184 aa22.53■■□□□ 1.2
TSPAN4-211ENST00000468468 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.53■■□□□ 1.2
TSPAN4-211ENST00000468468 ARID3CA6NKF2 412 aa22.53■■□□□ 1.2
TSPAN4-211ENST00000468468 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
TSPAN4-211ENST00000468468 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
TSPAN4-211ENST00000468468 NCOA2Q15596 1464 aa22.52■■□□□ 1.19
TSPAN4-211ENST00000468468 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.19
TSPAN4-211ENST00000468468 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.51■■□□□ 1.19
TSPAN4-211ENST00000468468 BCL11AQ9H165 835 aa22.51■■□□□ 1.19
TSPAN4-211ENST00000468468 DISP1Q96F81 1524 aa22.49■■□□□ 1.19
TSPAN4-211ENST00000468468 HECW1Q76N89 1606 aa22.49■■□□□ 1.19
TSPAN4-211ENST00000468468 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
TSPAN4-211ENST00000468468 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.48■■□□□ 1.19
TSPAN4-211ENST00000468468 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.48■■□□□ 1.19
TSPAN4-211ENST00000468468 SYNJ2O15056 1496 aa22.48■■□□□ 1.19
TSPAN4-211ENST00000468468 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
TSPAN4-211ENST00000468468 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
TSPAN4-211ENST00000468468 KIAA0556O60303 1618 aa22.46■■□□□ 1.19
TSPAN4-211ENST00000468468 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.19
TSPAN4-211ENST00000468468 CEP170Q5SW79 1584 aa22.45■■□□□ 1.18
TSPAN4-211ENST00000468468 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.44■■□□□ 1.18
TSPAN4-211ENST00000468468 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TSPAN4-211ENST00000468468 PTPRKQ15262 1439 aa22.39■■□□□ 1.18
TSPAN4-211ENST00000468468 ARHGEF11O15085 1522 aa22.39■■□□□ 1.17
TSPAN4-211ENST00000468468 HFM1A2PYH4 1435 aa22.38■■□□□ 1.17
TSPAN4-211ENST00000468468 TONSLQ96HA7 1378 aa22.37■■□□□ 1.17
TSPAN4-211ENST00000468468 UACAQ9BZF9 1416 aa22.36■■□□□ 1.17
TSPAN4-211ENST00000468468 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.35■■□□□ 1.17
TSPAN4-211ENST00000468468 NUP160Q12769 1436 aa22.35■■□□□ 1.17
TSPAN4-211ENST00000468468 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
TSPAN4-211ENST00000468468 JPH4Q96JJ6 628 aa22.33■■□□□ 1.17
TSPAN4-211ENST00000468468 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.31■■□□□ 1.16
TSPAN4-211ENST00000468468 NAIPQ13075 1403 aa22.31■■□□□ 1.16
TSPAN4-211ENST00000468468 ANP32CO43423 234 aa22.3■■□□□ 1.16
TSPAN4-211ENST00000468468 CCER2I3L3R5 266 aa22.28■■□□□ 1.16
TSPAN4-211ENST00000468468 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.28■■□□□ 1.16
TSPAN4-211ENST00000468468 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.25■■□□□ 1.15
TSPAN4-211ENST00000468468 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.24■■□□□ 1.15
TSPAN4-211ENST00000468468 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TSPAN4-211ENST00000468468 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.21■■□□□ 1.15
TSPAN4-211ENST00000468468 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.21■■□□□ 1.15
TSPAN4-211ENST00000468468 MIA2Q96PC5 1412 aa22.2■■□□□ 1.14
TSPAN4-211ENST00000468468 FKBP8Q14318 412 aa22.2■■□□□ 1.14
TSPAN4-211ENST00000468468 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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