RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 CUL7Q14999 1698 aa22.67■■□□□ 1.22
C9orf3-210ENST00000462125 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
C9orf3-210ENST00000462125 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.64■■□□□ 1.21
C9orf3-210ENST00000462125 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.62■■□□□ 1.21
C9orf3-210ENST00000462125 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
C9orf3-210ENST00000462125 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.49■■□□□ 1.19
C9orf3-210ENST00000462125 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.4■■□□□ 1.18
C9orf3-210ENST00000462125 IQGAP2Q13576 1575 aa22.39■■□□□ 1.18
C9orf3-210ENST00000462125 PTPRGP23470 1445 aa22.39■■□□□ 1.17
C9orf3-210ENST00000462125 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
C9orf3-210ENST00000462125 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.37■■□□□ 1.17
C9orf3-210ENST00000462125 PRXQ9BXM0 1461 aa22.36■■□□□ 1.17
C9orf3-210ENST00000462125 DISP1Q96F81 1524 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf3-210ENST00000462125 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf3-210ENST00000462125 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf3-210ENST00000462125 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf3-210ENST00000462125 MAPKBP1O60336 1514 aa22.26■■□□□ 1.15
C9orf3-210ENST00000462125 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
C9orf3-210ENST00000462125 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.23■■□□□ 1.15
C9orf3-210ENST00000462125 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.22■■□□□ 1.15
C9orf3-210ENST00000462125 EEA1Q15075 1411 aa22.22■■□□□ 1.15
C9orf3-210ENST00000462125 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.22■■□□□ 1.15
C9orf3-210ENST00000462125 UACAQ9BZF9 1416 aa22.21■■□□□ 1.15
C9orf3-210ENST00000462125 ABCC2Q92887 1545 aa22.19■■□□□ 1.14
C9orf3-210ENST00000462125 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.18■■□□□ 1.14
C9orf3-210ENST00000462125 KIAA0556O60303 1618 aa22.17■■□□□ 1.14
C9orf3-210ENST00000462125 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.17■■□□□ 1.14
C9orf3-210ENST00000462125 GOLGA3Q08378 1498 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-210ENST00000462125 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-210ENST00000462125 DIP2BQ9P265 1576 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-210ENST00000462125 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.11■■□□□ 1.13
C9orf3-210ENST00000462125 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.09■■□□□ 1.13
C9orf3-210ENST00000462125 ASXL2Q76L83 1435 aa22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-210ENST00000462125 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
C9orf3-210ENST00000462125 P3H3Q8IVL6 736 aa22■■□□□ 1.11
C9orf3-210ENST00000462125 ABCA8O94911 1581 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf3-210ENST00000462125 GLI2P10070 1586 aa21.99■■□□□ 1.11
C9orf3-210ENST00000462125 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
C9orf3-210ENST00000462125 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
C9orf3-210ENST00000462125 KIF21BO75037 1637 aa21.95■■□□□ 1.1
C9orf3-210ENST00000462125 SAMD9Q5K651 1589 aa21.94■■□□□ 1.1
C9orf3-210ENST00000462125 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.9■■□□□ 1.1
C9orf3-210ENST00000462125 TSPOAP1O95153 1857 aa21.88■■□□□ 1.09
C9orf3-210ENST00000462125 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
C9orf3-210ENST00000462125 ATP10BO94823 1461 aa21.86■■□□□ 1.09
C9orf3-210ENST00000462125 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
C9orf3-210ENST00000462125 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
C9orf3-210ENST00000462125 KCNH8Q96L42 1107 aa21.84■■□□□ 1.09
C9orf3-210ENST00000462125 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
C9orf3-210ENST00000462125 KDM6BO15054 1643 aa21.83■■□□□ 1.08
C9orf3-210ENST00000462125 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.83■■□□□ 1.08
C9orf3-210ENST00000462125 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.81■■□□□ 1.08
C9orf3-210ENST00000462125 ARID3CA6NKF2 412 aa21.8■■□□□ 1.08
C9orf3-210ENST00000462125 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.79■■□□□ 1.08
C9orf3-210ENST00000462125 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.78■■□□□ 1.08
C9orf3-210ENST00000462125 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.77■■□□□ 1.08
C9orf3-210ENST00000462125 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.77■■□□□ 1.08
C9orf3-210ENST00000462125 CD109Q6YHK3 1445 aa21.77■■□□□ 1.08
C9orf3-210ENST00000462125 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
C9orf3-210ENST00000462125 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
C9orf3-210ENST00000462125 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.75■■□□□ 1.07
C9orf3-210ENST00000462125 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
C9orf3-210ENST00000462125 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
C9orf3-210ENST00000462125 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.7■■□□□ 1.06
C9orf3-210ENST00000462125 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.7■■□□□ 1.06
C9orf3-210ENST00000462125 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.68■■□□□ 1.06
C9orf3-210ENST00000462125 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.67■■□□□ 1.06
C9orf3-210ENST00000462125 FMN1Q68DA7 1419 aa21.63■■□□□ 1.05
C9orf3-210ENST00000462125 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.62■■□□□ 1.05
C9orf3-210ENST00000462125 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.61■■□□□ 1.05
C9orf3-210ENST00000462125 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.58■■□□□ 1.04
C9orf3-210ENST00000462125 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
C9orf3-210ENST00000462125 NEO1Q92859 1461 aa21.52■■□□□ 1.04
C9orf3-210ENST00000462125 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
C9orf3-210ENST00000462125 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
C9orf3-210ENST00000462125 HECW1Q76N89 1606 aa21.48■■□□□ 1.03
C9orf3-210ENST00000462125 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
C9orf3-210ENST00000462125 RAPGEF3O95398 923 aa21.46■■□□□ 1.03
C9orf3-210ENST00000462125 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.44■■□□□ 1.02
C9orf3-210ENST00000462125 CLIP1P30622 1438 aa21.43■■□□□ 1.02
C9orf3-210ENST00000462125 AKNAQ7Z591 1439 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf3-210ENST00000462125 FANCAO15360 1455 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-210ENST00000462125 ADGRL1O94910 1474 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-210ENST00000462125 PLCH2O75038 1416 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf3-210ENST00000462125 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-210ENST00000462125 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.4■■□□□ 1.02
C9orf3-210ENST00000462125 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
C9orf3-210ENST00000462125 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.35■■□□□ 1.01
C9orf3-210ENST00000462125 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.35■■□□□ 1.01
C9orf3-210ENST00000462125 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.34■■□□□ 1.01
C9orf3-210ENST00000462125 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
C9orf3-210ENST00000462125 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.33■■□□□ 1.01
C9orf3-210ENST00000462125 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.32■■□□□ 1
C9orf3-210ENST00000462125 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa21.32■■□□□ 1
C9orf3-210ENST00000462125 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.32■■□□□ 1
C9orf3-210ENST00000462125 KIF14Q15058 1648 aa21.29■■□□□ 1
C9orf3-210ENST00000462125 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.29■■□□□ 1
C9orf3-210ENST00000462125 RICTORQ6R327 1708 aa21.27■■□□□ 1
C9orf3-210ENST00000462125 CEP162Q5TB80 1403 aa21.25■□□□□ 0.99
C9orf3-210ENST00000462125 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.24■□□□□ 0.99
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