RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468247.1

RERE-210, Transcript of arginine-glutamic acid dipeptide repeats, humanhuman

TSL 2

Gene RERE, Length 414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RERE-210ENST00000468247 JPH4Q96JJ6 628 aa36.29■■■■□ 3.4
RERE-210ENST00000468247 CUL7Q14999 1698 aa36.27■■■■□ 3.4
RERE-210ENST00000468247 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.17■■■■□ 3.38
RERE-210ENST00000468247 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.14■■■■□ 3.38
RERE-210ENST00000468247 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.87■■■■□ 3.33
RERE-210ENST00000468247 IQGAP2Q13576 1575 aa35.85■■■■□ 3.33
RERE-210ENST00000468247 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.83■■■■□ 3.33
RERE-210ENST00000468247 PTPRGP23470 1445 aa35.74■■■■□ 3.31
RERE-210ENST00000468247 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
RERE-210ENST00000468247 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.73■■■■□ 3.31
RERE-210ENST00000468247 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.71■■■■□ 3.31
RERE-210ENST00000468247 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.71■■■■□ 3.31
RERE-210ENST00000468247 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.71■■■■□ 3.31
RERE-210ENST00000468247 DISP1Q96F81 1524 aa35.7■■■■□ 3.31
RERE-210ENST00000468247 MAPKBP1O60336 1514 aa35.67■■■■□ 3.3
RERE-210ENST00000468247 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.64■■■■□ 3.3
RERE-210ENST00000468247 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.62■■■■□ 3.29
RERE-210ENST00000468247 PRXQ9BXM0 1461 aa35.62■■■■□ 3.29
RERE-210ENST00000468247 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.58■■■■□ 3.29
RERE-210ENST00000468247 DIP2BQ9P265 1576 aa35.55■■■■□ 3.28
RERE-210ENST00000468247 KIAA0556O60303 1618 aa35.54■■■■□ 3.28
RERE-210ENST00000468247 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.52■■■■□ 3.28
RERE-210ENST00000468247 ABCC2Q92887 1545 aa35.51■■■■□ 3.27
RERE-210ENST00000468247 UACAQ9BZF9 1416 aa35.49■■■■□ 3.27
RERE-210ENST00000468247 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.48■■■■□ 3.27
RERE-210ENST00000468247 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.42■■■■□ 3.26
RERE-210ENST00000468247 ASXL2Q76L83 1435 aa35.38■■■■□ 3.25
RERE-210ENST00000468247 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.33■■■■□ 3.25
RERE-210ENST00000468247 GOLGA3Q08378 1498 aa35.33■■■■□ 3.25
RERE-210ENST00000468247 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.3■■■■□ 3.24
RERE-210ENST00000468247 EEA1Q15075 1411 aa35.27■■■■□ 3.24
RERE-210ENST00000468247 TSPOAP1O95153 1857 aa35.26■■■■□ 3.24
RERE-210ENST00000468247 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
RERE-210ENST00000468247 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
RERE-210ENST00000468247 ABCA8O94911 1581 aa35.2■■■■□ 3.23
RERE-210ENST00000468247 GLI2P10070 1586 aa35.2■■■■□ 3.23
RERE-210ENST00000468247 P3H3Q8IVL6 736 aa35.17■■■■□ 3.22
RERE-210ENST00000468247 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
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RERE-210ENST00000468247 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
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RERE-210ENST00000468247 SAMD9Q5K651 1589 aa35.09■■■■□ 3.21
RERE-210ENST00000468247 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.07■■■■□ 3.2
RERE-210ENST00000468247 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.03■■■■□ 3.2
RERE-210ENST00000468247 KIF21BO75037 1637 aa35.01■■■■□ 3.19
RERE-210ENST00000468247 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
RERE-210ENST00000468247 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
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RERE-210ENST00000468247 ATP10BO94823 1461 aa34.92■■■■□ 3.18
RERE-210ENST00000468247 KCNH8Q96L42 1107 aa34.92■■■■□ 3.18
RERE-210ENST00000468247 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.9■■■■□ 3.18
RERE-210ENST00000468247 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
RERE-210ENST00000468247 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.87■■■■□ 3.17
RERE-210ENST00000468247 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.86■■■■□ 3.17
RERE-210ENST00000468247 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.86■■■■□ 3.17
RERE-210ENST00000468247 CD109Q6YHK3 1445 aa34.81■■■■□ 3.16
RERE-210ENST00000468247 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.79■■■■□ 3.16
RERE-210ENST00000468247 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
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RERE-210ENST00000468247 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.76■■■■□ 3.16
RERE-210ENST00000468247 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
RERE-210ENST00000468247 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.69■■■■□ 3.14
RERE-210ENST00000468247 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.68■■■■□ 3.14
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RERE-210ENST00000468247 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.63■■■■□ 3.13
RERE-210ENST00000468247 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.58■■■■□ 3.13
RERE-210ENST00000468247 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.5■■■■□ 3.11
RERE-210ENST00000468247 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
RERE-210ENST00000468247 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.49■■■■□ 3.11
RERE-210ENST00000468247 ADGRL1O94910 1474 aa34.46■■■■□ 3.11
RERE-210ENST00000468247 FMN1Q68DA7 1419 aa34.45■■■■□ 3.11
RERE-210ENST00000468247 NEO1Q92859 1461 aa34.39■■■■□ 3.1
RERE-210ENST00000468247 PHLDB1Q86UU1 1377 aa34.39■■■■□ 3.1
RERE-210ENST00000468247 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.39■■■■□ 3.1
RERE-210ENST00000468247 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
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RERE-210ENST00000468247 RAPGEF3O95398 923 aa34.35■■■■□ 3.09
RERE-210ENST00000468247 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.35■■■■□ 3.09
RERE-210ENST00000468247 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.28■■■■□ 3.08
RERE-210ENST00000468247 FANCAO15360 1455 aa34.24■■■■□ 3.07
RERE-210ENST00000468247 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.24■■■■□ 3.07
RERE-210ENST00000468247 AKNAQ7Z591 1439 aa34.23■■■■□ 3.07
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RERE-210ENST00000468247 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
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RERE-210ENST00000468247 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.15■■■■□ 3.06
RERE-210ENST00000468247 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
RERE-210ENST00000468247 CLIP1P30622 1438 aa34.13■■■■□ 3.05
RERE-210ENST00000468247 RICTORQ6R327 1708 aa34.13■■■■□ 3.05
RERE-210ENST00000468247 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.04■■■■□ 3.04
RERE-210ENST00000468247 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.03■■■■□ 3.04
RERE-210ENST00000468247 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.03■■■■□ 3.04
RERE-210ENST00000468247 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.03■■■■□ 3.04
RERE-210ENST00000468247 FYCO1Q9BQS8 1478 aa34.01■■■■□ 3.04
RERE-210ENST00000468247 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34■■■■□ 3.03
RERE-210ENST00000468247 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.99■■■■□ 3.03
RERE-210ENST00000468247 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.98■■■■□ 3.03
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