RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466244.1

RAB17-209, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB17, Length 937 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17-209ENST00000466244 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.47■■□□□ 1.67
RAB17-209ENST00000466244 EEA1Q15075 1411 aa25.46■■□□□ 1.67
RAB17-209ENST00000466244 ARAP1Q96P48 1450 aa25.45■■□□□ 1.66
RAB17-209ENST00000466244 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.37■■□□□ 1.65
RAB17-209ENST00000466244 JPH4Q96JJ6 628 aa25.34■■□□□ 1.65
RAB17-209ENST00000466244 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.33■■□□□ 1.65
RAB17-209ENST00000466244 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
RAB17-209ENST00000466244 IQGAP2Q13576 1575 aa25.3■■□□□ 1.64
RAB17-209ENST00000466244 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.26■■□□□ 1.63
RAB17-209ENST00000466244 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.22■■□□□ 1.63
RAB17-209ENST00000466244 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.22■■□□□ 1.63
RAB17-209ENST00000466244 KIF21BO75037 1637 aa25.2■■□□□ 1.62
RAB17-209ENST00000466244 DISP1Q96F81 1524 aa25.17■■□□□ 1.62
RAB17-209ENST00000466244 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.12■■□□□ 1.61
RAB17-209ENST00000466244 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
RAB17-209ENST00000466244 KIAA0556O60303 1618 aa25.07■■□□□ 1.6
RAB17-209ENST00000466244 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.05■■□□□ 1.6
RAB17-209ENST00000466244 GOLGA3Q08378 1498 aa25.02■■□□□ 1.6
RAB17-209ENST00000466244 PTPRGP23470 1445 aa25.01■■□□□ 1.59
RAB17-209ENST00000466244 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.97■■□□□ 1.59
RAB17-209ENST00000466244 SAMD9Q5K651 1589 aa24.97■■□□□ 1.59
RAB17-209ENST00000466244 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.94■■□□□ 1.58
RAB17-209ENST00000466244 UACAQ9BZF9 1416 aa24.87■■□□□ 1.57
RAB17-209ENST00000466244 ABCC2Q92887 1545 aa24.86■■□□□ 1.57
RAB17-209ENST00000466244 MAPKBP1O60336 1514 aa24.86■■□□□ 1.57
RAB17-209ENST00000466244 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.85■■□□□ 1.57
RAB17-209ENST00000466244 ABCA8O94911 1581 aa24.83■■□□□ 1.57
RAB17-209ENST00000466244 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.81■■□□□ 1.56
RAB17-209ENST00000466244 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.78■■□□□ 1.56
RAB17-209ENST00000466244 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
RAB17-209ENST00000466244 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.71■■□□□ 1.55
RAB17-209ENST00000466244 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.7■■□□□ 1.55
RAB17-209ENST00000466244 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.7■■□□□ 1.55
RAB17-209ENST00000466244 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
RAB17-209ENST00000466244 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.7■■□□□ 1.54
RAB17-209ENST00000466244 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
RAB17-209ENST00000466244 P3H3Q8IVL6 736 aa24.67■■□□□ 1.54
RAB17-209ENST00000466244 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.66■■□□□ 1.54
RAB17-209ENST00000466244 DIP2BQ9P265 1576 aa24.66■■□□□ 1.54
RAB17-209ENST00000466244 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.64■■□□□ 1.54
RAB17-209ENST00000466244 ASXL2Q76L83 1435 aa24.64■■□□□ 1.54
RAB17-209ENST00000466244 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
RAB17-209ENST00000466244 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.63■■□□□ 1.53
RAB17-209ENST00000466244 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
RAB17-209ENST00000466244 GLI2P10070 1586 aa24.58■■□□□ 1.52
RAB17-209ENST00000466244 ATP10BO94823 1461 aa24.58■■□□□ 1.52
RAB17-209ENST00000466244 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
RAB17-209ENST00000466244 FMN1Q68DA7 1419 aa24.57■■□□□ 1.52
RAB17-209ENST00000466244 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.55■■□□□ 1.52
RAB17-209ENST00000466244 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
RAB17-209ENST00000466244 CLIP1P30622 1438 aa24.52■■□□□ 1.52
RAB17-209ENST00000466244 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.49■■□□□ 1.51
RAB17-209ENST00000466244 HECW1Q76N89 1606 aa24.44■■□□□ 1.5
RAB17-209ENST00000466244 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.44■■□□□ 1.5
RAB17-209ENST00000466244 CEP162Q5TB80 1403 aa24.44■■□□□ 1.5
RAB17-209ENST00000466244 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.42■■□□□ 1.5
RAB17-209ENST00000466244 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
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RAB17-209ENST00000466244 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
RAB17-209ENST00000466244 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.37■■□□□ 1.49
RAB17-209ENST00000466244 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
RAB17-209ENST00000466244 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.35■■□□□ 1.49
RAB17-209ENST00000466244 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.35■■□□□ 1.49
RAB17-209ENST00000466244 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.34■■□□□ 1.49
RAB17-209ENST00000466244 ARID3CA6NKF2 412 aa24.33■■□□□ 1.49
RAB17-209ENST00000466244 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.31■■□□□ 1.48
RAB17-209ENST00000466244 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.3■■□□□ 1.48
RAB17-209ENST00000466244 CD109Q6YHK3 1445 aa24.27■■□□□ 1.48
RAB17-209ENST00000466244 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.26■■□□□ 1.47
RAB17-209ENST00000466244 TSPOAP1O95153 1857 aa24.26■■□□□ 1.47
RAB17-209ENST00000466244 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.26■■□□□ 1.47
RAB17-209ENST00000466244 KCNH8Q96L42 1107 aa24.25■■□□□ 1.47
RAB17-209ENST00000466244 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
RAB17-209ENST00000466244 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
RAB17-209ENST00000466244 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.21■■□□□ 1.47
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RAB17-209ENST00000466244 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.17■■□□□ 1.46
RAB17-209ENST00000466244 KDM6BO15054 1643 aa24.17■■□□□ 1.46
RAB17-209ENST00000466244 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
RAB17-209ENST00000466244 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
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RAB17-209ENST00000466244 NEO1Q92859 1461 aa24.13■■□□□ 1.45
RAB17-209ENST00000466244 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.12■■□□□ 1.45
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RAB17-209ENST00000466244 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.02■■□□□ 1.44
RAB17-209ENST00000466244 TIAM1Q13009 1591 aa24.02■■□□□ 1.44
RAB17-209ENST00000466244 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24■■□□□ 1.43
RAB17-209ENST00000466244 PREX2Q70Z35 1606 aa23.98■■□□□ 1.43
RAB17-209ENST00000466244 AKNAQ7Z591 1439 aa23.97■■□□□ 1.43
RAB17-209ENST00000466244 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.95■■□□□ 1.43
RAB17-209ENST00000466244 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.95■■□□□ 1.42
RAB17-209ENST00000466244 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.95■■□□□ 1.42
RAB17-209ENST00000466244 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.93■■□□□ 1.42
RAB17-209ENST00000466244 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
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