RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465525.6

PTPRU-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 1,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-206ENST00000465525 NUP160Q12769 1436 aa27.86■■■□□ 2.05
PTPRU-206ENST00000465525 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.84■■■□□ 2.05
PTPRU-206ENST00000465525 CEP170Q5SW79 1584 aa27.82■■■□□ 2.04
PTPRU-206ENST00000465525 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
PTPRU-206ENST00000465525 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.75■■■□□ 2.03
PTPRU-206ENST00000465525 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.71■■■□□ 2.03
PTPRU-206ENST00000465525 IQGAP2Q13576 1575 aa27.69■■■□□ 2.02
PTPRU-206ENST00000465525 CEP162Q5TB80 1403 aa27.69■■■□□ 2.02
PTPRU-206ENST00000465525 JPH4Q96JJ6 628 aa27.65■■■□□ 2.02
PTPRU-206ENST00000465525 CLIP1P30622 1438 aa27.61■■■□□ 2.01
PTPRU-206ENST00000465525 SHROOM2Q13796 1616 aa27.55■■■□□ 2
PTPRU-206ENST00000465525 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.52■■■□□ 2
PTPRU-206ENST00000465525 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.52■■■□□ 2
PTPRU-206ENST00000465525 P3H3Q8IVL6 736 aa27.52■■■□□ 2
PTPRU-206ENST00000465525 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
PTPRU-206ENST00000465525 SAMD9Q5K651 1589 aa27.49■■□□□ 1.99
PTPRU-206ENST00000465525 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.46■■□□□ 1.99
PTPRU-206ENST00000465525 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.45■■□□□ 1.99
PTPRU-206ENST00000465525 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.45■■□□□ 1.98
PTPRU-206ENST00000465525 ARAP1Q96P48 1450 aa27.44■■□□□ 1.98
PTPRU-206ENST00000465525 DISP1Q96F81 1524 aa27.44■■□□□ 1.98
PTPRU-206ENST00000465525 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.43■■□□□ 1.98
PTPRU-206ENST00000465525 KIAA0556O60303 1618 aa27.43■■□□□ 1.98
PTPRU-206ENST00000465525 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.39■■□□□ 1.98
PTPRU-206ENST00000465525 ARHGEF11O15085 1522 aa27.38■■□□□ 1.97
PTPRU-206ENST00000465525 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
PTPRU-206ENST00000465525 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRU-206ENST00000465525 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRU-206ENST00000465525 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRU-206ENST00000465525 PTPRGP23470 1445 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRU-206ENST00000465525 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.26■■□□□ 1.95
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PTPRU-206ENST00000465525 FMN1Q68DA7 1419 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRU-206ENST00000465525 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRU-206ENST00000465525 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
PTPRU-206ENST00000465525 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRU-206ENST00000465525 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRU-206ENST00000465525 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRU-206ENST00000465525 UACAQ9BZF9 1416 aa27.09■■□□□ 1.93
PTPRU-206ENST00000465525 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRU-206ENST00000465525 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.08■■□□□ 1.92
PTPRU-206ENST00000465525 ABCA8O94911 1581 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRU-206ENST00000465525 ARID3CA6NKF2 412 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRU-206ENST00000465525 HECW1Q76N89 1606 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRU-206ENST00000465525 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRU-206ENST00000465525 ABCC2Q92887 1545 aa27■■□□□ 1.91
PTPRU-206ENST00000465525 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PTPRU-206ENST00000465525 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PTPRU-206ENST00000465525 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.96■■□□□ 1.91
PTPRU-206ENST00000465525 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
PTPRU-206ENST00000465525 APLP2Q06481 763 aa26.95■■□□□ 1.91
PTPRU-206ENST00000465525 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.95■■□□□ 1.9
PTPRU-206ENST00000465525 TIAM1Q13009 1591 aa26.93■■□□□ 1.9
PTPRU-206ENST00000465525 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
PTPRU-206ENST00000465525 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
PTPRU-206ENST00000465525 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRU-206ENST00000465525 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.88■■□□□ 1.89
PTPRU-206ENST00000465525 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PTPRU-206ENST00000465525 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
PTPRU-206ENST00000465525 ATP10BO94823 1461 aa26.86■■□□□ 1.89
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PTPRU-206ENST00000465525 MAP3K1Q13233 1512 aa26.84■■□□□ 1.89
PTPRU-206ENST00000465525 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
PTPRU-206ENST00000465525 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.8■■□□□ 1.88
PTPRU-206ENST00000465525 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.78■■□□□ 1.88
PTPRU-206ENST00000465525 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PTPRU-206ENST00000465525 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.74■■□□□ 1.87
PTPRU-206ENST00000465525 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRU-206ENST00000465525 MAPKBP1O60336 1514 aa26.7■■□□□ 1.87
PTPRU-206ENST00000465525 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.7■■□□□ 1.87
PTPRU-206ENST00000465525 ASXL2Q76L83 1435 aa26.7■■□□□ 1.86
PTPRU-206ENST00000465525 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
PTPRU-206ENST00000465525 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.64■■□□□ 1.86
PTPRU-206ENST00000465525 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
PTPRU-206ENST00000465525 KIF14Q15058 1648 aa26.63■■□□□ 1.85
PTPRU-206ENST00000465525 KCNH8Q96L42 1107 aa26.6■■□□□ 1.85
PTPRU-206ENST00000465525 NCOA2Q15596 1464 aa26.58■■□□□ 1.85
PTPRU-206ENST00000465525 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRU-206ENST00000465525 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.53■■□□□ 1.84
PTPRU-206ENST00000465525 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRU-206ENST00000465525 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRU-206ENST00000465525 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.83
PTPRU-206ENST00000465525 DIP2BQ9P265 1576 aa26.46■■□□□ 1.83
PTPRU-206ENST00000465525 GLI2P10070 1586 aa26.45■■□□□ 1.83
PTPRU-206ENST00000465525 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.44■■□□□ 1.82
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PTPRU-206ENST00000465525 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.43■■□□□ 1.82
PTPRU-206ENST00000465525 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.41■■□□□ 1.82
PTPRU-206ENST00000465525 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRU-206ENST00000465525 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.39■■□□□ 1.82
PTPRU-206ENST00000465525 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRU-206ENST00000465525 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PTPRU-206ENST00000465525 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.38■■□□□ 1.81
PTPRU-206ENST00000465525 CD109Q6YHK3 1445 aa26.37■■□□□ 1.81
PTPRU-206ENST00000465525 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.36■■□□□ 1.81
PTPRU-206ENST00000465525 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRU-206ENST00000465525 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PTPRU-206ENST00000465525 PREX2Q70Z35 1606 aa26.35■■□□□ 1.81
PTPRU-206ENST00000465525 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.33■■□□□ 1.8
PTPRU-206ENST00000465525 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
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