RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465282.5

USP39-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 4

Gene USP39, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-211ENST00000465282 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
USP39-211ENST00000465282 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.06■■■□□ 2.08
USP39-211ENST00000465282 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.06■■■□□ 2.08
USP39-211ENST00000465282 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.06■■■□□ 2.08
USP39-211ENST00000465282 KIF21BO75037 1637 aa28.02■■■□□ 2.08
USP39-211ENST00000465282 JPH4Q96JJ6 628 aa28.01■■■□□ 2.07
USP39-211ENST00000465282 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.99■■■□□ 2.07
USP39-211ENST00000465282 IQGAP2Q13576 1575 aa27.99■■■□□ 2.07
USP39-211ENST00000465282 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
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USP39-211ENST00000465282 GOLGA3Q08378 1498 aa27.84■■■□□ 2.05
USP39-211ENST00000465282 ARAP1Q96P48 1450 aa27.84■■■□□ 2.05
USP39-211ENST00000465282 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.84■■■□□ 2.05
USP39-211ENST00000465282 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.82■■■□□ 2.04
USP39-211ENST00000465282 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.78■■■□□ 2.04
USP39-211ENST00000465282 DISP1Q96F81 1524 aa27.73■■■□□ 2.03
USP39-211ENST00000465282 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
USP39-211ENST00000465282 KIAA0556O60303 1618 aa27.69■■■□□ 2.02
USP39-211ENST00000465282 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.68■■■□□ 2.02
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USP39-211ENST00000465282 SAMD9Q5K651 1589 aa27.61■■■□□ 2.01
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USP39-211ENST00000465282 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.57■■■□□ 2
USP39-211ENST00000465282 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.46■■□□□ 1.99
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USP39-211ENST00000465282 UACAQ9BZF9 1416 aa27.46■■□□□ 1.99
USP39-211ENST00000465282 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.45■■□□□ 1.99
USP39-211ENST00000465282 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
USP39-211ENST00000465282 P3H3Q8IVL6 736 aa27.44■■□□□ 1.98
USP39-211ENST00000465282 ABCC2Q92887 1545 aa27.41■■□□□ 1.98
USP39-211ENST00000465282 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.4■■□□□ 1.98
USP39-211ENST00000465282 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.39■■□□□ 1.98
USP39-211ENST00000465282 ABCA8O94911 1581 aa27.39■■□□□ 1.97
USP39-211ENST00000465282 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.37■■□□□ 1.97
USP39-211ENST00000465282 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.35■■□□□ 1.97
USP39-211ENST00000465282 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.35■■□□□ 1.97
USP39-211ENST00000465282 CLIP1P30622 1438 aa27.33■■□□□ 1.96
USP39-211ENST00000465282 FMN1Q68DA7 1419 aa27.31■■□□□ 1.96
USP39-211ENST00000465282 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.31■■□□□ 1.96
USP39-211ENST00000465282 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.3■■□□□ 1.96
USP39-211ENST00000465282 MAPKBP1O60336 1514 aa27.29■■□□□ 1.96
USP39-211ENST00000465282 CEP162Q5TB80 1403 aa27.25■■□□□ 1.95
USP39-211ENST00000465282 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
USP39-211ENST00000465282 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
USP39-211ENST00000465282 ATP10BO94823 1461 aa27.14■■□□□ 1.94
USP39-211ENST00000465282 HECW1Q76N89 1606 aa27.13■■□□□ 1.93
USP39-211ENST00000465282 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
USP39-211ENST00000465282 ASXL2Q76L83 1435 aa27.13■■□□□ 1.93
USP39-211ENST00000465282 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.1■■□□□ 1.93
USP39-211ENST00000465282 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.09■■□□□ 1.93
USP39-211ENST00000465282 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.08■■□□□ 1.93
USP39-211ENST00000465282 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.06■■□□□ 1.92
USP39-211ENST00000465282 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.06■■□□□ 1.92
USP39-211ENST00000465282 DIP2BQ9P265 1576 aa27.05■■□□□ 1.92
USP39-211ENST00000465282 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
USP39-211ENST00000465282 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
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USP39-211ENST00000465282 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
USP39-211ENST00000465282 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
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USP39-211ENST00000465282 GLI2P10070 1586 aa27.01■■□□□ 1.91
USP39-211ENST00000465282 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27■■□□□ 1.91
USP39-211ENST00000465282 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.99■■□□□ 1.91
USP39-211ENST00000465282 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.97■■□□□ 1.91
USP39-211ENST00000465282 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.97■■□□□ 1.91
USP39-211ENST00000465282 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
USP39-211ENST00000465282 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
USP39-211ENST00000465282 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.94■■□□□ 1.9
USP39-211ENST00000465282 KCNH8Q96L42 1107 aa26.89■■□□□ 1.9
USP39-211ENST00000465282 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.88■■□□□ 1.89
USP39-211ENST00000465282 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.87■■□□□ 1.89
USP39-211ENST00000465282 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.83■■□□□ 1.89
USP39-211ENST00000465282 TSPOAP1O95153 1857 aa26.83■■□□□ 1.88
USP39-211ENST00000465282 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
USP39-211ENST00000465282 CD109Q6YHK3 1445 aa26.78■■□□□ 1.88
USP39-211ENST00000465282 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
USP39-211ENST00000465282 KIF14Q15058 1648 aa26.76■■□□□ 1.87
USP39-211ENST00000465282 MAP3K1Q13233 1512 aa26.75■■□□□ 1.87
USP39-211ENST00000465282 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.75■■□□□ 1.87
USP39-211ENST00000465282 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.75■■□□□ 1.87
USP39-211ENST00000465282 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
USP39-211ENST00000465282 TIAM1Q13009 1591 aa26.71■■□□□ 1.87
USP39-211ENST00000465282 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.7■■□□□ 1.86
USP39-211ENST00000465282 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.67■■□□□ 1.86
USP39-211ENST00000465282 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.66■■□□□ 1.86
USP39-211ENST00000465282 APLP2Q06481 763 aa26.66■■□□□ 1.86
USP39-211ENST00000465282 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.65■■□□□ 1.86
USP39-211ENST00000465282 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.64■■□□□ 1.86
USP39-211ENST00000465282 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.62■■□□□ 1.85
USP39-211ENST00000465282 PLCH2O75038 1416 aa26.61■■□□□ 1.85
USP39-211ENST00000465282 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.61■■□□□ 1.85
USP39-211ENST00000465282 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.6■■□□□ 1.85
USP39-211ENST00000465282 NEO1Q92859 1461 aa26.6■■□□□ 1.85
USP39-211ENST00000465282 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
USP39-211ENST00000465282 KDM6BO15054 1643 aa26.57■■□□□ 1.84
USP39-211ENST00000465282 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.54■■□□□ 1.84
USP39-211ENST00000465282 FANCAO15360 1455 aa26.54■■□□□ 1.84
USP39-211ENST00000465282 PREX2Q70Z35 1606 aa26.54■■□□□ 1.84
USP39-211ENST00000465282 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.53■■□□□ 1.84
USP39-211ENST00000465282 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.52■■□□□ 1.84
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