RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466223.1

AGRN-204, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 2

Gene AGRN, Length 459 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-204ENST00000466223 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.28■■□□□ 1.8
AGRN-204ENST00000466223 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.28■■□□□ 1.8
AGRN-204ENST00000466223 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.28■■□□□ 1.8
AGRN-204ENST00000466223 JPH4Q96JJ6 628 aa26.27■■□□□ 1.8
AGRN-204ENST00000466223 SHROOM2Q13796 1616 aa26.21■■□□□ 1.79
AGRN-204ENST00000466223 IQGAP2Q13576 1575 aa26.18■■□□□ 1.78
AGRN-204ENST00000466223 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
AGRN-204ENST00000466223 KIF21BO75037 1637 aa26.16■■□□□ 1.78
AGRN-204ENST00000466223 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.15■■□□□ 1.78
AGRN-204ENST00000466223 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.14■■□□□ 1.78
AGRN-204ENST00000466223 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.08■■□□□ 1.77
AGRN-204ENST00000466223 ARAP1Q96P48 1450 aa26.08■■□□□ 1.77
AGRN-204ENST00000466223 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.07■■□□□ 1.76
AGRN-204ENST00000466223 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.07■■□□□ 1.76
AGRN-204ENST00000466223 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
AGRN-204ENST00000466223 GOLGA3Q08378 1498 aa26.06■■□□□ 1.76
AGRN-204ENST00000466223 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.02■■□□□ 1.76
AGRN-204ENST00000466223 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.94■■□□□ 1.74
AGRN-204ENST00000466223 DISP1Q96F81 1524 aa25.93■■□□□ 1.74
AGRN-204ENST00000466223 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
AGRN-204ENST00000466223 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
AGRN-204ENST00000466223 PTPRGP23470 1445 aa25.91■■□□□ 1.74
AGRN-204ENST00000466223 KIAA0556O60303 1618 aa25.9■■□□□ 1.74
AGRN-204ENST00000466223 P3H3Q8IVL6 736 aa25.83■■□□□ 1.73
AGRN-204ENST00000466223 SAMD9Q5K651 1589 aa25.79■■□□□ 1.72
AGRN-204ENST00000466223 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.78■■□□□ 1.72
AGRN-204ENST00000466223 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.77■■□□□ 1.72
AGRN-204ENST00000466223 UACAQ9BZF9 1416 aa25.72■■□□□ 1.71
AGRN-204ENST00000466223 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.69■■□□□ 1.7
AGRN-204ENST00000466223 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.68■■□□□ 1.7
AGRN-204ENST00000466223 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
AGRN-204ENST00000466223 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.68■■□□□ 1.7
AGRN-204ENST00000466223 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.66■■□□□ 1.7
AGRN-204ENST00000466223 ABCC2Q92887 1545 aa25.64■■□□□ 1.7
AGRN-204ENST00000466223 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.63■■□□□ 1.69
AGRN-204ENST00000466223 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.63■■□□□ 1.69
AGRN-204ENST00000466223 CLIP1P30622 1438 aa25.6■■□□□ 1.69
AGRN-204ENST00000466223 ABCA8O94911 1581 aa25.6■■□□□ 1.69
AGRN-204ENST00000466223 FMN1Q68DA7 1419 aa25.56■■□□□ 1.68
AGRN-204ENST00000466223 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.54■■□□□ 1.68
AGRN-204ENST00000466223 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.53■■□□□ 1.68
AGRN-204ENST00000466223 CEP162Q5TB80 1403 aa25.52■■□□□ 1.68
AGRN-204ENST00000466223 MAPKBP1O60336 1514 aa25.5■■□□□ 1.67
AGRN-204ENST00000466223 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
AGRN-204ENST00000466223 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
AGRN-204ENST00000466223 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
AGRN-204ENST00000466223 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
AGRN-204ENST00000466223 ARID3CA6NKF2 412 aa25.46■■□□□ 1.67
AGRN-204ENST00000466223 ASXL2Q76L83 1435 aa25.43■■□□□ 1.66
AGRN-204ENST00000466223 ATP10BO94823 1461 aa25.41■■□□□ 1.66
AGRN-204ENST00000466223 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
AGRN-204ENST00000466223 HECW1Q76N89 1606 aa25.38■■□□□ 1.65
AGRN-204ENST00000466223 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.38■■□□□ 1.65
AGRN-204ENST00000466223 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.37■■□□□ 1.65
AGRN-204ENST00000466223 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.35■■□□□ 1.65
AGRN-204ENST00000466223 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.34■■□□□ 1.65
AGRN-204ENST00000466223 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.32■■□□□ 1.64
AGRN-204ENST00000466223 KCNH8Q96L42 1107 aa25.32■■□□□ 1.64
AGRN-204ENST00000466223 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.32■■□□□ 1.64
AGRN-204ENST00000466223 DIP2BQ9P265 1576 aa25.31■■□□□ 1.64
AGRN-204ENST00000466223 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
AGRN-204ENST00000466223 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
AGRN-204ENST00000466223 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
AGRN-204ENST00000466223 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.29■■□□□ 1.64
AGRN-204ENST00000466223 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
AGRN-204ENST00000466223 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.25■■□□□ 1.63
AGRN-204ENST00000466223 GLI2P10070 1586 aa25.24■■□□□ 1.63
AGRN-204ENST00000466223 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.2■■□□□ 1.63
AGRN-204ENST00000466223 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.19■■□□□ 1.62
AGRN-204ENST00000466223 TSPOAP1O95153 1857 aa25.16■■□□□ 1.62
AGRN-204ENST00000466223 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.13■■□□□ 1.61
AGRN-204ENST00000466223 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.12■■□□□ 1.61
AGRN-204ENST00000466223 CD109Q6YHK3 1445 aa25.12■■□□□ 1.61
AGRN-204ENST00000466223 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
AGRN-204ENST00000466223 APLP2Q06481 763 aa25.09■■□□□ 1.61
AGRN-204ENST00000466223 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.08■■□□□ 1.6
AGRN-204ENST00000466223 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
AGRN-204ENST00000466223 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.06■■□□□ 1.6
AGRN-204ENST00000466223 KIF14Q15058 1648 aa25.04■■□□□ 1.6
AGRN-204ENST00000466223 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.04■■□□□ 1.6
AGRN-204ENST00000466223 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.02■■□□□ 1.6
AGRN-204ENST00000466223 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
AGRN-204ENST00000466223 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
AGRN-204ENST00000466223 TIAM1Q13009 1591 aa24.98■■□□□ 1.59
AGRN-204ENST00000466223 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.97■■□□□ 1.59
AGRN-204ENST00000466223 MAP3K1Q13233 1512 aa24.96■■□□□ 1.59
AGRN-204ENST00000466223 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.94■■□□□ 1.58
AGRN-204ENST00000466223 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.92■■□□□ 1.58
AGRN-204ENST00000466223 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.92■■□□□ 1.58
AGRN-204ENST00000466223 PLCH2O75038 1416 aa24.91■■□□□ 1.58
AGRN-204ENST00000466223 KDM6BO15054 1643 aa24.9■■□□□ 1.58
AGRN-204ENST00000466223 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.89■■□□□ 1.58
AGRN-204ENST00000466223 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.89■■□□□ 1.57
AGRN-204ENST00000466223 NEO1Q92859 1461 aa24.89■■□□□ 1.57
AGRN-204ENST00000466223 FANCAO15360 1455 aa24.87■■□□□ 1.57
AGRN-204ENST00000466223 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.87■■□□□ 1.57
AGRN-204ENST00000466223 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.86■■□□□ 1.57
AGRN-204ENST00000466223 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
AGRN-204ENST00000466223 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.85■■□□□ 1.57
AGRN-204ENST00000466223 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
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